RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000188376.9

SLC25A3-201, Transcript of solute carrier family 25 member 3, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A3, Length 1,909 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A3-201ENST00000188376 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.36■■■■■ 4.53
SLC25A3-201ENST00000188376 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.72■■■■□ 3.63
SLC25A3-201ENST00000188376 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.44■■■■□ 3.42
SLC25A3-201ENST00000188376 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.93■■■■□ 3.34
SLC25A3-201ENST00000188376 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.78■■■■□ 3.32
SLC25A3-201ENST00000188376 ABCC9O60706 1549 aa35.69■■■■□ 3.3
SLC25A3-201ENST00000188376 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.6■■■■□ 3.29
SLC25A3-201ENST00000188376 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.29■■■■□ 3.24
SLC25A3-201ENST00000188376 NACADO15069 1562 aa35.11■■■■□ 3.21
SLC25A3-201ENST00000188376 SCRIBQ14160 1630 aa34.81■■■■□ 3.16
SLC25A3-201ENST00000188376 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.8■■■■□ 3.16
SLC25A3-201ENST00000188376 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.29■■■■□ 3.08
SLC25A3-201ENST00000188376 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.19■■■■□ 3.06
SLC25A3-201ENST00000188376 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.78■■■■□ 3
SLC25A3-201ENST00000188376 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.74■■■□□ 2.99
SLC25A3-201ENST00000188376 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.71■■■□□ 2.99
SLC25A3-201ENST00000188376 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.7■■■□□ 2.99
SLC25A3-201ENST00000188376 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.55■■■□□ 2.96
SLC25A3-201ENST00000188376 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.46■■■□□ 2.95
SLC25A3-201ENST00000188376 SMARCA4P51532 1647 aa33.33■■■□□ 2.93
SLC25A3-201ENST00000188376 WIZO95785 1651 aa33.31■■■□□ 2.92
SLC25A3-201ENST00000188376 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.89■■■□□ 2.86
SLC25A3-201ENST00000188376 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.86■■■□□ 2.85
SLC25A3-201ENST00000188376 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.82■■■□□ 2.84
SLC25A3-201ENST00000188376 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.77■■■□□ 2.84
SLC25A3-201ENST00000188376 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.74■■■□□ 2.83
SLC25A3-201ENST00000188376 SMARCA2P51531 1590 aa32.71■■■□□ 2.83
SLC25A3-201ENST00000188376 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.59■■■□□ 2.81
SLC25A3-201ENST00000188376 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.58■■■□□ 2.81
SLC25A3-201ENST00000188376 NCAPD3P42695 1498 aa32.41■■■□□ 2.78
SLC25A3-201ENST00000188376 HMGXB3Q12766 1538 aa32.37■■■□□ 2.77
SLC25A3-201ENST00000188376 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.27■■■□□ 2.76
SLC25A3-201ENST00000188376 TRIM41Q8WV44 630 aa32.18■■■□□ 2.74
SLC25A3-201ENST00000188376 ABCC8Q09428 1581 aa32■■■□□ 2.71
SLC25A3-201ENST00000188376 CFTRP13569 1480 aa31.74■■■□□ 2.67
SLC25A3-201ENST00000188376 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.73■■■□□ 2.67
SLC25A3-201ENST00000188376 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.67■■■□□ 2.66
SLC25A3-201ENST00000188376 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.63■■■□□ 2.65
SLC25A3-201ENST00000188376 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.62■■■□□ 2.65
SLC25A3-201ENST00000188376 SYNJ1O43426 1573 aa31.61■■■□□ 2.65
SLC25A3-201ENST00000188376 PRDM2Q13029 1718 aa31.6■■■□□ 2.65
SLC25A3-201ENST00000188376 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.51■■■□□ 2.63
SLC25A3-201ENST00000188376 TOP2BQ02880 1626 aa31.44■■■□□ 2.62
SLC25A3-201ENST00000188376 SOGA1O94964 1423 aa31.41■■■□□ 2.62
SLC25A3-201ENST00000188376 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.4■■■□□ 2.62
SLC25A3-201ENST00000188376 NESP48681 1621 aa31.38■■■□□ 2.61
SLC25A3-201ENST00000188376 CUX1P39880 1505 aa31.35■■■□□ 2.61
SLC25A3-201ENST00000188376 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.3■■■□□ 2.6
SLC25A3-201ENST00000188376 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.3■■■□□ 2.6
SLC25A3-201ENST00000188376 EHMT2Q96KQ7 1210 aa31.3■■■□□ 2.6
SLC25A3-201ENST00000188376 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.29■■■□□ 2.6
SLC25A3-201ENST00000188376 EEA1Q15075 1411 aa31.26■■■□□ 2.59
SLC25A3-201ENST00000188376 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31.15■■■□□ 2.58
SLC25A3-201ENST00000188376 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.07■■■□□ 2.56
SLC25A3-201ENST00000188376 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.07■■■□□ 2.56
SLC25A3-201ENST00000188376 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.01■■■□□ 2.55
SLC25A3-201ENST00000188376 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31■■■□□ 2.55
SLC25A3-201ENST00000188376 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.99■■■□□ 2.55
SLC25A3-201ENST00000188376 TOPBP1Q92547 1522 aa30.96■■■□□ 2.55
SLC25A3-201ENST00000188376 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
SLC25A3-201ENST00000188376 KIF27Q86VH2 1401 aa30.9■■■□□ 2.54
SLC25A3-201ENST00000188376 KIF21BO75037 1637 aa30.89■■■□□ 2.54
SLC25A3-201ENST00000188376 GOLGA3Q08378 1498 aa30.89■■■□□ 2.54
SLC25A3-201ENST00000188376 CUX2O14529 1486 aa30.83■■■□□ 2.53
SLC25A3-201ENST00000188376 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
SLC25A3-201ENST00000188376 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
SLC25A3-201ENST00000188376 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.8■■■□□ 2.52
SLC25A3-201ENST00000188376 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.76■■■□□ 2.52
SLC25A3-201ENST00000188376 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.75■■■□□ 2.51
SLC25A3-201ENST00000188376 PRXQ9BXM0 1461 aa30.71■■■□□ 2.51
SLC25A3-201ENST00000188376 CEP162Q5TB80 1403 aa30.69■■■□□ 2.5
SLC25A3-201ENST00000188376 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.68■■■□□ 2.5
SLC25A3-201ENST00000188376 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.66■■■□□ 2.5
SLC25A3-201ENST00000188376 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.65■■■□□ 2.5
SLC25A3-201ENST00000188376 IGF1RP08069 1367 aa30.62■■■□□ 2.49
SLC25A3-201ENST00000188376 WDR97A6NE52 1622 aa30.59■■■□□ 2.49
SLC25A3-201ENST00000188376 ERCC6Q03468 1493 aa30.57■■■□□ 2.48
SLC25A3-201ENST00000188376 WDR62O43379 1518 aa30.5■■■□□ 2.47
SLC25A3-201ENST00000188376 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
SLC25A3-201ENST00000188376 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.48■■■□□ 2.47
SLC25A3-201ENST00000188376 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
SLC25A3-201ENST00000188376 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.44■■■□□ 2.46
SLC25A3-201ENST00000188376 CLIP1P30622 1438 aa30.42■■■□□ 2.46
SLC25A3-201ENST00000188376 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
SLC25A3-201ENST00000188376 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.39■■■□□ 2.46
SLC25A3-201ENST00000188376 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
SLC25A3-201ENST00000188376 CUL7Q14999 1698 aa30.35■■■□□ 2.45
SLC25A3-201ENST00000188376 PCGF6Q9BYE7 350 aa30.3■■■□□ 2.44
SLC25A3-201ENST00000188376 IFT140Q96RY7 1462 aa30.3■■■□□ 2.44
SLC25A3-201ENST00000188376 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.24■■■□□ 2.439e-10■■■■■ 45.4
SLC25A3-201ENST00000188376 PBRM1Q86U86 1689 aa30.22■■■□□ 2.43
SLC25A3-201ENST00000188376 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.43
SLC25A3-201ENST00000188376 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.43
SLC25A3-201ENST00000188376 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.42
SLC25A3-201ENST00000188376 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.15■■■□□ 2.42
SLC25A3-201ENST00000188376 GRIN2BQ13224 1484 aa30.11■■■□□ 2.41
SLC25A3-201ENST00000188376 ARAP1Q96P48 1450 aa30.11■■■□□ 2.41
SLC25A3-201ENST00000188376 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa30.08■■■□□ 2.41
SLC25A3-201ENST00000188376 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
SLC25A3-201ENST00000188376 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.07■■■□□ 2.4
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