RNA–Protein interactions for RNA: YGL229C

SAP4, Transcript of Protein required for function of the Sit4p protein phosphatase, yeast

Gene SAP4, Length 2,457 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SAP4	YGL229C	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	ECM7	Q06200	448 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	HIF1	Q12373	385 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	SNA3	P14359	133 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	AFT1	P22149	690 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	YEL1	P34225	687 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	RPC25	P35718	212 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	MSC7	P38694	644 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	RTT107	P38850	1070 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	CTR1	P49573	406 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	ATG1	P53104	897 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	RTT102	P53330	157 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	TIM8	P57744	87 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	IES4	Q08561	116 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	YLL058W	Q12198	575 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	LAA1	P39526	2014 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	MTF2	P10849	440 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	POX1	P13711	748 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	CKI1	P20485	582 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	KIN82	P25341	720 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	YUR1	P26725	428 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	GUA1	P38625	525 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	EFM4	P40516	257 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	VTC3	Q02725	835 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	UME1	Q03010	460 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	VPS60	Q03390	229 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	OSW2	Q12202	724 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	SPO12	P17123	173 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	DPB3	P27344	201 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	KIP1	P28742	1111 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	SRB4	P32569	687 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	RAD54	P32863	898 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	GPT2	P36148	743 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	PCH2	P38126	564 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	IES1	P43579	692 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	SML1	Q04964	104 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	SVF1	Q05515	481 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	CHS2	P14180	963 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	TUP1	P16649	713 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	IRE1	P32361	1115 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	EAF5	P39995	279 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	CUL3	P53202	744 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	ERV41	Q04651	352 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	VAC14	Q06708	880 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	MLH2	Q07980	695 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	GIS3	Q12418	502 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	RAD57	P25301	460 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	BUD2	P33314	1104 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	NIP100	P33420	868 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	TCD1	P38756	429 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	FTR1	P40088	404 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	YGR021W	P53212	290 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	YNL146W	P53906	100 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	BOP3	P53958	396 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	YDL206W	Q12424	762 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
SAP4	YGL229C	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	SGM1	P47166	707 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	GPI13	Q07830	1017 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	LDB19	Q12502	818 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	SMC1	P32908	1225 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	NDC80	P40460	691 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	OSW7	P43611	510 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	AVT1	P47082	602 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	NGL3	Q03210	505 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	MCM16	Q12262	181 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SAP4	YGL229C	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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