Protein–RNA interactions for Protein: P27344

DPB3, DNA polymerase epsilon subunit C, yeastyeast

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DPB3P27344 NSR1YGR159C 1245 nt21.46■■□□□ 1.03
DPB3P27344 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.17■□□□□ 0.98
DPB3P27344 NOP1YDL014W 984 nt20.33■□□□□ 0.85
DPB3P27344 MDJ1YFL016C 1536 nt19.61■□□□□ 0.73
DPB3P27344 YKL036CYKL036C 393 nt18.25■□□□□ 0.51
DPB3P27344 YJL027CYJL027C 417 nt18.04■□□□□ 0.48
DPB3P27344 SRX1YKL086W 384 nt17.75■□□□□ 0.43
DPB3P27344 Q0297Q0297 156 nt17.59■□□□□ 0.41
DPB3P27344 DBP2YNL112W 1641 nt17.1■□□□□ 0.33
DPB3P27344 YCR051WYCR051W 669 nt16.84■□□□□ 0.29
DPB3P27344 YBR190WYBR190W 312 nt16.83■□□□□ 0.28
DPB3P27344 RTC3YHR087W 336 nt16.47■□□□□ 0.23
DPB3P27344 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.37■□□□□ 0.21
DPB3P27344 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.37■□□□□ 0.21
DPB3P27344 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.37■□□□□ 0.21
DPB3P27344 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.37■□□□□ 0.21
DPB3P27344 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.37■□□□□ 0.21
DPB3P27344 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.37■□□□□ 0.21
DPB3P27344 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.37■□□□□ 0.21
DPB3P27344 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.37■□□□□ 0.21
DPB3P27344 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.37■□□□□ 0.21
DPB3P27344 SCS3YGL126W 1143 nt16.34■□□□□ 0.21
DPB3P27344 CCC1YLR220W 969 nt16.25■□□□□ 0.19
DPB3P27344 RVS167YDR388W 1449 nt15.96■□□□□ 0.15
DPB3P27344 SSA3YBL075C 1950 nt15.95■□□□□ 0.14
DPB3P27344 YOL085CYOL085C 342 nt15.83■□□□□ 0.12
DPB3P27344 RPP1BYDL130W 321 nt15.8■□□□□ 0.12
DPB3P27344 SCJ1YMR214W 1134 nt15.78■□□□□ 0.12
DPB3P27344 PUT4YOR348C 1884 nt15.69■□□□□ 0.1
DPB3P27344 PKP1YIL042C 1185 nt15.69■□□□□ 0.1
DPB3P27344 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.32■□□□□ 0.04
DPB3P27344 SHR5YOL110W 714 nt15.27■□□□□ 0.04
DPB3P27344 ARE1YCR048W 1833 nt15.24■□□□□ 0.03
DPB3P27344 URN1YPR152C 1398 nt15.21■□□□□ 0.02
DPB3P27344 PET122YER153C 765 nt15.19■□□□□ 0.02
DPB3P27344 POA1YBR022W 534 nt15.19■□□□□ 0.02
DPB3P27344 SAH1YER043C 1350 nt15.13■□□□□ 0.01
DPB3P27344 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.09■□□□□ 0.01
DPB3P27344 DEP1YAL013W 1218 nt15.07■□□□□ 0
DPB3P27344 OPI9YLR338W 858 nt15.07■□□□□ 0
DPB3P27344 BSC6YOL137W 1494 nt14.96□□□□□ -0.01
DPB3P27344 SCR1SCR1 522 nt14.86□□□□□ -0.03
DPB3P27344 RPN10YHR200W 807 nt14.84□□□□□ -0.03
DPB3P27344 Q0182Q0182 405 nt14.81□□□□□ -0.04
DPB3P27344 YDJ1YNL064C 1230 nt14.81□□□□□ -0.04
DPB3P27344 YNL208WYNL208W 600 nt14.74□□□□□ -0.05
DPB3P27344 BUD23YCR047C 828 nt14.71□□□□□ -0.05
DPB3P27344 RRN5YLR141W 1092 nt14.69□□□□□ -0.06
DPB3P27344 PUN1YLR414C 792 nt14.63□□□□□ -0.07
DPB3P27344 GAR1YHR089C 618 nt14.6□□□□□ -0.07
DPB3P27344 SPT5YML010W 3192 nt14.58□□□□□ -0.08
DPB3P27344 PTC2YER089C 1395 nt14.57□□□□□ -0.08
DPB3P27344 YJR018WYJR018W 363 nt14.46□□□□□ -0.09
DPB3P27344 ATS1YAL020C 1002 nt14.45□□□□□ -0.1
DPB3P27344 NAB2YGL122C 1578 nt14.43□□□□□ -0.1
DPB3P27344 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.39□□□□□ -0.11
DPB3P27344 SSA4YER103W 1929 nt14.37□□□□□ -0.11
DPB3P27344 RSB1YOR049C 1065 nt14.24□□□□□ -0.13
DPB3P27344 FIS1YIL065C 468 nt14.18□□□□□ -0.14
DPB3P27344 FPR4YLR449W 1179 nt14.15□□□□□ -0.14
DPB3P27344 DAL1YIR027C 1383 nt14.14□□□□□ -0.15
DPB3P27344 TIR1YER011W 765 nt14.12□□□□□ -0.15
DPB3P27344 YJR120WYJR120W 351 nt14.12□□□□□ -0.15
DPB3P27344 MEP2YNL142W 1500 nt14.09□□□□□ -0.15
DPB3P27344 SSA1YAL005C 1929 nt14.06□□□□□ -0.16
DPB3P27344 RPP2BYDR382W 333 nt14.03□□□□□ -0.16
DPB3P27344 PHO4YFR034C 939 nt14.02□□□□□ -0.17
DPB3P27344 INM2YDR287W 879 nt14□□□□□ -0.17
DPB3P27344 YPS1YLR120C 1710 nt13.92□□□□□ -0.18
DPB3P27344 DCW1YKL046C 1350 nt13.87□□□□□ -0.19
DPB3P27344 MOT3YMR070W 1473 nt13.86□□□□□ -0.19
DPB3P27344 BDF1YLR399C 2061 nt13.84□□□□□ -0.19
DPB3P27344 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.83□□□□□ -0.2
DPB3P27344 YBL100CYBL100C 315 nt13.8□□□□□ -0.2
DPB3P27344 YDR095CYDR095C 411 nt13.75□□□□□ -0.21
DPB3P27344 SRB2YHR041C 633 nt13.74□□□□□ -0.21
DPB3P27344 EMI2YDR516C 1503 nt13.67□□□□□ -0.22
DPB3P27344 TAT1YBR069C 1860 nt13.65□□□□□ -0.22
DPB3P27344 BDH2YAL061W 1254 nt13.64□□□□□ -0.23
DPB3P27344 FUN26YAL022C 1554 nt13.62□□□□□ -0.23
DPB3P27344 YMR090WYMR090W 684 nt13.61□□□□□ -0.23
DPB3P27344 YBR220CYBR220C 1683 nt13.57□□□□□ -0.24
DPB3P27344 ALF1YNL148C 765 nt13.54□□□□□ -0.24
DPB3P27344 YDL221WYDL221W 552 nt13.51□□□□□ -0.25
DPB3P27344 CAC2YML102W 1407 nt13.5□□□□□ -0.25
DPB3P27344 PTP1YDL230W 1008 nt13.5□□□□□ -0.25
DPB3P27344 RPP2AYOL039W 321 nt13.5□□□□□ -0.25
DPB3P27344 TRM9YML014W 840 nt13.49□□□□□ -0.25
DPB3P27344 PST2YDR032C 597 nt13.46□□□□□ -0.25
DPB3P27344 SDH1YKL148C 1923 nt13.44□□□□□ -0.26
DPB3P27344 WWM1YFL010C 636 nt13.42□□□□□ -0.26
DPB3P27344 CCT6YDR188W 1641 nt13.35□□□□□ -0.27
DPB3P27344 LSM3YLR438C-A 270 nt13.35□□□□□ -0.27
DPB3P27344 SIS1YNL007C 1059 nt13.32□□□□□ -0.28
DPB3P27344 IRC15YPL017C 1500 nt13.3□□□□□ -0.28
DPB3P27344 SCC4YER147C 1875 nt13.29□□□□□ -0.28
DPB3P27344 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.29□□□□□ -0.28
DPB3P27344 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.29□□□□□ -0.28
DPB3P27344 GIS3YLR094C 1509 nt13.22□□□□□ -0.29
DPB3P27344 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.19□□□□□ -0.3
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