Protein–RNA interactions for Protein: Q12373

HIF1, HAT1-interacting factor 1, yeastyeast

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HIF1Q12373 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.5■■□□□ 1.19
HIF1Q12373 NSR1YGR159C 1245 nt22.15■■□□□ 1.14
HIF1Q12373 NOP1YDL014W 984 nt22.03■■□□□ 1.12
HIF1Q12373 YKL036CYKL036C 393 nt20.52■□□□□ 0.88
HIF1Q12373 MDJ1YFL016C 1536 nt19.39■□□□□ 0.69
HIF1Q12373 Q0297Q0297 156 nt19.3■□□□□ 0.68
HIF1Q12373 YJL027CYJL027C 417 nt19.21■□□□□ 0.67
HIF1Q12373 SRX1YKL086W 384 nt19.2■□□□□ 0.66
HIF1Q12373 SCS3YGL126W 1143 nt18.76■□□□□ 0.59
HIF1Q12373 YCR051WYCR051W 669 nt18.26■□□□□ 0.51
HIF1Q12373 YOL085CYOL085C 342 nt17.73■□□□□ 0.43
HIF1Q12373 PKP1YIL042C 1185 nt17.42■□□□□ 0.38
HIF1Q12373 RPP1BYDL130W 321 nt17.33■□□□□ 0.36
HIF1Q12373 DBP2YNL112W 1641 nt17.21■□□□□ 0.35
HIF1Q12373 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.19■□□□□ 0.34
HIF1Q12373 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.19■□□□□ 0.34
HIF1Q12373 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.19■□□□□ 0.34
HIF1Q12373 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.19■□□□□ 0.34
HIF1Q12373 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.19■□□□□ 0.34
HIF1Q12373 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.19■□□□□ 0.34
HIF1Q12373 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.19■□□□□ 0.34
HIF1Q12373 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.19■□□□□ 0.34
HIF1Q12373 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.19■□□□□ 0.34
HIF1Q12373 CCC1YLR220W 969 nt17.05■□□□□ 0.32
HIF1Q12373 SCJ1YMR214W 1134 nt16.97■□□□□ 0.31
HIF1Q12373 ATS1YAL020C 1002 nt16.85■□□□□ 0.29
HIF1Q12373 YBR190WYBR190W 312 nt16.51■□□□□ 0.23
HIF1Q12373 PET122YER153C 765 nt16.5■□□□□ 0.23
HIF1Q12373 SCR1SCR1 522 nt16.48■□□□□ 0.23
HIF1Q12373 RVS167YDR388W 1449 nt16.38■□□□□ 0.21
HIF1Q12373 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.36■□□□□ 0.21
HIF1Q12373 RTC3YHR087W 336 nt16.19■□□□□ 0.18
HIF1Q12373 RRN5YLR141W 1092 nt16.06■□□□□ 0.16
HIF1Q12373 YDJ1YNL064C 1230 nt15.84■□□□□ 0.13
HIF1Q12373 RSB1YOR049C 1065 nt15.84■□□□□ 0.13
HIF1Q12373 SHR5YOL110W 714 nt15.82■□□□□ 0.12
HIF1Q12373 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.74■□□□□ 0.11
HIF1Q12373 PST2YDR032C 597 nt15.55■□□□□ 0.08
HIF1Q12373 GAR1YHR089C 618 nt15.44■□□□□ 0.06
HIF1Q12373 SSA3YBL075C 1950 nt15.44■□□□□ 0.06
HIF1Q12373 DEP1YAL013W 1218 nt15.26■□□□□ 0.03
HIF1Q12373 URN1YPR152C 1398 nt15.22■□□□□ 0.03
HIF1Q12373 RPN10YHR200W 807 nt15.12■□□□□ 0.01
HIF1Q12373 YKL097CYKL097C 411 nt15.12■□□□□ 0.01
HIF1Q12373 YNL208WYNL208W 600 nt15.09■□□□□ 0.01
HIF1Q12373 PUT4YOR348C 1884 nt15.08■□□□□ 0
HIF1Q12373 OPI9YLR338W 858 nt14.93□□□□□ -0.02
HIF1Q12373 TIR1YER011W 765 nt14.91□□□□□ -0.02
HIF1Q12373 SHU1YHL006C 453 nt14.85□□□□□ -0.03
HIF1Q12373 SAH1YER043C 1350 nt14.75□□□□□ -0.05
HIF1Q12373 ARE1YCR048W 1833 nt14.71□□□□□ -0.06
HIF1Q12373 SSA1YAL005C 1929 nt14.63□□□□□ -0.07
HIF1Q12373 POA1YBR022W 534 nt14.61□□□□□ -0.07
HIF1Q12373 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.55□□□□□ -0.08
HIF1Q12373 PUN1YLR414C 792 nt14.54□□□□□ -0.08
HIF1Q12373 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.53□□□□□ -0.08
HIF1Q12373 YJR018WYJR018W 363 nt14.53□□□□□ -0.08
HIF1Q12373 YOR139CYOR139C 393 nt14.39□□□□□ -0.11
HIF1Q12373 RPP2BYDR382W 333 nt14.37□□□□□ -0.11
HIF1Q12373 SRB2YHR041C 633 nt14.36□□□□□ -0.11
HIF1Q12373 BSC6YOL137W 1494 nt14.34□□□□□ -0.11
HIF1Q12373 YGR021WYGR021W 873 nt14.33□□□□□ -0.12
HIF1Q12373 NPL3YDR432W 1245 nt14.31□□□□□ -0.12
HIF1Q12373 PTC2YER089C 1395 nt14.28□□□□□ -0.12
HIF1Q12373 WWM1YFL010C 636 nt14.27□□□□□ -0.13
HIF1Q12373 YJR120WYJR120W 351 nt14.27□□□□□ -0.13
HIF1Q12373 Q0182Q0182 405 nt14.26□□□□□ -0.13
HIF1Q12373 HOM6YJR139C 1080 nt14.23□□□□□ -0.13
HIF1Q12373 BUD23YCR047C 828 nt14.21□□□□□ -0.13
HIF1Q12373 FPS1YLL043W 2010 nt14.19□□□□□ -0.14
HIF1Q12373 MNP1YGL068W 585 nt14.18□□□□□ -0.14
HIF1Q12373 YOL037CYOL037C 354 nt14.12□□□□□ -0.15
HIF1Q12373 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.08□□□□□ -0.16
HIF1Q12373 NAB2YGL122C 1578 nt14.08□□□□□ -0.16
HIF1Q12373 BDH2YAL061W 1254 nt14.07□□□□□ -0.16
HIF1Q12373 RKM5YLR137W 1104 nt14.04□□□□□ -0.16
HIF1Q12373 INM2YDR287W 879 nt14.02□□□□□ -0.17
HIF1Q12373 LSM3YLR438C-A 270 nt13.95□□□□□ -0.18
HIF1Q12373 FPR4YLR449W 1179 nt13.94□□□□□ -0.18
HIF1Q12373 DAL1YIR027C 1383 nt13.94□□□□□ -0.18
HIF1Q12373 YBL100CYBL100C 315 nt13.9□□□□□ -0.18
HIF1Q12373 FIS1YIL065C 468 nt13.85□□□□□ -0.19
HIF1Q12373 SPT5YML010W 3192 nt13.83□□□□□ -0.2
HIF1Q12373 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.83□□□□□ -0.2
HIF1Q12373 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.83□□□□□ -0.2
HIF1Q12373 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.83□□□□□ -0.2
HIF1Q12373 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.83□□□□□ -0.2
HIF1Q12373 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.83□□□□□ -0.2
HIF1Q12373 PHO4YFR034C 939 nt13.79□□□□□ -0.2
HIF1Q12373 TRM9YML014W 840 nt13.79□□□□□ -0.2
HIF1Q12373 NVJ2YPR091C 2313 nt13.77□□□□□ -0.21
HIF1Q12373 FUN26YAL022C 1554 nt13.73□□□□□ -0.21
HIF1Q12373 YLR281CYLR281C 468 nt13.72□□□□□ -0.21
HIF1Q12373 PUS2YGL063W 1113 nt13.69□□□□□ -0.22
HIF1Q12373 WHI5YOR083W 888 nt13.65□□□□□ -0.22
HIF1Q12373 CCT6YDR188W 1641 nt13.6□□□□□ -0.23
HIF1Q12373 PAC11YDR488C 1602 nt13.54□□□□□ -0.24
HIF1Q12373 ALF1YNL148C 765 nt13.54□□□□□ -0.24
HIF1Q12373 SSA4YER103W 1929 nt13.54□□□□□ -0.24
HIF1Q12373 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.53□□□□□ -0.24
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