Protein–RNA interactions for Protein: Q03010

UME1, Transcriptional regulatory protein UME1, yeastyeast

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Length 460 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UME1Q03010 NSR1YGR159C 1245 nt21.99■■□□□ 1.11
UME1Q03010 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.9■■□□□ 1.1
UME1Q03010 NOP1YDL014W 984 nt21.12■□□□□ 0.97
UME1Q03010 MDJ1YFL016C 1536 nt19.84■□□□□ 0.77
UME1Q03010 YKL036CYKL036C 393 nt19.28■□□□□ 0.68
UME1Q03010 SRX1YKL086W 384 nt18.5■□□□□ 0.55
UME1Q03010 Q0297Q0297 156 nt18.46■□□□□ 0.55
UME1Q03010 YJL027CYJL027C 417 nt18.23■□□□□ 0.51
UME1Q03010 YCR051WYCR051W 669 nt17.52■□□□□ 0.4
UME1Q03010 DBP2YNL112W 1641 nt17.49■□□□□ 0.39
UME1Q03010 SCS3YGL126W 1143 nt17.44■□□□□ 0.38
UME1Q03010 YBR190WYBR190W 312 nt16.94■□□□□ 0.3
UME1Q03010 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.92■□□□□ 0.3
UME1Q03010 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.92■□□□□ 0.3
UME1Q03010 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.92■□□□□ 0.3
UME1Q03010 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.92■□□□□ 0.3
UME1Q03010 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.92■□□□□ 0.3
UME1Q03010 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.92■□□□□ 0.3
UME1Q03010 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.92■□□□□ 0.3
UME1Q03010 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.92■□□□□ 0.3
UME1Q03010 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.92■□□□□ 0.3
UME1Q03010 YOL085CYOL085C 342 nt16.74■□□□□ 0.27
UME1Q03010 CCC1YLR220W 969 nt16.73■□□□□ 0.27
UME1Q03010 RPP1BYDL130W 321 nt16.56■□□□□ 0.24
UME1Q03010 RTC3YHR087W 336 nt16.53■□□□□ 0.24
UME1Q03010 PKP1YIL042C 1185 nt16.53■□□□□ 0.24
UME1Q03010 RVS167YDR388W 1449 nt16.25■□□□□ 0.19
UME1Q03010 SCJ1YMR214W 1134 nt16.24■□□□□ 0.19
UME1Q03010 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.91■□□□□ 0.14
UME1Q03010 PET122YER153C 765 nt15.89■□□□□ 0.13
UME1Q03010 PUT4YOR348C 1884 nt15.66■□□□□ 0.1
UME1Q03010 SHR5YOL110W 714 nt15.66■□□□□ 0.1
UME1Q03010 SCR1SCR1 522 nt15.56■□□□□ 0.08
UME1Q03010 ATS1YAL020C 1002 nt15.51■□□□□ 0.07
UME1Q03010 URN1YPR152C 1398 nt15.4■□□□□ 0.06
UME1Q03010 RRN5YLR141W 1092 nt15.39■□□□□ 0.05
UME1Q03010 YDJ1YNL064C 1230 nt15.37■□□□□ 0.05
UME1Q03010 DEP1YAL013W 1218 nt15.34■□□□□ 0.05
UME1Q03010 ARE1YCR048W 1833 nt15.3■□□□□ 0.04
UME1Q03010 SSA3YBL075C 1950 nt15.26■□□□□ 0.03
UME1Q03010 OPI9YLR338W 858 nt15.24■□□□□ 0.03
UME1Q03010 SAH1YER043C 1350 nt15.24■□□□□ 0.03
UME1Q03010 POA1YBR022W 534 nt15.12■□□□□ 0.01
UME1Q03010 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.09■□□□□ 0.01
UME1Q03010 GAR1YHR089C 618 nt15.09■□□□□ 0.01
UME1Q03010 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.06■□□□□ 0
UME1Q03010 RPN10YHR200W 807 nt15.05■□□□□ -0
UME1Q03010 YNL208WYNL208W 600 nt15.03■□□□□ -0
UME1Q03010 RSB1YOR049C 1065 nt14.96□□□□□ -0.01
UME1Q03010 BSC6YOL137W 1494 nt14.85□□□□□ -0.03
UME1Q03010 PUN1YLR414C 792 nt14.76□□□□□ -0.05
UME1Q03010 BUD23YCR047C 828 nt14.67□□□□□ -0.06
UME1Q03010 YJR018WYJR018W 363 nt14.67□□□□□ -0.06
UME1Q03010 PTC2YER089C 1395 nt14.66□□□□□ -0.06
UME1Q03010 TIR1YER011W 765 nt14.59□□□□□ -0.07
UME1Q03010 SSA1YAL005C 1929 nt14.52□□□□□ -0.09
UME1Q03010 NAB2YGL122C 1578 nt14.49□□□□□ -0.09
UME1Q03010 YJR120WYJR120W 351 nt14.49□□□□□ -0.09
UME1Q03010 SPT5YML010W 3192 nt14.45□□□□□ -0.1
UME1Q03010 PST2YDR032C 597 nt14.44□□□□□ -0.1
UME1Q03010 FIS1YIL065C 468 nt14.32□□□□□ -0.12
UME1Q03010 Q0182Q0182 405 nt14.3□□□□□ -0.12
UME1Q03010 SRB2YHR041C 633 nt14.3□□□□□ -0.12
UME1Q03010 DAL1YIR027C 1383 nt14.25□□□□□ -0.13
UME1Q03010 RPP2BYDR382W 333 nt14.24□□□□□ -0.13
UME1Q03010 FPR4YLR449W 1179 nt14.2□□□□□ -0.14
UME1Q03010 INM2YDR287W 879 nt14.15□□□□□ -0.14
UME1Q03010 PHO4YFR034C 939 nt14.14□□□□□ -0.15
UME1Q03010 YBL100CYBL100C 315 nt14□□□□□ -0.17
UME1Q03010 SSA4YER103W 1929 nt13.98□□□□□ -0.17
UME1Q03010 BDH2YAL061W 1254 nt13.97□□□□□ -0.17
UME1Q03010 YPS1YLR120C 1710 nt13.97□□□□□ -0.17
UME1Q03010 MEP2YNL142W 1500 nt13.96□□□□□ -0.17
UME1Q03010 WWM1YFL010C 636 nt13.93□□□□□ -0.18
UME1Q03010 SHU1YHL006C 453 nt13.92□□□□□ -0.18
UME1Q03010 FUN26YAL022C 1554 nt13.84□□□□□ -0.19
UME1Q03010 YDR095CYDR095C 411 nt13.84□□□□□ -0.19
UME1Q03010 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.8□□□□□ -0.2
UME1Q03010 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.79□□□□□ -0.2
UME1Q03010 DCW1YKL046C 1350 nt13.78□□□□□ -0.2
UME1Q03010 MOT3YMR070W 1473 nt13.76□□□□□ -0.21
UME1Q03010 TRM9YML014W 840 nt13.73□□□□□ -0.21
UME1Q03010 LSM3YLR438C-A 270 nt13.72□□□□□ -0.21
UME1Q03010 YGR021WYGR021W 873 nt13.7□□□□□ -0.22
UME1Q03010 HOM6YJR139C 1080 nt13.7□□□□□ -0.22
UME1Q03010 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.67□□□□□ -0.22
UME1Q03010 YKL097CYKL097C 411 nt13.67□□□□□ -0.22
UME1Q03010 ALF1YNL148C 765 nt13.64□□□□□ -0.23
UME1Q03010 CCT6YDR188W 1641 nt13.64□□□□□ -0.23
UME1Q03010 MNP1YGL068W 585 nt13.61□□□□□ -0.23
UME1Q03010 PTP1YDL230W 1008 nt13.6□□□□□ -0.23
UME1Q03010 EMI2YDR516C 1503 nt13.56□□□□□ -0.24
UME1Q03010 RPP2AYOL039W 321 nt13.56□□□□□ -0.24
UME1Q03010 CAC2YML102W 1407 nt13.54□□□□□ -0.24
UME1Q03010 SIS1YNL007C 1059 nt13.51□□□□□ -0.25
UME1Q03010 BDF1YLR399C 2061 nt13.5□□□□□ -0.25
UME1Q03010 RKM5YLR137W 1104 nt13.49□□□□□ -0.25
UME1Q03010 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.48□□□□□ -0.25
UME1Q03010 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.48□□□□□ -0.25
UME1Q03010 YDL221WYDL221W 552 nt13.44□□□□□ -0.26
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