Protein–RNA interactions for Protein: P40516

EFM4, Protein-lysine N-methyltransferase EFM4, yeastyeast

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
EFM4P40516 NSR1YGR159C 1245 nt21.69■■□□□ 1.06
EFM4P40516 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.57■■□□□ 1.04
EFM4P40516 NOP1YDL014W 984 nt20.71■□□□□ 0.91
EFM4P40516 MDJ1YFL016C 1536 nt19.74■□□□□ 0.75
EFM4P40516 YKL036CYKL036C 393 nt18.79■□□□□ 0.6
EFM4P40516 SRX1YKL086W 384 nt18.12■□□□□ 0.49
EFM4P40516 YJL027CYJL027C 417 nt18.11■□□□□ 0.49
EFM4P40516 Q0297Q0297 156 nt18.02■□□□□ 0.48
EFM4P40516 DBP2YNL112W 1641 nt17.29■□□□□ 0.36
EFM4P40516 YCR051WYCR051W 669 nt17.22■□□□□ 0.35
EFM4P40516 SCS3YGL126W 1143 nt16.94■□□□□ 0.3
EFM4P40516 YBR190WYBR190W 312 nt16.83■□□□□ 0.28
EFM4P40516 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.64■□□□□ 0.25
EFM4P40516 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.64■□□□□ 0.25
EFM4P40516 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.64■□□□□ 0.25
EFM4P40516 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.64■□□□□ 0.25
EFM4P40516 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.64■□□□□ 0.25
EFM4P40516 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.64■□□□□ 0.25
EFM4P40516 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.64■□□□□ 0.25
EFM4P40516 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.64■□□□□ 0.25
EFM4P40516 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.64■□□□□ 0.25
EFM4P40516 CCC1YLR220W 969 nt16.54■□□□□ 0.24
EFM4P40516 RTC3YHR087W 336 nt16.5■□□□□ 0.23
EFM4P40516 YOL085CYOL085C 342 nt16.32■□□□□ 0.2
EFM4P40516 PKP1YIL042C 1185 nt16.2■□□□□ 0.18
EFM4P40516 RPP1BYDL130W 321 nt16.19■□□□□ 0.18
EFM4P40516 RVS167YDR388W 1449 nt16.08■□□□□ 0.16
EFM4P40516 SCJ1YMR214W 1134 nt16.03■□□□□ 0.16
EFM4P40516 PUT4YOR348C 1884 nt15.63■□□□□ 0.09
EFM4P40516 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.63■□□□□ 0.09
EFM4P40516 PET122YER153C 765 nt15.57■□□□□ 0.08
EFM4P40516 SSA3YBL075C 1950 nt15.52■□□□□ 0.07
EFM4P40516 SHR5YOL110W 714 nt15.45■□□□□ 0.06
EFM4P40516 URN1YPR152C 1398 nt15.3■□□□□ 0.04
EFM4P40516 ARE1YCR048W 1833 nt15.25■□□□□ 0.03
EFM4P40516 DEP1YAL013W 1218 nt15.25■□□□□ 0.03
EFM4P40516 SCR1SCR1 522 nt15.22■□□□□ 0.03
EFM4P40516 SAH1YER043C 1350 nt15.19■□□□□ 0.02
EFM4P40516 POA1YBR022W 534 nt15.15■□□□□ 0.02
EFM4P40516 OPI9YLR338W 858 nt15.12■□□□□ 0.01
EFM4P40516 RRN5YLR141W 1092 nt15.08■□□□□ 0
EFM4P40516 YDJ1YNL064C 1230 nt15.07■□□□□ 0
EFM4P40516 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.05■□□□□ -0
EFM4P40516 ATS1YAL020C 1002 nt15.03■□□□□ -0
EFM4P40516 RPN10YHR200W 807 nt14.9□□□□□ -0.02
EFM4P40516 GAR1YHR089C 618 nt14.88□□□□□ -0.03
EFM4P40516 BSC6YOL137W 1494 nt14.88□□□□□ -0.03
EFM4P40516 YNL208WYNL208W 600 nt14.87□□□□□ -0.03
EFM4P40516 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.77□□□□□ -0.05
EFM4P40516 BUD23YCR047C 828 nt14.69□□□□□ -0.06
EFM4P40516 PUN1YLR414C 792 nt14.65□□□□□ -0.06
EFM4P40516 RSB1YOR049C 1065 nt14.64□□□□□ -0.07
EFM4P40516 PTC2YER089C 1395 nt14.61□□□□□ -0.07
EFM4P40516 YJR018WYJR018W 363 nt14.55□□□□□ -0.08
EFM4P40516 SPT5YML010W 3192 nt14.45□□□□□ -0.1
EFM4P40516 NAB2YGL122C 1578 nt14.42□□□□□ -0.1
EFM4P40516 TIR1YER011W 765 nt14.37□□□□□ -0.11
EFM4P40516 SSA1YAL005C 1929 nt14.31□□□□□ -0.12
EFM4P40516 YJR120WYJR120W 351 nt14.3□□□□□ -0.12
EFM4P40516 FIS1YIL065C 468 nt14.22□□□□□ -0.13
EFM4P40516 FPR4YLR449W 1179 nt14.2□□□□□ -0.14
EFM4P40516 DAL1YIR027C 1383 nt14.16□□□□□ -0.14
EFM4P40516 SSA4YER103W 1929 nt14.11□□□□□ -0.15
EFM4P40516 RPP2BYDR382W 333 nt14.11□□□□□ -0.15
EFM4P40516 SRB2YHR041C 633 nt14.08□□□□□ -0.16
EFM4P40516 PHO4YFR034C 939 nt14.06□□□□□ -0.16
EFM4P40516 INM2YDR287W 879 nt14.03□□□□□ -0.16
EFM4P40516 PST2YDR032C 597 nt13.99□□□□□ -0.17
EFM4P40516 MEP2YNL142W 1500 nt13.97□□□□□ -0.17
EFM4P40516 YPS1YLR120C 1710 nt13.91□□□□□ -0.18
EFM4P40516 YBL100CYBL100C 315 nt13.89□□□□□ -0.19
EFM4P40516 DCW1YKL046C 1350 nt13.82□□□□□ -0.2
EFM4P40516 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.8□□□□□ -0.2
EFM4P40516 BDH2YAL061W 1254 nt13.78□□□□□ -0.2
EFM4P40516 YDR095CYDR095C 411 nt13.75□□□□□ -0.21
EFM4P40516 FUN26YAL022C 1554 nt13.72□□□□□ -0.21
EFM4P40516 WWM1YFL010C 636 nt13.71□□□□□ -0.21
EFM4P40516 TRM9YML014W 840 nt13.6□□□□□ -0.23
EFM4P40516 BDF1YLR399C 2061 nt13.6□□□□□ -0.23
EFM4P40516 ALF1YNL148C 765 nt13.58□□□□□ -0.24
EFM4P40516 EMI2YDR516C 1503 nt13.58□□□□□ -0.24
EFM4P40516 SHU1YHL006C 453 nt13.55□□□□□ -0.24
EFM4P40516 PTP1YDL230W 1008 nt13.53□□□□□ -0.24
EFM4P40516 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.52□□□□□ -0.25
EFM4P40516 CAC2YML102W 1407 nt13.52□□□□□ -0.25
EFM4P40516 LSM3YLR438C-A 270 nt13.49□□□□□ -0.25
EFM4P40516 RPP2AYOL039W 321 nt13.49□□□□□ -0.25
EFM4P40516 CCT6YDR188W 1641 nt13.46□□□□□ -0.25
EFM4P40516 YBR220CYBR220C 1683 nt13.45□□□□□ -0.26
EFM4P40516 YMR090WYMR090W 684 nt13.44□□□□□ -0.26
EFM4P40516 YDL221WYDL221W 552 nt13.43□□□□□ -0.26
EFM4P40516 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.41□□□□□ -0.26
EFM4P40516 YGR021WYGR021W 873 nt13.41□□□□□ -0.26
EFM4P40516 HOM6YJR139C 1080 nt13.4□□□□□ -0.26
EFM4P40516 TAT1YBR069C 1860 nt13.4□□□□□ -0.26
EFM4P40516 SIS1YNL007C 1059 nt13.38□□□□□ -0.27
EFM4P40516 MNP1YGL068W 585 nt13.35□□□□□ -0.27
EFM4P40516 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.34□□□□□ -0.27
EFM4P40516 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.34□□□□□ -0.27
EFM4P40516 SDH1YKL148C 1923 nt13.34□□□□□ -0.27
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