Protein–RNA interactions for Protein: P20485

CKI1, Choline kinase, yeastyeast

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CKI1P20485 NSR1YGR159C 1245 nt21.6■■□□□ 1.05
CKI1P20485 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.44■■□□□ 1.02
CKI1P20485 NOP1YDL014W 984 nt20.66■□□□□ 0.9
CKI1P20485 MDJ1YFL016C 1536 nt19.59■□□□□ 0.73
CKI1P20485 YKL036CYKL036C 393 nt18.71■□□□□ 0.59
CKI1P20485 SRX1YKL086W 384 nt18.04■□□□□ 0.48
CKI1P20485 YJL027CYJL027C 417 nt18.03■□□□□ 0.48
CKI1P20485 Q0297Q0297 156 nt17.94■□□□□ 0.46
CKI1P20485 DBP2YNL112W 1641 nt17.14■□□□□ 0.33
CKI1P20485 YCR051WYCR051W 669 nt17.13■□□□□ 0.33
CKI1P20485 SCS3YGL126W 1143 nt16.82■□□□□ 0.28
CKI1P20485 YBR190WYBR190W 312 nt16.77■□□□□ 0.28
CKI1P20485 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.54■□□□□ 0.24
CKI1P20485 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.54■□□□□ 0.24
CKI1P20485 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.54■□□□□ 0.24
CKI1P20485 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.54■□□□□ 0.24
CKI1P20485 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.54■□□□□ 0.24
CKI1P20485 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.54■□□□□ 0.24
CKI1P20485 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.54■□□□□ 0.24
CKI1P20485 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.54■□□□□ 0.24
CKI1P20485 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.54■□□□□ 0.24
CKI1P20485 RTC3YHR087W 336 nt16.42■□□□□ 0.22
CKI1P20485 CCC1YLR220W 969 nt16.42■□□□□ 0.22
CKI1P20485 YOL085CYOL085C 342 nt16.21■□□□□ 0.19
CKI1P20485 RPP1BYDL130W 321 nt16.11■□□□□ 0.17
CKI1P20485 RVS167YDR388W 1449 nt16.05■□□□□ 0.16
CKI1P20485 PKP1YIL042C 1185 nt16.05■□□□□ 0.16
CKI1P20485 SCJ1YMR214W 1134 nt15.89■□□□□ 0.13
CKI1P20485 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.53■□□□□ 0.08
CKI1P20485 PUT4YOR348C 1884 nt15.52■□□□□ 0.07
CKI1P20485 PET122YER153C 765 nt15.46■□□□□ 0.07
CKI1P20485 SSA3YBL075C 1950 nt15.39■□□□□ 0.05
CKI1P20485 SHR5YOL110W 714 nt15.38■□□□□ 0.05
CKI1P20485 URN1YPR152C 1398 nt15.22■□□□□ 0.03
CKI1P20485 SCR1SCR1 522 nt15.18■□□□□ 0.02
CKI1P20485 ARE1YCR048W 1833 nt15.13■□□□□ 0.01
CKI1P20485 DEP1YAL013W 1218 nt15.12■□□□□ 0.01
CKI1P20485 SAH1YER043C 1350 nt15.08■□□□□ 0
CKI1P20485 OPI9YLR338W 858 nt15.05■□□□□ -0
CKI1P20485 POA1YBR022W 534 nt15.03■□□□□ -0
CKI1P20485 YDJ1YNL064C 1230 nt15.01□□□□□ -0.01
CKI1P20485 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.96□□□□□ -0.01
CKI1P20485 RRN5YLR141W 1092 nt14.96□□□□□ -0.01
CKI1P20485 ATS1YAL020C 1002 nt14.92□□□□□ -0.02
CKI1P20485 RPN10YHR200W 807 nt14.89□□□□□ -0.03
CKI1P20485 YNL208WYNL208W 600 nt14.8□□□□□ -0.04
CKI1P20485 BSC6YOL137W 1494 nt14.77□□□□□ -0.04
CKI1P20485 GAR1YHR089C 618 nt14.77□□□□□ -0.05
CKI1P20485 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.66□□□□□ -0.06
CKI1P20485 PUN1YLR414C 792 nt14.61□□□□□ -0.07
CKI1P20485 BUD23YCR047C 828 nt14.6□□□□□ -0.07
CKI1P20485 RSB1YOR049C 1065 nt14.56□□□□□ -0.08
CKI1P20485 PTC2YER089C 1395 nt14.52□□□□□ -0.08
CKI1P20485 YJR018WYJR018W 363 nt14.48□□□□□ -0.09
CKI1P20485 NAB2YGL122C 1578 nt14.37□□□□□ -0.11
CKI1P20485 SPT5YML010W 3192 nt14.29□□□□□ -0.12
CKI1P20485 TIR1YER011W 765 nt14.28□□□□□ -0.12
CKI1P20485 SSA1YAL005C 1929 nt14.19□□□□□ -0.14
CKI1P20485 YJR120WYJR120W 351 nt14.17□□□□□ -0.14
CKI1P20485 FIS1YIL065C 468 nt14.12□□□□□ -0.15
CKI1P20485 FPR4YLR449W 1179 nt14.11□□□□□ -0.15
CKI1P20485 DAL1YIR027C 1383 nt14.1□□□□□ -0.15
CKI1P20485 RPP2BYDR382W 333 nt14.1□□□□□ -0.15
CKI1P20485 SSA4YER103W 1929 nt14.01□□□□□ -0.17
CKI1P20485 INM2YDR287W 879 nt14□□□□□ -0.17
CKI1P20485 PHO4YFR034C 939 nt13.99□□□□□ -0.17
CKI1P20485 MEP2YNL142W 1500 nt13.89□□□□□ -0.19
CKI1P20485 PST2YDR032C 597 nt13.88□□□□□ -0.19
CKI1P20485 SRB2YHR041C 633 nt13.88□□□□□ -0.19
CKI1P20485 YBL100CYBL100C 315 nt13.83□□□□□ -0.2
CKI1P20485 YPS1YLR120C 1710 nt13.83□□□□□ -0.2
CKI1P20485 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.74□□□□□ -0.21
CKI1P20485 BDH2YAL061W 1254 nt13.73□□□□□ -0.21
CKI1P20485 YDR095CYDR095C 411 nt13.69□□□□□ -0.22
CKI1P20485 DCW1YKL046C 1350 nt13.69□□□□□ -0.22
CKI1P20485 FUN26YAL022C 1554 nt13.64□□□□□ -0.23
CKI1P20485 WWM1YFL010C 636 nt13.6□□□□□ -0.23
CKI1P20485 TRM9YML014W 840 nt13.55□□□□□ -0.24
CKI1P20485 ALF1YNL148C 765 nt13.55□□□□□ -0.24
CKI1P20485 EMI2YDR516C 1503 nt13.49□□□□□ -0.25
CKI1P20485 BDF1YLR399C 2061 nt13.46□□□□□ -0.25
CKI1P20485 LSM3YLR438C-A 270 nt13.46□□□□□ -0.25
CKI1P20485 RPP2AYOL039W 321 nt13.44□□□□□ -0.26
CKI1P20485 SHU1YHL006C 453 nt13.43□□□□□ -0.26
CKI1P20485 YMR090WYMR090W 684 nt13.43□□□□□ -0.26
CKI1P20485 PTP1YDL230W 1008 nt13.41□□□□□ -0.26
CKI1P20485 CCT6YDR188W 1641 nt13.41□□□□□ -0.26
CKI1P20485 CAC2YML102W 1407 nt13.39□□□□□ -0.27
CKI1P20485 YGR021WYGR021W 873 nt13.38□□□□□ -0.27
CKI1P20485 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.37□□□□□ -0.27
CKI1P20485 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.36□□□□□ -0.27
CKI1P20485 YDL221WYDL221W 552 nt13.35□□□□□ -0.27
CKI1P20485 YBR220CYBR220C 1683 nt13.34□□□□□ -0.27
CKI1P20485 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.34□□□□□ -0.27
CKI1P20485 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.34□□□□□ -0.27
CKI1P20485 SIS1YNL007C 1059 nt13.32□□□□□ -0.28
CKI1P20485 HOM6YJR139C 1080 nt13.31□□□□□ -0.28
CKI1P20485 TAT1YBR069C 1860 nt13.29□□□□□ -0.28
CKI1P20485 SDH1YKL148C 1923 nt13.26□□□□□ -0.29
CKI1P20485 MNP1YGL068W 585 nt13.23□□□□□ -0.29
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