Protein–RNA interactions for Protein: P35718

RPC25, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC8, yeastyeast

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPC25P35718 NSR1YGR159C 1245 nt22.18■■□□□ 1.14
RPC25P35718 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.16■■□□□ 1.14
RPC25P35718 NOP1YDL014W 984 nt21.38■■□□□ 1.01
RPC25P35718 MDJ1YFL016C 1536 nt19.96■□□□□ 0.79
RPC25P35718 YKL036CYKL036C 393 nt19.61■□□□□ 0.73
RPC25P35718 Q0297Q0297 156 nt18.76■□□□□ 0.59
RPC25P35718 SRX1YKL086W 384 nt18.76■□□□□ 0.59
RPC25P35718 YJL027CYJL027C 417 nt18.31■□□□□ 0.52
RPC25P35718 SCS3YGL126W 1143 nt17.81■□□□□ 0.44
RPC25P35718 YCR051WYCR051W 669 nt17.74■□□□□ 0.43
RPC25P35718 DBP2YNL112W 1641 nt17.65■□□□□ 0.42
RPC25P35718 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.13■□□□□ 0.33
RPC25P35718 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.13■□□□□ 0.33
RPC25P35718 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.13■□□□□ 0.33
RPC25P35718 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.13■□□□□ 0.33
RPC25P35718 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.13■□□□□ 0.33
RPC25P35718 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.13■□□□□ 0.33
RPC25P35718 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.13■□□□□ 0.33
RPC25P35718 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.13■□□□□ 0.33
RPC25P35718 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.13■□□□□ 0.33
RPC25P35718 YOL085CYOL085C 342 nt17.04■□□□□ 0.32
RPC25P35718 YBR190WYBR190W 312 nt17.01■□□□□ 0.31
RPC25P35718 CCC1YLR220W 969 nt16.88■□□□□ 0.29
RPC25P35718 RPP1BYDL130W 321 nt16.81■□□□□ 0.28
RPC25P35718 PKP1YIL042C 1185 nt16.81■□□□□ 0.28
RPC25P35718 RTC3YHR087W 336 nt16.55■□□□□ 0.24
RPC25P35718 SCJ1YMR214W 1134 nt16.42■□□□□ 0.22
RPC25P35718 RVS167YDR388W 1449 nt16.33■□□□□ 0.2
RPC25P35718 PET122YER153C 765 nt16.13■□□□□ 0.17
RPC25P35718 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.11■□□□□ 0.17
RPC25P35718 ATS1YAL020C 1002 nt15.85■□□□□ 0.13
RPC25P35718 SHR5YOL110W 714 nt15.81■□□□□ 0.12
RPC25P35718 SCR1SCR1 522 nt15.77■□□□□ 0.12
RPC25P35718 PUT4YOR348C 1884 nt15.68■□□□□ 0.1
RPC25P35718 RRN5YLR141W 1092 nt15.62■□□□□ 0.09
RPC25P35718 YDJ1YNL064C 1230 nt15.58■□□□□ 0.08
RPC25P35718 URN1YPR152C 1398 nt15.49■□□□□ 0.07
RPC25P35718 DEP1YAL013W 1218 nt15.44■□□□□ 0.06
RPC25P35718 ARE1YCR048W 1833 nt15.33■□□□□ 0.05
RPC25P35718 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.33■□□□□ 0.04
RPC25P35718 OPI9YLR338W 858 nt15.33■□□□□ 0.04
RPC25P35718 SAH1YER043C 1350 nt15.29■□□□□ 0.04
RPC25P35718 GAR1YHR089C 618 nt15.25■□□□□ 0.03
RPC25P35718 RSB1YOR049C 1065 nt15.19■□□□□ 0.02
RPC25P35718 YNL208WYNL208W 600 nt15.13■□□□□ 0.01
RPC25P35718 RPN10YHR200W 807 nt15.12■□□□□ 0.01
RPC25P35718 POA1YBR022W 534 nt15.12■□□□□ 0.01
RPC25P35718 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.1■□□□□ 0.01
RPC25P35718 SSA3YBL075C 1950 nt15.09■□□□□ 0.01
RPC25P35718 BSC6YOL137W 1494 nt14.85□□□□□ -0.03
RPC25P35718 PUN1YLR414C 792 nt14.83□□□□□ -0.04
RPC25P35718 TIR1YER011W 765 nt14.76□□□□□ -0.05
RPC25P35718 YJR018WYJR018W 363 nt14.76□□□□□ -0.05
RPC25P35718 PST2YDR032C 597 nt14.75□□□□□ -0.05
RPC25P35718 PTC2YER089C 1395 nt14.71□□□□□ -0.06
RPC25P35718 SSA1YAL005C 1929 nt14.68□□□□□ -0.06
RPC25P35718 BUD23YCR047C 828 nt14.67□□□□□ -0.06
RPC25P35718 YJR120WYJR120W 351 nt14.66□□□□□ -0.06
RPC25P35718 NAB2YGL122C 1578 nt14.52□□□□□ -0.08
RPC25P35718 SRB2YHR041C 633 nt14.52□□□□□ -0.09
RPC25P35718 SPT5YML010W 3192 nt14.44□□□□□ -0.1
RPC25P35718 FIS1YIL065C 468 nt14.41□□□□□ -0.1
RPC25P35718 RPP2BYDR382W 333 nt14.32□□□□□ -0.12
RPC25P35718 DAL1YIR027C 1383 nt14.32□□□□□ -0.12
RPC25P35718 FPR4YLR449W 1179 nt14.22□□□□□ -0.13
RPC25P35718 INM2YDR287W 879 nt14.21□□□□□ -0.13
RPC25P35718 PHO4YFR034C 939 nt14.21□□□□□ -0.13
RPC25P35718 SHU1YHL006C 453 nt14.21□□□□□ -0.13
RPC25P35718 WWM1YFL010C 636 nt14.11□□□□□ -0.15
RPC25P35718 BDH2YAL061W 1254 nt14.09□□□□□ -0.15
RPC25P35718 YBL100CYBL100C 315 nt14.09□□□□□ -0.15
RPC25P35718 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.03□□□□□ -0.16
RPC25P35718 YPS1YLR120C 1710 nt14.01□□□□□ -0.17
RPC25P35718 YKL097CYKL097C 411 nt13.99□□□□□ -0.17
RPC25P35718 MEP2YNL142W 1500 nt13.95□□□□□ -0.18
RPC25P35718 FUN26YAL022C 1554 nt13.93□□□□□ -0.18
RPC25P35718 HOM6YJR139C 1080 nt13.92□□□□□ -0.18
RPC25P35718 YDR095CYDR095C 411 nt13.91□□□□□ -0.18
RPC25P35718 SSA4YER103W 1929 nt13.9□□□□□ -0.18
RPC25P35718 YGR021WYGR021W 873 nt13.88□□□□□ -0.19
RPC25P35718 MNP1YGL068W 585 nt13.85□□□□□ -0.19
RPC25P35718 LSM3YLR438C-A 270 nt13.85□□□□□ -0.19
RPC25P35718 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.84□□□□□ -0.19
RPC25P35718 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.8□□□□□ -0.2
RPC25P35718 TRM9YML014W 840 nt13.79□□□□□ -0.2
RPC25P35718 DCW1YKL046C 1350 nt13.79□□□□□ -0.2
RPC25P35718 CCT6YDR188W 1641 nt13.74□□□□□ -0.21
RPC25P35718 RKM5YLR137W 1104 nt13.7□□□□□ -0.22
RPC25P35718 PTP1YDL230W 1008 nt13.68□□□□□ -0.22
RPC25P35718 ALF1YNL148C 765 nt13.68□□□□□ -0.22
RPC25P35718 SIS1YNL007C 1059 nt13.6□□□□□ -0.23
RPC25P35718 RPP2AYOL039W 321 nt13.6□□□□□ -0.23
RPC25P35718 CAC2YML102W 1407 nt13.59□□□□□ -0.23
RPC25P35718 YOR139CYOR139C 393 nt13.58□□□□□ -0.24
RPC25P35718 EMI2YDR516C 1503 nt13.55□□□□□ -0.24
RPC25P35718 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.55□□□□□ -0.24
RPC25P35718 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.55□□□□□ -0.24
RPC25P35718 YDL221WYDL221W 552 nt13.45□□□□□ -0.26
RPC25P35718 YOL037CYOL037C 354 nt13.45□□□□□ -0.26
RPC25P35718 BDF1YLR399C 2061 nt13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.7 ms