Protein–RNA interactions for Protein: Q12499

NOP58, Nucleolar protein 58, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NOP58Q12499 NSR1YGR159C 1245 nt21.25■□□□□ 0.99
NOP58Q12499 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.52■□□□□ 0.88
NOP58Q12499 MDJ1YFL016C 1536 nt19.75■□□□□ 0.75
NOP58Q12499 NOP1YDL014W 984 nt19.58■□□□□ 0.72
NOP58Q12499 YJL027CYJL027C 417 nt18.13■□□□□ 0.49
NOP58Q12499 SSA3YBL075C 1950 nt17.57■□□□□ 0.4
NOP58Q12499 YKL036CYKL036C 393 nt17.17■□□□□ 0.34
NOP58Q12499 SRX1YKL086W 384 nt17.1■□□□□ 0.33
NOP58Q12499 YBR190WYBR190W 312 nt17.1■□□□□ 0.33
NOP58Q12499 DBP2YNL112W 1641 nt17.09■□□□□ 0.33
NOP58Q12499 Q0297Q0297 156 nt16.82■□□□□ 0.28
NOP58Q12499 RTC3YHR087W 336 nt16.67■□□□□ 0.26
NOP58Q12499 PUT4YOR348C 1884 nt16.26■□□□□ 0.19
NOP58Q12499 YCR051WYCR051W 669 nt16.15■□□□□ 0.18
NOP58Q12499 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.02■□□□□ 0.16
NOP58Q12499 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.02■□□□□ 0.16
NOP58Q12499 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.02■□□□□ 0.16
NOP58Q12499 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.02■□□□□ 0.16
NOP58Q12499 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.02■□□□□ 0.16
NOP58Q12499 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.02■□□□□ 0.16
NOP58Q12499 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.02■□□□□ 0.16
NOP58Q12499 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.02■□□□□ 0.16
NOP58Q12499 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.02■□□□□ 0.16
NOP58Q12499 CCC1YLR220W 969 nt15.86■□□□□ 0.13
NOP58Q12499 RVS167YDR388W 1449 nt15.85■□□□□ 0.13
NOP58Q12499 POA1YBR022W 534 nt15.68■□□□□ 0.1
NOP58Q12499 ARE1YCR048W 1833 nt15.67■□□□□ 0.1
NOP58Q12499 SCJ1YMR214W 1134 nt15.55■□□□□ 0.08
NOP58Q12499 SPT5YML010W 3192 nt15.52■□□□□ 0.08
NOP58Q12499 BSC6YOL137W 1494 nt15.51■□□□□ 0.07
NOP58Q12499 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.46■□□□□ 0.07
NOP58Q12499 SSA4YER103W 1929 nt15.45■□□□□ 0.06
NOP58Q12499 SCS3YGL126W 1143 nt15.39■□□□□ 0.05
NOP58Q12499 SAH1YER043C 1350 nt15.37■□□□□ 0.05
NOP58Q12499 URN1YPR152C 1398 nt15.24■□□□□ 0.03
NOP58Q12499 OPI9YLR338W 858 nt15.22■□□□□ 0.03
NOP58Q12499 RPP1BYDL130W 321 nt15.09■□□□□ 0.01
NOP58Q12499 SHR5YOL110W 714 nt15.07■□□□□ 0
NOP58Q12499 BUD23YCR047C 828 nt15.04■□□□□ -0
NOP58Q12499 DEP1YAL013W 1218 nt14.97□□□□□ -0.01
NOP58Q12499 BDF1YLR399C 2061 nt14.97□□□□□ -0.01
NOP58Q12499 YOL085CYOL085C 342 nt14.9□□□□□ -0.02
NOP58Q12499 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.84□□□□□ -0.03
NOP58Q12499 RPN10YHR200W 807 nt14.8□□□□□ -0.04
NOP58Q12499 PKP1YIL042C 1185 nt14.79□□□□□ -0.04
NOP58Q12499 PUN1YLR414C 792 nt14.77□□□□□ -0.05
NOP58Q12499 PTC2YER089C 1395 nt14.76□□□□□ -0.05
NOP58Q12499 TAT1YBR069C 1860 nt14.73□□□□□ -0.05
NOP58Q12499 NAB2YGL122C 1578 nt14.7□□□□□ -0.06
NOP58Q12499 MEP2YNL142W 1500 nt14.66□□□□□ -0.06
NOP58Q12499 YNL208WYNL208W 600 nt14.63□□□□□ -0.07
NOP58Q12499 PAC11YDR488C 1602 nt14.61□□□□□ -0.07
NOP58Q12499 PET122YER153C 765 nt14.53□□□□□ -0.08
NOP58Q12499 YJR018WYJR018W 363 nt14.49□□□□□ -0.09
NOP58Q12499 DCW1YKL046C 1350 nt14.41□□□□□ -0.1
NOP58Q12499 FIS1YIL065C 468 nt14.38□□□□□ -0.11
NOP58Q12499 YDJ1YNL064C 1230 nt14.37□□□□□ -0.11
NOP58Q12499 DAL1YIR027C 1383 nt14.32□□□□□ -0.12
NOP58Q12499 YBR220CYBR220C 1683 nt14.27□□□□□ -0.12
NOP58Q12499 FPR4YLR449W 1179 nt14.27□□□□□ -0.13
NOP58Q12499 YPS1YLR120C 1710 nt14.26□□□□□ -0.13
NOP58Q12499 GAR1YHR089C 618 nt14.2□□□□□ -0.14
NOP58Q12499 EMI2YDR516C 1503 nt14.2□□□□□ -0.14
NOP58Q12499 YMR090WYMR090W 684 nt14.19□□□□□ -0.14
NOP58Q12499 NVJ2YPR091C 2313 nt14.19□□□□□ -0.14
NOP58Q12499 PHO4YFR034C 939 nt14.18□□□□□ -0.14
NOP58Q12499 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.16□□□□□ -0.14
NOP58Q12499 INM2YDR287W 879 nt14.11□□□□□ -0.15
NOP58Q12499 SCR1SCR1 522 nt14.11□□□□□ -0.15
NOP58Q12499 YJR120WYJR120W 351 nt14.05□□□□□ -0.16
NOP58Q12499 SDH1YKL148C 1923 nt14.03□□□□□ -0.16
NOP58Q12499 RRN5YLR141W 1092 nt14.02□□□□□ -0.17
NOP58Q12499 YDR095CYDR095C 411 nt14.01□□□□□ -0.17
NOP58Q12499 YDL221WYDL221W 552 nt14□□□□□ -0.17
NOP58Q12499 PCH2YBR186W 1695 nt13.99□□□□□ -0.17
NOP58Q12499 GUT2YIL155C 1950 nt13.94□□□□□ -0.18
NOP58Q12499 RPP2BYDR382W 333 nt13.93□□□□□ -0.18
NOP58Q12499 SEC11YIR022W 504 nt13.9□□□□□ -0.18
NOP58Q12499 CAC2YML102W 1407 nt13.88□□□□□ -0.19
NOP58Q12499 SSA1YAL005C 1929 nt13.8□□□□□ -0.2
NOP58Q12499 PTP1YDL230W 1008 nt13.8□□□□□ -0.2
NOP58Q12499 YBL100CYBL100C 315 nt13.8□□□□□ -0.2
NOP58Q12499 SCC4YER147C 1875 nt13.8□□□□□ -0.2
NOP58Q12499 TIR1YER011W 765 nt13.77□□□□□ -0.21
NOP58Q12499 ATS1YAL020C 1002 nt13.75□□□□□ -0.21
NOP58Q12499 RPP2AYOL039W 321 nt13.75□□□□□ -0.21
NOP58Q12499 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.72□□□□□ -0.21
NOP58Q12499 PIB2YGL023C 1908 nt13.7□□□□□ -0.22
NOP58Q12499 IRC15YPL017C 1500 nt13.66□□□□□ -0.22
NOP58Q12499 ALF1YNL148C 765 nt13.62□□□□□ -0.23
NOP58Q12499 FUN26YAL022C 1554 nt13.61□□□□□ -0.23
NOP58Q12499 GIS3YLR094C 1509 nt13.59□□□□□ -0.23
NOP58Q12499 YSC84YHR016C 1407 nt13.59□□□□□ -0.23
NOP58Q12499 RTF1YGL244W 1677 nt13.55□□□□□ -0.24
NOP58Q12499 BDH2YAL061W 1254 nt13.5□□□□□ -0.25
NOP58Q12499 YHL050CYHL050C 2094 nt13.49□□□□□ -0.25
NOP58Q12499 SIS1YNL007C 1059 nt13.44□□□□□ -0.26
NOP58Q12499 RSB1YOR049C 1065 nt13.43□□□□□ -0.26
NOP58Q12499 TRM9YML014W 840 nt13.42□□□□□ -0.26
NOP58Q12499 SRB2YHR041C 633 nt13.39□□□□□ -0.27
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