Protein–RNA interactions for Protein: Q02959

HOS3, Histone deacetylase HOS3, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HOS3Q02959 NSR1YGR159C 1245 nt21.52■■□□□ 1.04
HOS3Q02959 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.01■□□□□ 0.95
HOS3Q02959 NOP1YDL014W 984 nt20.08■□□□□ 0.81
HOS3Q02959 MDJ1YFL016C 1536 nt19.86■□□□□ 0.77
HOS3Q02959 YJL027CYJL027C 417 nt18.22■□□□□ 0.51
HOS3Q02959 YKL036CYKL036C 393 nt17.84■□□□□ 0.45
HOS3Q02959 SRX1YKL086W 384 nt17.56■□□□□ 0.4
HOS3Q02959 Q0297Q0297 156 nt17.35■□□□□ 0.37
HOS3Q02959 DBP2YNL112W 1641 nt17.27■□□□□ 0.36
HOS3Q02959 YBR190WYBR190W 312 nt17.1■□□□□ 0.33
HOS3Q02959 SSA3YBL075C 1950 nt16.94■□□□□ 0.3
HOS3Q02959 RTC3YHR087W 336 nt16.68■□□□□ 0.26
HOS3Q02959 YCR051WYCR051W 669 nt16.61■□□□□ 0.25
HOS3Q02959 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.34■□□□□ 0.21
HOS3Q02959 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.34■□□□□ 0.21
HOS3Q02959 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.34■□□□□ 0.21
HOS3Q02959 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.34■□□□□ 0.21
HOS3Q02959 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.34■□□□□ 0.21
HOS3Q02959 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.34■□□□□ 0.21
HOS3Q02959 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.34■□□□□ 0.21
HOS3Q02959 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.34■□□□□ 0.21
HOS3Q02959 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.34■□□□□ 0.21
HOS3Q02959 CCC1YLR220W 969 nt16.17■□□□□ 0.18
HOS3Q02959 PUT4YOR348C 1884 nt16.14■□□□□ 0.17
HOS3Q02959 SCS3YGL126W 1143 nt16.08■□□□□ 0.16
HOS3Q02959 RVS167YDR388W 1449 nt16.02■□□□□ 0.15
HOS3Q02959 SCJ1YMR214W 1134 nt15.84■□□□□ 0.13
HOS3Q02959 ARE1YCR048W 1833 nt15.61■□□□□ 0.09
HOS3Q02959 RPP1BYDL130W 321 nt15.57■□□□□ 0.08
HOS3Q02959 POA1YBR022W 534 nt15.57■□□□□ 0.08
HOS3Q02959 YOL085CYOL085C 342 nt15.49■□□□□ 0.07
HOS3Q02959 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.41■□□□□ 0.06
HOS3Q02959 SAH1YER043C 1350 nt15.4■□□□□ 0.06
HOS3Q02959 BSC6YOL137W 1494 nt15.38■□□□□ 0.05
HOS3Q02959 PKP1YIL042C 1185 nt15.36■□□□□ 0.05
HOS3Q02959 URN1YPR152C 1398 nt15.36■□□□□ 0.05
HOS3Q02959 SHR5YOL110W 714 nt15.3■□□□□ 0.04
HOS3Q02959 OPI9YLR338W 858 nt15.28■□□□□ 0.04
HOS3Q02959 SPT5YML010W 3192 nt15.25■□□□□ 0.03
HOS3Q02959 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.21■□□□□ 0.03
HOS3Q02959 DEP1YAL013W 1218 nt15.14■□□□□ 0.01
HOS3Q02959 SSA4YER103W 1929 nt15.07■□□□□ 0
HOS3Q02959 BUD23YCR047C 828 nt14.99□□□□□ -0.01
HOS3Q02959 PET122YER153C 765 nt14.99□□□□□ -0.01
HOS3Q02959 RPN10YHR200W 807 nt14.91□□□□□ -0.02
HOS3Q02959 PUN1YLR414C 792 nt14.81□□□□□ -0.04
HOS3Q02959 YNL208WYNL208W 600 nt14.79□□□□□ -0.04
HOS3Q02959 PTC2YER089C 1395 nt14.78□□□□□ -0.04
HOS3Q02959 YDJ1YNL064C 1230 nt14.7□□□□□ -0.06
HOS3Q02959 NAB2YGL122C 1578 nt14.68□□□□□ -0.06
HOS3Q02959 YJR018WYJR018W 363 nt14.59□□□□□ -0.07
HOS3Q02959 SCR1SCR1 522 nt14.58□□□□□ -0.08
HOS3Q02959 BDF1YLR399C 2061 nt14.57□□□□□ -0.08
HOS3Q02959 ATS1YAL020C 1002 nt14.57□□□□□ -0.08
HOS3Q02959 GAR1YHR089C 618 nt14.51□□□□□ -0.09
HOS3Q02959 MEP2YNL142W 1500 nt14.51□□□□□ -0.09
HOS3Q02959 RRN5YLR141W 1092 nt14.46□□□□□ -0.09
HOS3Q02959 FIS1YIL065C 468 nt14.43□□□□□ -0.1
HOS3Q02959 TAT1YBR069C 1860 nt14.35□□□□□ -0.11
HOS3Q02959 DAL1YIR027C 1383 nt14.34□□□□□ -0.11
HOS3Q02959 FPR4YLR449W 1179 nt14.3□□□□□ -0.12
HOS3Q02959 DCW1YKL046C 1350 nt14.29□□□□□ -0.12
HOS3Q02959 YJR120WYJR120W 351 nt14.25□□□□□ -0.13
HOS3Q02959 PHO4YFR034C 939 nt14.23□□□□□ -0.13
HOS3Q02959 YPS1YLR120C 1710 nt14.22□□□□□ -0.13
HOS3Q02959 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.18□□□□□ -0.14
HOS3Q02959 INM2YDR287W 879 nt14.14□□□□□ -0.15
HOS3Q02959 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.1□□□□□ -0.15
HOS3Q02959 SSA1YAL005C 1929 nt14.07□□□□□ -0.16
HOS3Q02959 YBR220CYBR220C 1683 nt14.07□□□□□ -0.16
HOS3Q02959 RPP2BYDR382W 333 nt14.06□□□□□ -0.16
HOS3Q02959 TIR1YER011W 765 nt14.06□□□□□ -0.16
HOS3Q02959 EMI2YDR516C 1503 nt14.05□□□□□ -0.16
HOS3Q02959 YDR095CYDR095C 411 nt14.01□□□□□ -0.17
HOS3Q02959 PAC11YDR488C 1602 nt13.98□□□□□ -0.17
HOS3Q02959 YMR090WYMR090W 684 nt13.98□□□□□ -0.17
HOS3Q02959 RSB1YOR049C 1065 nt13.94□□□□□ -0.18
HOS3Q02959 YBL100CYBL100C 315 nt13.91□□□□□ -0.18
HOS3Q02959 YDL221WYDL221W 552 nt13.9□□□□□ -0.18
HOS3Q02959 SDH1YKL148C 1923 nt13.86□□□□□ -0.19
HOS3Q02959 CAC2YML102W 1407 nt13.82□□□□□ -0.2
HOS3Q02959 PTP1YDL230W 1008 nt13.79□□□□□ -0.2
HOS3Q02959 SRB2YHR041C 633 nt13.73□□□□□ -0.21
HOS3Q02959 RPP2AYOL039W 321 nt13.73□□□□□ -0.21
HOS3Q02959 FUN26YAL022C 1554 nt13.72□□□□□ -0.21
HOS3Q02959 PCH2YBR186W 1695 nt13.71□□□□□ -0.21
HOS3Q02959 BDH2YAL061W 1254 nt13.67□□□□□ -0.22
HOS3Q02959 ALF1YNL148C 765 nt13.67□□□□□ -0.22
HOS3Q02959 SCC4YER147C 1875 nt13.67□□□□□ -0.22
HOS3Q02959 GUT2YIL155C 1950 nt13.67□□□□□ -0.22
HOS3Q02959 SEC11YIR022W 504 nt13.63□□□□□ -0.23
HOS3Q02959 IRC15YPL017C 1500 nt13.62□□□□□ -0.23
HOS3Q02959 GIS3YLR094C 1509 nt13.54□□□□□ -0.24
HOS3Q02959 TRM9YML014W 840 nt13.53□□□□□ -0.24
HOS3Q02959 NVJ2YPR091C 2313 nt13.51□□□□□ -0.25
HOS3Q02959 SIS1YNL007C 1059 nt13.49□□□□□ -0.25
HOS3Q02959 PIB2YGL023C 1908 nt13.46□□□□□ -0.25
HOS3Q02959 YSC84YHR016C 1407 nt13.46□□□□□ -0.26
HOS3Q02959 CCT6YDR188W 1641 nt13.46□□□□□ -0.26
HOS3Q02959 PST2YDR032C 597 nt13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.6 ms