Protein–RNA interactions for Protein: Q12502

LDB19, Protein LDB19, yeastyeast

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Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB19Q12502 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.47■■□□□ 1.19
LDB19Q12502 NOP1YDL014W 984 nt22.06■■□□□ 1.12
LDB19Q12502 NSR1YGR159C 1245 nt21.75■■□□□ 1.07
LDB19Q12502 YKL036CYKL036C 393 nt20.89■□□□□ 0.93
LDB19Q12502 YJL027CYJL027C 417 nt19.64■□□□□ 0.73
LDB19Q12502 Q0297Q0297 156 nt19.45■□□□□ 0.7
LDB19Q12502 SCS3YGL126W 1143 nt19.3■□□□□ 0.68
LDB19Q12502 SRX1YKL086W 384 nt19.24■□□□□ 0.67
LDB19Q12502 MDJ1YFL016C 1536 nt18.92■□□□□ 0.62
LDB19Q12502 YCR051WYCR051W 669 nt18.39■□□□□ 0.53
LDB19Q12502 YOL085CYOL085C 342 nt18.06■□□□□ 0.48
LDB19Q12502 SCJ1YMR214W 1134 nt17.79■□□□□ 0.44
LDB19Q12502 PKP1YIL042C 1185 nt17.77■□□□□ 0.44
LDB19Q12502 RPP1BYDL130W 321 nt17.48■□□□□ 0.39
LDB19Q12502 ATS1YAL020C 1002 nt17.42■□□□□ 0.38
LDB19Q12502 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.04■□□□□ 0.32
LDB19Q12502 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.04■□□□□ 0.32
LDB19Q12502 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.04■□□□□ 0.32
LDB19Q12502 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.04■□□□□ 0.32
LDB19Q12502 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.04■□□□□ 0.32
LDB19Q12502 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.04■□□□□ 0.32
LDB19Q12502 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.04■□□□□ 0.32
LDB19Q12502 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.04■□□□□ 0.32
LDB19Q12502 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.04■□□□□ 0.32
LDB19Q12502 CCC1YLR220W 969 nt16.98■□□□□ 0.31
LDB19Q12502 DBP2YNL112W 1641 nt16.81■□□□□ 0.28
LDB19Q12502 SCR1SCR1 522 nt16.66■□□□□ 0.26
LDB19Q12502 PET122YER153C 765 nt16.64■□□□□ 0.25
LDB19Q12502 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.34■□□□□ 0.21
LDB19Q12502 RTC3YHR087W 336 nt16.25■□□□□ 0.19
LDB19Q12502 YGR139WYGR139W 339 nt16.23■□□□□ 0.19
LDB19Q12502 RRN5YLR141W 1092 nt16.23■□□□□ 0.19
LDB19Q12502 RSB1YOR049C 1065 nt16.11■□□□□ 0.17
LDB19Q12502 RVS167YDR388W 1449 nt16.02■□□□□ 0.16
LDB19Q12502 PST2YDR032C 597 nt16■□□□□ 0.15
LDB19Q12502 VAR1Q0140 1197 nt16■□□□□ 0.15
LDB19Q12502 YBR190WYBR190W 312 nt15.97■□□□□ 0.15
LDB19Q12502 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.9■□□□□ 0.14
LDB19Q12502 YDJ1YNL064C 1230 nt15.77■□□□□ 0.12
LDB19Q12502 YKL097CYKL097C 411 nt15.74■□□□□ 0.11
LDB19Q12502 SHR5YOL110W 714 nt15.56■□□□□ 0.08
LDB19Q12502 GAR1YHR089C 618 nt15.4■□□□□ 0.06
LDB19Q12502 SHU1YHL006C 453 nt15.25■□□□□ 0.03
LDB19Q12502 DEP1YAL013W 1218 nt14.99□□□□□ -0.01
LDB19Q12502 YOR139CYOR139C 393 nt14.95□□□□□ -0.02
LDB19Q12502 YDR509WYDR509W 348 nt14.89□□□□□ -0.03
LDB19Q12502 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.88□□□□□ -0.03
LDB19Q12502 TIR1YER011W 765 nt14.83□□□□□ -0.04
LDB19Q12502 URN1YPR152C 1398 nt14.83□□□□□ -0.04
LDB19Q12502 YNL208WYNL208W 600 nt14.78□□□□□ -0.04
LDB19Q12502 NPL3YDR432W 1245 nt14.77□□□□□ -0.05
LDB19Q12502 RPN10YHR200W 807 nt14.73□□□□□ -0.05
LDB19Q12502 Q0017Q0017 162 nt14.68□□□□□ -0.06
LDB19Q12502 Q0142Q0142 177 nt14.51□□□□□ -0.09
LDB19Q12502 SSA1YAL005C 1929 nt14.51□□□□□ -0.09
LDB19Q12502 OPI9YLR338W 858 nt14.49□□□□□ -0.09
LDB19Q12502 MNP1YGL068W 585 nt14.38□□□□□ -0.11
LDB19Q12502 YGR021WYGR021W 873 nt14.37□□□□□ -0.11
LDB19Q12502 SAH1YER043C 1350 nt14.34□□□□□ -0.11
LDB19Q12502 SRB2YHR041C 633 nt14.34□□□□□ -0.11
LDB19Q12502 YOL037CYOL037C 354 nt14.34□□□□□ -0.11
LDB19Q12502 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.33□□□□□ -0.12
LDB19Q12502 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.33□□□□□ -0.12
LDB19Q12502 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.33□□□□□ -0.12
LDB19Q12502 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.33□□□□□ -0.12
LDB19Q12502 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.33□□□□□ -0.12
LDB19Q12502 HOM6YJR139C 1080 nt14.32□□□□□ -0.12
LDB19Q12502 CSM2YIL132C 642 nt14.31□□□□□ -0.12
LDB19Q12502 PAM17YKR065C 594 nt14.3□□□□□ -0.12
LDB19Q12502 NME1NME1 340 nt14.29□□□□□ -0.12
LDB19Q12502 WWM1YFL010C 636 nt14.28□□□□□ -0.12
LDB19Q12502 Q0144Q0144 330 nt14.26□□□□□ -0.13
LDB19Q12502 PAU21YOR394W 495 nt14.24□□□□□ -0.13
LDB19Q12502 PAU22YPL282C 495 nt14.24□□□□□ -0.13
LDB19Q12502 PUT4YOR348C 1884 nt14.2□□□□□ -0.14
LDB19Q12502 YJR018WYJR018W 363 nt14.16□□□□□ -0.14
LDB19Q12502 RKM5YLR137W 1104 nt14.12□□□□□ -0.15
LDB19Q12502 ARO7YPR060C 771 nt14.11□□□□□ -0.15
LDB19Q12502 PUN1YLR414C 792 nt14.09□□□□□ -0.15
LDB19Q12502 ARE1YCR048W 1833 nt14.07□□□□□ -0.16
LDB19Q12502 PUS2YGL063W 1113 nt14.07□□□□□ -0.16
LDB19Q12502 RPP2BYDR382W 333 nt14.06□□□□□ -0.16
LDB19Q12502 MOT3YMR070W 1473 nt14.03□□□□□ -0.16
LDB19Q12502 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.02□□□□□ -0.17
LDB19Q12502 BSC6YOL137W 1494 nt14□□□□□ -0.17
LDB19Q12502 BMT5YIL096C 1011 nt14□□□□□ -0.17
LDB19Q12502 YJR120WYJR120W 351 nt13.97□□□□□ -0.17
LDB19Q12502 YLR281CYLR281C 468 nt13.96□□□□□ -0.17
LDB19Q12502 SEM1YDR363W-A 270 nt13.95□□□□□ -0.18
LDB19Q12502 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.94□□□□□ -0.18
LDB19Q12502 SSA3YBL075C 1950 nt13.92□□□□□ -0.18
LDB19Q12502 BUR6YER159C 429 nt13.91□□□□□ -0.18
LDB19Q12502 REG2YBR050C 1017 nt13.9□□□□□ -0.18
LDB19Q12502 PTC2YER089C 1395 nt13.88□□□□□ -0.19
LDB19Q12502 POA1YBR022W 534 nt13.86□□□□□ -0.19
LDB19Q12502 WHI5YOR083W 888 nt13.85□□□□□ -0.19
LDB19Q12502 Q0255Q0255 1419 nt13.83□□□□□ -0.2
LDB19Q12502 BDH2YAL061W 1254 nt13.82□□□□□ -0.2
LDB19Q12502 YOR169CYOR169C 465 nt13.75□□□□□ -0.21
LDB19Q12502 LSM3YLR438C-A 270 nt13.74□□□□□ -0.21
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