Protein–RNA interactions for Protein: P38694

MSC7, Putative aldehyde dehydrogenase-like protein YHR039C, yeastyeast

Predictions only

Length 644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSC7P38694 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.15■■□□□ 1.14
MSC7P38694 NOP1YDL014W 984 nt21.92■■□□□ 1.1
MSC7P38694 NSR1YGR159C 1245 nt21.4■■□□□ 1.02
MSC7P38694 YKL036CYKL036C 393 nt20.83■□□□□ 0.93
MSC7P38694 YJL027CYJL027C 417 nt19.6■□□□□ 0.73
MSC7P38694 Q0297Q0297 156 nt19.32■□□□□ 0.68
MSC7P38694 SCS3YGL126W 1143 nt19.25■□□□□ 0.67
MSC7P38694 SRX1YKL086W 384 nt19.07■□□□□ 0.64
MSC7P38694 MDJ1YFL016C 1536 nt18.22■□□□□ 0.51
MSC7P38694 YCR051WYCR051W 669 nt18.18■□□□□ 0.5
MSC7P38694 SCJ1YMR214W 1134 nt18.06■□□□□ 0.48
MSC7P38694 YOL085CYOL085C 342 nt17.96■□□□□ 0.47
MSC7P38694 PKP1YIL042C 1185 nt17.58■□□□□ 0.4
MSC7P38694 ATS1YAL020C 1002 nt17.44■□□□□ 0.38
MSC7P38694 RPP1BYDL130W 321 nt17.35■□□□□ 0.37
MSC7P38694 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.77■□□□□ 0.28
MSC7P38694 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.77■□□□□ 0.28
MSC7P38694 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.77■□□□□ 0.28
MSC7P38694 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.77■□□□□ 0.28
MSC7P38694 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.77■□□□□ 0.28
MSC7P38694 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.77■□□□□ 0.28
MSC7P38694 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.77■□□□□ 0.28
MSC7P38694 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.77■□□□□ 0.28
MSC7P38694 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.77■□□□□ 0.28
MSC7P38694 CCC1YLR220W 969 nt16.65■□□□□ 0.26
MSC7P38694 SCR1SCR1 522 nt16.62■□□□□ 0.25
MSC7P38694 PET122YER153C 765 nt16.44■□□□□ 0.22
MSC7P38694 RTC3YHR087W 336 nt16.37■□□□□ 0.21
MSC7P38694 DBP2YNL112W 1641 nt16.34■□□□□ 0.21
MSC7P38694 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.12■□□□□ 0.17
MSC7P38694 RRN5YLR141W 1092 nt16.05■□□□□ 0.16
MSC7P38694 PST2YDR032C 597 nt16■□□□□ 0.15
MSC7P38694 RSB1YOR049C 1065 nt16■□□□□ 0.15
MSC7P38694 YKL097CYKL097C 411 nt15.84■□□□□ 0.13
MSC7P38694 RVS167YDR388W 1449 nt15.78■□□□□ 0.12
MSC7P38694 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.73■□□□□ 0.11
MSC7P38694 YDJ1YNL064C 1230 nt15.62■□□□□ 0.09
MSC7P38694 YBR190WYBR190W 312 nt15.43■□□□□ 0.06
MSC7P38694 SHR5YOL110W 714 nt15.31■□□□□ 0.04
MSC7P38694 SHU1YHL006C 453 nt15.16■□□□□ 0.02
MSC7P38694 GAR1YHR089C 618 nt15.14■□□□□ 0.01
MSC7P38694 YOR139CYOR139C 393 nt14.94□□□□□ -0.02
MSC7P38694 NPL3YDR432W 1245 nt14.81□□□□□ -0.04
MSC7P38694 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.69□□□□□ -0.06
MSC7P38694 TIR1YER011W 765 nt14.6□□□□□ -0.07
MSC7P38694 DEP1YAL013W 1218 nt14.58□□□□□ -0.08
MSC7P38694 YNL208WYNL208W 600 nt14.51□□□□□ -0.09
MSC7P38694 RPN10YHR200W 807 nt14.5□□□□□ -0.09
MSC7P38694 URN1YPR152C 1398 nt14.41□□□□□ -0.1
MSC7P38694 YOL037CYOL037C 354 nt14.36□□□□□ -0.11
MSC7P38694 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.33□□□□□ -0.12
MSC7P38694 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.33□□□□□ -0.12
MSC7P38694 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.33□□□□□ -0.12
MSC7P38694 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.33□□□□□ -0.12
MSC7P38694 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.33□□□□□ -0.12
MSC7P38694 YGR021WYGR021W 873 nt14.3□□□□□ -0.12
MSC7P38694 BSC6YOL137W 1494 nt14.28□□□□□ -0.12
MSC7P38694 SSA1YAL005C 1929 nt14.2□□□□□ -0.14
MSC7P38694 MNP1YGL068W 585 nt14.18□□□□□ -0.14
MSC7P38694 HOM6YJR139C 1080 nt14.17□□□□□ -0.14
MSC7P38694 PUT4YOR348C 1884 nt14.16□□□□□ -0.14
MSC7P38694 MOT3YMR070W 1473 nt14.09□□□□□ -0.15
MSC7P38694 OPI9YLR338W 858 nt14.05□□□□□ -0.16
MSC7P38694 WWM1YFL010C 636 nt14.04□□□□□ -0.16
MSC7P38694 PUS2YGL063W 1113 nt14.02□□□□□ -0.17
MSC7P38694 RKM5YLR137W 1104 nt13.99□□□□□ -0.17
MSC7P38694 SRB2YHR041C 633 nt13.96□□□□□ -0.17
MSC7P38694 YLR281CYLR281C 468 nt13.89□□□□□ -0.19
MSC7P38694 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.88□□□□□ -0.19
MSC7P38694 MRPL8YJL063C 717 nt13.87□□□□□ -0.19
MSC7P38694 ARE1YCR048W 1833 nt13.87□□□□□ -0.19
MSC7P38694 SSA3YBL075C 1950 nt13.87□□□□□ -0.19
MSC7P38694 SAH1YER043C 1350 nt13.86□□□□□ -0.19
MSC7P38694 RPP2BYDR382W 333 nt13.84□□□□□ -0.19
MSC7P38694 YJR018WYJR018W 363 nt13.81□□□□□ -0.2
MSC7P38694 WHI5YOR083W 888 nt13.74□□□□□ -0.21
MSC7P38694 PUN1YLR414C 792 nt13.71□□□□□ -0.21
MSC7P38694 POA1YBR022W 534 nt13.68□□□□□ -0.22
MSC7P38694 FMP45YDL222C 930 nt13.66□□□□□ -0.22
MSC7P38694 ADO1YJR105W 1023 nt13.66□□□□□ -0.22
MSC7P38694 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.65□□□□□ -0.22
MSC7P38694 YCH1YGR203W 447 nt13.6□□□□□ -0.23
MSC7P38694 BDH2YAL061W 1254 nt13.59□□□□□ -0.23
MSC7P38694 LSM3YLR438C-A 270 nt13.58□□□□□ -0.24
MSC7P38694 IMP2'YIL154C 1041 nt13.57□□□□□ -0.24
MSC7P38694 YJR120WYJR120W 351 nt13.57□□□□□ -0.24
MSC7P38694 DSK2YMR276W 1122 nt13.57□□□□□ -0.24
MSC7P38694 UBX6YJL048C 1191 nt13.52□□□□□ -0.25
MSC7P38694 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt13.44□□□□□ -0.26
MSC7P38694 YEL076CYEL076C 651 nt13.44□□□□□ -0.26
MSC7P38694 YLR464WYLR464W 651 nt13.44□□□□□ -0.26
MSC7P38694 YPR011CYPR011C 981 nt13.4□□□□□ -0.26
MSC7P38694 YLR236CYLR236C 324 nt13.37□□□□□ -0.27
MSC7P38694 PTC2YER089C 1395 nt13.35□□□□□ -0.27
MSC7P38694 BUD23YCR047C 828 nt13.3□□□□□ -0.28
MSC7P38694 INM2YDR287W 879 nt13.28□□□□□ -0.28
MSC7P38694 SIS1YNL007C 1059 nt13.27□□□□□ -0.29
MSC7P38694 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.26□□□□□ -0.29
MSC7P38694 TRM9YML014W 840 nt13.26□□□□□ -0.29
MSC7P38694 YBL100CYBL100C 315 nt13.23□□□□□ -0.29
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