Protein–RNA interactions for Protein: Q12262

MCM16, Inner kinetochore subunit MCM16, yeastyeast

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MCM16Q12262 NSR1YGR159C 1245 nt21.57■■□□□ 1.04
MCM16Q12262 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.31■■□□□ 1
MCM16Q12262 NOP1YDL014W 984 nt20.41■□□□□ 0.86
MCM16Q12262 MDJ1YFL016C 1536 nt19.75■□□□□ 0.75
MCM16Q12262 YKL036CYKL036C 393 nt18.41■□□□□ 0.54
MCM16Q12262 YJL027CYJL027C 417 nt18.09■□□□□ 0.49
MCM16Q12262 SRX1YKL086W 384 nt17.89■□□□□ 0.45
MCM16Q12262 Q0297Q0297 156 nt17.76■□□□□ 0.43
MCM16Q12262 DBP2YNL112W 1641 nt17.29■□□□□ 0.36
MCM16Q12262 YCR051WYCR051W 669 nt16.94■□□□□ 0.3
MCM16Q12262 YBR190WYBR190W 312 nt16.88■□□□□ 0.29
MCM16Q12262 SCS3YGL126W 1143 nt16.55■□□□□ 0.24
MCM16Q12262 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.52■□□□□ 0.24
MCM16Q12262 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.52■□□□□ 0.24
MCM16Q12262 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.52■□□□□ 0.24
MCM16Q12262 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.52■□□□□ 0.24
MCM16Q12262 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.52■□□□□ 0.24
MCM16Q12262 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.52■□□□□ 0.24
MCM16Q12262 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.52■□□□□ 0.24
MCM16Q12262 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.52■□□□□ 0.24
MCM16Q12262 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.52■□□□□ 0.24
MCM16Q12262 RTC3YHR087W 336 nt16.48■□□□□ 0.23
MCM16Q12262 CCC1YLR220W 969 nt16.35■□□□□ 0.21
MCM16Q12262 YOL085CYOL085C 342 nt16.01■□□□□ 0.15
MCM16Q12262 SSA3YBL075C 1950 nt16■□□□□ 0.15
MCM16Q12262 RVS167YDR388W 1449 nt15.97■□□□□ 0.15
MCM16Q12262 SCJ1YMR214W 1134 nt15.96■□□□□ 0.15
MCM16Q12262 RPP1BYDL130W 321 nt15.94■□□□□ 0.14
MCM16Q12262 PKP1YIL042C 1185 nt15.87■□□□□ 0.13
MCM16Q12262 PUT4YOR348C 1884 nt15.8■□□□□ 0.12
MCM16Q12262 Q0182Q0182 405 nt15.53■□□□□ 0.08
MCM16Q12262 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.46■□□□□ 0.07
MCM16Q12262 ARE1YCR048W 1833 nt15.36■□□□□ 0.05
MCM16Q12262 MOT3YMR070W 1473 nt15.36■□□□□ 0.05
MCM16Q12262 SHR5YOL110W 714 nt15.36■□□□□ 0.05
MCM16Q12262 PET122YER153C 765 nt15.35■□□□□ 0.05
MCM16Q12262 URN1YPR152C 1398 nt15.27■□□□□ 0.04
MCM16Q12262 POA1YBR022W 534 nt15.25■□□□□ 0.03
MCM16Q12262 SAH1YER043C 1350 nt15.22■□□□□ 0.03
MCM16Q12262 DEP1YAL013W 1218 nt15.16■□□□□ 0.02
MCM16Q12262 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.15■□□□□ 0.02
MCM16Q12262 OPI9YLR338W 858 nt15.14■□□□□ 0.01
MCM16Q12262 BSC6YOL137W 1494 nt15.02■□□□□ -0
MCM16Q12262 SCR1SCR1 522 nt14.93□□□□□ -0.02
MCM16Q12262 YDJ1YNL064C 1230 nt14.91□□□□□ -0.02
MCM16Q12262 RPN10YHR200W 807 nt14.83□□□□□ -0.04
MCM16Q12262 RRN5YLR141W 1092 nt14.83□□□□□ -0.04
MCM16Q12262 YNL208WYNL208W 600 nt14.79□□□□□ -0.04
MCM16Q12262 SPT5YML010W 3192 nt14.76□□□□□ -0.05
MCM16Q12262 BUD23YCR047C 828 nt14.74□□□□□ -0.05
MCM16Q12262 GAR1YHR089C 618 nt14.71□□□□□ -0.05
MCM16Q12262 PUN1YLR414C 792 nt14.66□□□□□ -0.06
MCM16Q12262 ATS1YAL020C 1002 nt14.64□□□□□ -0.07
MCM16Q12262 PTC2YER089C 1395 nt14.62□□□□□ -0.07
MCM16Q12262 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.54□□□□□ -0.08
MCM16Q12262 YJR018WYJR018W 363 nt14.52□□□□□ -0.09
MCM16Q12262 NAB2YGL122C 1578 nt14.47□□□□□ -0.09
MCM16Q12262 SSA4YER103W 1929 nt14.44□□□□□ -0.1
MCM16Q12262 RSB1YOR049C 1065 nt14.35□□□□□ -0.11
MCM16Q12262 YJR120WYJR120W 351 nt14.31□□□□□ -0.12
MCM16Q12262 FIS1YIL065C 468 nt14.29□□□□□ -0.12
MCM16Q12262 TIR1YER011W 765 nt14.23□□□□□ -0.13
MCM16Q12262 SSA1YAL005C 1929 nt14.21□□□□□ -0.14
MCM16Q12262 DAL1YIR027C 1383 nt14.19□□□□□ -0.14
MCM16Q12262 FPR4YLR449W 1179 nt14.16□□□□□ -0.14
MCM16Q12262 MEP2YNL142W 1500 nt14.14□□□□□ -0.15
MCM16Q12262 PHO4YFR034C 939 nt14.09□□□□□ -0.15
MCM16Q12262 INM2YDR287W 879 nt14.02□□□□□ -0.17
MCM16Q12262 RPP2BYDR382W 333 nt14.02□□□□□ -0.17
MCM16Q12262 YPS1YLR120C 1710 nt13.99□□□□□ -0.17
MCM16Q12262 SRB2YHR041C 633 nt13.98□□□□□ -0.17
MCM16Q12262 DCW1YKL046C 1350 nt13.96□□□□□ -0.17
MCM16Q12262 BDF1YLR399C 2061 nt13.95□□□□□ -0.18
MCM16Q12262 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.85□□□□□ -0.19
MCM16Q12262 YBL100CYBL100C 315 nt13.85□□□□□ -0.19
MCM16Q12262 YDR095CYDR095C 411 nt13.82□□□□□ -0.2
MCM16Q12262 YGR139WYGR139W 339 nt13.76□□□□□ -0.21
MCM16Q12262 TAT1YBR069C 1860 nt13.74□□□□□ -0.21
MCM16Q12262 EMI2YDR516C 1503 nt13.72□□□□□ -0.21
MCM16Q12262 BDH2YAL061W 1254 nt13.71□□□□□ -0.21
MCM16Q12262 NME1NME1 340 nt13.69□□□□□ -0.22
MCM16Q12262 FUN26YAL022C 1554 nt13.68□□□□□ -0.22
MCM16Q12262 YBR220CYBR220C 1683 nt13.66□□□□□ -0.22
MCM16Q12262 PST2YDR032C 597 nt13.65□□□□□ -0.22
MCM16Q12262 CAC2YML102W 1407 nt13.63□□□□□ -0.23
MCM16Q12262 PTP1YDL230W 1008 nt13.62□□□□□ -0.23
MCM16Q12262 YDL221WYDL221W 552 nt13.57□□□□□ -0.24
MCM16Q12262 YMR090WYMR090W 684 nt13.56□□□□□ -0.24
MCM16Q12262 WWM1YFL010C 636 nt13.55□□□□□ -0.24
MCM16Q12262 ALF1YNL148C 765 nt13.54□□□□□ -0.24
MCM16Q12262 RPP2AYOL039W 321 nt13.54□□□□□ -0.24
MCM16Q12262 TRM9YML014W 840 nt13.51□□□□□ -0.25
MCM16Q12262 SDH1YKL148C 1923 nt13.5□□□□□ -0.25
MCM16Q12262 CCT6YDR188W 1641 nt13.43□□□□□ -0.26
MCM16Q12262 IRC15YPL017C 1500 nt13.41□□□□□ -0.26
MCM16Q12262 LSM3YLR438C-A 270 nt13.4□□□□□ -0.26
MCM16Q12262 SIS1YNL007C 1059 nt13.39□□□□□ -0.27
MCM16Q12262 SCC4YER147C 1875 nt13.34□□□□□ -0.27
MCM16Q12262 GIS3YLR094C 1509 nt13.31□□□□□ -0.28
MCM16Q12262 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.1 ms