Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI54

PRO0628, Putative uncharacterized protein PRO0628, humanhuman

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRO0628Q9UI54 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRO0628Q9UI54 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRO0628Q9UI54 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRO0628Q9UI54 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRO0628Q9UI54 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRO0628Q9UI54 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRO0628Q9UI54 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRO0628Q9UI54 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRO0628Q9UI54 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRO0628Q9UI54 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRO0628Q9UI54 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRO0628Q9UI54 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRO0628Q9UI54 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRO0628Q9UI54 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRO0628Q9UI54 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRO0628Q9UI54 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRO0628Q9UI54 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRO0628Q9UI54 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRO0628Q9UI54 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRO0628Q9UI54 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRO0628Q9UI54 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRO0628Q9UI54 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRO0628Q9UI54 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRO0628Q9UI54 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRO0628Q9UI54 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRO0628Q9UI54 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRO0628Q9UI54 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRO0628Q9UI54 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRO0628Q9UI54 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRO0628Q9UI54 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRO0628Q9UI54 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRO0628Q9UI54 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRO0628Q9UI54 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRO0628Q9UI54 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRO0628Q9UI54 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRO0628Q9UI54 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRO0628Q9UI54 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PRO0628Q9UI54 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRO0628Q9UI54 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRO0628Q9UI54 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRO0628Q9UI54 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRO0628Q9UI54 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRO0628Q9UI54 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRO0628Q9UI54 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRO0628Q9UI54 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRO0628Q9UI54 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRO0628Q9UI54 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRO0628Q9UI54 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRO0628Q9UI54 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRO0628Q9UI54 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRO0628Q9UI54 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRO0628Q9UI54 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRO0628Q9UI54 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRO0628Q9UI54 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRO0628Q9UI54 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRO0628Q9UI54 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRO0628Q9UI54 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRO0628Q9UI54 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRO0628Q9UI54 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRO0628Q9UI54 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRO0628Q9UI54 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRO0628Q9UI54 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRO0628Q9UI54 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRO0628Q9UI54 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRO0628Q9UI54 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRO0628Q9UI54 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRO0628Q9UI54 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRO0628Q9UI54 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRO0628Q9UI54 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRO0628Q9UI54 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRO0628Q9UI54 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRO0628Q9UI54 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRO0628Q9UI54 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRO0628Q9UI54 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRO0628Q9UI54 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRO0628Q9UI54 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRO0628Q9UI54 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRO0628Q9UI54 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRO0628Q9UI54 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRO0628Q9UI54 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRO0628Q9UI54 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRO0628Q9UI54 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRO0628Q9UI54 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRO0628Q9UI54 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRO0628Q9UI54 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRO0628Q9UI54 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRO0628Q9UI54 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRO0628Q9UI54 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRO0628Q9UI54 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRO0628Q9UI54 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRO0628Q9UI54 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRO0628Q9UI54 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRO0628Q9UI54 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRO0628Q9UI54 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRO0628Q9UI54 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRO0628Q9UI54 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRO0628Q9UI54 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRO0628Q9UI54 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRO0628Q9UI54 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRO0628Q9UI54 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms