Protein–RNA interactions for Protein: Q5BLP8

C4orf48, Neuropeptide-like protein C4orf48, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48Q5BLP8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4orf48Q5BLP8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4orf48Q5BLP8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C4orf48Q5BLP8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C4orf48Q5BLP8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
C4orf48Q5BLP8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4orf48Q5BLP8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4orf48Q5BLP8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C4orf48Q5BLP8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4orf48Q5BLP8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4orf48Q5BLP8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C4orf48Q5BLP8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
C4orf48Q5BLP8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4orf48Q5BLP8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C4orf48Q5BLP8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C4orf48Q5BLP8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C4orf48Q5BLP8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf48Q5BLP8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C4orf48Q5BLP8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C4orf48Q5BLP8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4orf48Q5BLP8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C4orf48Q5BLP8 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
C4orf48Q5BLP8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C4orf48Q5BLP8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
C4orf48Q5BLP8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C4orf48Q5BLP8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C4orf48Q5BLP8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C4orf48Q5BLP8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C4orf48Q5BLP8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C4orf48Q5BLP8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C4orf48Q5BLP8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C4orf48Q5BLP8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4orf48Q5BLP8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4orf48Q5BLP8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4orf48Q5BLP8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
C4orf48Q5BLP8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4orf48Q5BLP8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4orf48Q5BLP8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4orf48Q5BLP8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf48Q5BLP8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf48Q5BLP8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf48Q5BLP8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf48Q5BLP8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4orf48Q5BLP8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4orf48Q5BLP8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf48Q5BLP8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4orf48Q5BLP8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C4orf48Q5BLP8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4orf48Q5BLP8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf48Q5BLP8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4orf48Q5BLP8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C4orf48Q5BLP8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C4orf48Q5BLP8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C4orf48Q5BLP8 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C4orf48Q5BLP8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C4orf48Q5BLP8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4orf48Q5BLP8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4orf48Q5BLP8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4orf48Q5BLP8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4orf48Q5BLP8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C4orf48Q5BLP8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4orf48Q5BLP8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf48Q5BLP8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4orf48Q5BLP8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C4orf48Q5BLP8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf48Q5BLP8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf48Q5BLP8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf48Q5BLP8 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf48Q5BLP8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf48Q5BLP8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4orf48Q5BLP8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4orf48Q5BLP8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4orf48Q5BLP8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4orf48Q5BLP8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C4orf48Q5BLP8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C4orf48Q5BLP8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C4orf48Q5BLP8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C4orf48Q5BLP8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf48Q5BLP8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf48Q5BLP8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf48Q5BLP8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C4orf48Q5BLP8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C4orf48Q5BLP8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4orf48Q5BLP8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4orf48Q5BLP8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C4orf48Q5BLP8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C4orf48Q5BLP8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4orf48Q5BLP8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4orf48Q5BLP8 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4orf48Q5BLP8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf48Q5BLP8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf48Q5BLP8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf48Q5BLP8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4orf48Q5BLP8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4orf48Q5BLP8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf48Q5BLP8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf48Q5BLP8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C4orf48Q5BLP8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C4orf48Q5BLP8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C4orf48Q5BLP8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms