Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.4 ms