RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355377.6

SYT17-201, Transcript of synaptotagmin 17, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYT17, Length 3,081 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17-201ENST00000355377 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.84■■■□□ 2.21
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SYT17-201ENST00000355377 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.49■■□□□ 1.67
SYT17-201ENST00000355377 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
SYT17-201ENST00000355377 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
SYT17-201ENST00000355377 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.26■■□□□ 1.63
SYT17-201ENST00000355377 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.88■■□□□ 1.57
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SYT17-201ENST00000355377 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.7■■□□□ 1.55
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SYT17-201ENST00000355377 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.4■■□□□ 1.5
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SYT17-201ENST00000355377 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa24.3■■□□□ 1.48
SYT17-201ENST00000355377 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.22■■□□□ 1.47
SYT17-201ENST00000355377 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
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SYT17-201ENST00000355377 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.81■■□□□ 1.24
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SYT17-201ENST00000355377 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.45■■□□□ 1.18
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SYT17-201ENST00000355377 NACADO15069 1562 aa22.37■■□□□ 1.17
SYT17-201ENST00000355377 WIZO95785 1651 aa22.36■■□□□ 1.17
SYT17-201ENST00000355377 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.3■■□□□ 1.16
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SYT17-201ENST00000355377 CEP162Q5TB80 1403 aa22.1■■□□□ 1.13
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SYT17-201ENST00000355377 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.01■■□□□ 1.11
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SYT17-201ENST00000355377 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.94■■□□□ 1.1
SYT17-201ENST00000355377 NEFLP07196 543 aa21.92■■□□□ 1.1
SYT17-201ENST00000355377 SMARCA2P51531 1590 aa21.9■■□□□ 1.1
SYT17-201ENST00000355377 SOGA1O94964 1423 aa21.9■■□□□ 1.1
SYT17-201ENST00000355377 MSH5O43196 834 aa21.88■■□□□ 1.09
SYT17-201ENST00000355377 SMARCA4P51532 1647 aa21.87■■□□□ 1.09
SYT17-201ENST00000355377 EEA1Q15075 1411 aa21.85■■□□□ 1.09
SYT17-201ENST00000355377 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SYT17-201ENST00000355377 APLP2Q06481 763 aa21.81■■□□□ 1.08
SYT17-201ENST00000355377 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.77■■□□□ 1.08
SYT17-201ENST00000355377 TRIM52Q96A61 297 aa21.74■■□□□ 1.07
SYT17-201ENST00000355377 GOLGA3Q08378 1498 aa21.72■■□□□ 1.07
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SYT17-201ENST00000355377 UNC13AQ9UPW8 1703 aa21.62■■□□□ 1.05
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SYT17-201ENST00000355377 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
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SYT17-201ENST00000355377 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.55■■□□□ 1.04
SYT17-201ENST00000355377 NBR1Q14596 966 aa21.54■■□□□ 1.04
SYT17-201ENST00000355377 KIF21BO75037 1637 aa21.54■■□□□ 1.04
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SYT17-201ENST00000355377 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
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SYT17-201ENST00000355377 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
SYT17-201ENST00000355377 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.42■■□□□ 1.02
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SYT17-201ENST00000355377 ANP32CO43423 234 aa21.36■■□□□ 1.01
SYT17-201ENST00000355377 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SYT17-201ENST00000355377 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.34■■□□□ 1.01
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SYT17-201ENST00000355377 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP21.3■■□□□ 1
SYT17-201ENST00000355377 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.29■■□□□ 1
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