RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285199.11

USP43-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 43, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP43, Length 4,169 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43-201ENST00000285199 NISCHQ9Y2I1 1504 aa26.92■■□□□ 1.9
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USP43-201ENST00000285199 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.4■■□□□ 1.82
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USP43-201ENST00000285199 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.8■■□□□ 1.72
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USP43-201ENST00000285199 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.73■■□□□ 1.55
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USP43-201ENST00000285199 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.48
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USP43-201ENST00000285199 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.94■■□□□ 1.26
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USP43-201ENST00000285199 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.17
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USP43-201ENST00000285199 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.98■■□□□ 1.11
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USP43-201ENST00000285199 ARID3CA6NKF2 412 aa21.9■■□□□ 1.1
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USP43-201ENST00000285199 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.63■■□□□ 1.05
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USP43-201ENST00000285199 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.55■■□□□ 1.04
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USP43-201ENST00000285199 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
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USP43-201ENST00000285199 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
USP43-201ENST00000285199 GOLGA3Q08378 1498 aa21.42■■□□□ 1.02
USP43-201ENST00000285199 ARXQ96QS3 562 aa21.41■■□□□ 1.02
USP43-201ENST00000285199 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.39■■□□□ 1.02
USP43-201ENST00000285199 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.38■■□□□ 1.01
USP43-201ENST00000285199 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
USP43-201ENST00000285199 ABCC8Q09428 1581 aa21.36■■□□□ 1.01
USP43-201ENST00000285199 TMC1Q8TDI8 760 aa21.33■■□□□ 1
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