RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284006.10

KCTD15-201, Transcript of potassium channel tetramerization domain containing 15, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene KCTD15, Length 4,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD15-201ENST00000284006 NISCHQ9Y2I1 1504 aa26.54■■□□□ 1.84
KCTD15-201ENST00000284006 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
KCTD15-201ENST00000284006 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.59■■□□□ 1.69
KCTD15-201ENST00000284006 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.23■■□□□ 1.63
KCTD15-201ENST00000284006 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.76■■□□□ 1.55
KCTD15-201ENST00000284006 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.31■■□□□ 1.48
KCTD15-201ENST00000284006 HRCP23327 699 aa24.27■■□□□ 1.47
KCTD15-201ENST00000284006 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
KCTD15-201ENST00000284006 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
KCTD15-201ENST00000284006 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
KCTD15-201ENST00000284006 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
KCTD15-201ENST00000284006 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
KCTD15-201ENST00000284006 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
KCTD15-201ENST00000284006 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.72■■□□□ 1.39
KCTD15-201ENST00000284006 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
KCTD15-201ENST00000284006 TRIM41Q8WV44 630 aa23.65■■□□□ 1.38
KCTD15-201ENST00000284006 MYT1Q01538 1121 aa23.64■■□□□ 1.37
KCTD15-201ENST00000284006 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
KCTD15-201ENST00000284006 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.54■■□□□ 1.36
KCTD15-201ENST00000284006 APLP2Q06481 763 aa23.43■■□□□ 1.34
KCTD15-201ENST00000284006 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
KCTD15-201ENST00000284006 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
KCTD15-201ENST00000284006 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
KCTD15-201ENST00000284006 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
KCTD15-201ENST00000284006 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
KCTD15-201ENST00000284006 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.89■■□□□ 1.25
KCTD15-201ENST00000284006 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.82■■□□□ 1.24
KCTD15-201ENST00000284006 NEFLP07196 543 aa22.75■■□□□ 1.23
KCTD15-201ENST00000284006 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
KCTD15-201ENST00000284006 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.64■■□□□ 1.22
KCTD15-201ENST00000284006 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
KCTD15-201ENST00000284006 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
KCTD15-201ENST00000284006 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.5■■□□□ 1.19
KCTD15-201ENST00000284006 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
KCTD15-201ENST00000284006 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
KCTD15-201ENST00000284006 NEUROD1Q13562 356 aa22.34■■□□□ 1.17
KCTD15-201ENST00000284006 ITGAEP38570 1179 aa22.29■■□□□ 1.16
KCTD15-201ENST00000284006 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
KCTD15-201ENST00000284006 BCANQ96GW7 911 aa22.11■■□□□ 1.13
KCTD15-201ENST00000284006 ABCC9O60706 1549 aa22.11■■□□□ 1.13
KCTD15-201ENST00000284006 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa22.01■■□□□ 1.11
KCTD15-201ENST00000284006 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.86■■□□□ 1.09
KCTD15-201ENST00000284006 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.83■■□□□ 1.09
KCTD15-201ENST00000284006 MIER1Q8N108 512 aa21.82■■□□□ 1.08
KCTD15-201ENST00000284006 ANP32CO43423 234 aa21.75■■□□□ 1.07
KCTD15-201ENST00000284006 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
KCTD15-201ENST00000284006 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
KCTD15-201ENST00000284006 POLR3GLQ9BT43 218 aa21.73■■□□□ 1.07
KCTD15-201ENST00000284006 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
KCTD15-201ENST00000284006 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
KCTD15-201ENST00000284006 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP21.69■■□□□ 1.06
KCTD15-201ENST00000284006 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
KCTD15-201ENST00000284006 FKBP8Q14318 412 aa21.68■■□□□ 1.06
KCTD15-201ENST00000284006 SCRIBQ14160 1630 aa21.55■■□□□ 1.04
KCTD15-201ENST00000284006 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
KCTD15-201ENST00000284006 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
KCTD15-201ENST00000284006 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.43■■□□□ 1.02
KCTD15-201ENST00000284006 TRIM52Q96A61 297 aa21.39■■□□□ 1.01
KCTD15-201ENST00000284006 CEP162Q5TB80 1403 aa21.39■■□□□ 1.01
KCTD15-201ENST00000284006 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.31■■□□□ 1
KCTD15-201ENST00000284006 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
KCTD15-201ENST00000284006 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
KCTD15-201ENST00000284006 CLIP1P30622 1438 aa21.25■□□□□ 0.99
KCTD15-201ENST00000284006 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.24■□□□□ 0.99
KCTD15-201ENST00000284006 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.2■□□□□ 0.98
KCTD15-201ENST00000284006 TONSLQ96HA7 1378 aa21.18■□□□□ 0.98
KCTD15-201ENST00000284006 P3H3Q8IVL6 736 aa21.18■□□□□ 0.98
KCTD15-201ENST00000284006 EEA1Q15075 1411 aa21.15■□□□□ 0.98
KCTD15-201ENST00000284006 GOLGA3Q08378 1498 aa21.15■□□□□ 0.98
KCTD15-201ENST00000284006 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.14■□□□□ 0.97
KCTD15-201ENST00000284006 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
KCTD15-201ENST00000284006 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
KCTD15-201ENST00000284006 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
KCTD15-201ENST00000284006 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
KCTD15-201ENST00000284006 NBR1Q14596 966 aa21.12■□□□□ 0.97
KCTD15-201ENST00000284006 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.1■□□□□ 0.97
KCTD15-201ENST00000284006 BCL11AQ9H165 835 aa21.06■□□□□ 0.96
KCTD15-201ENST00000284006 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
KCTD15-201ENST00000284006 CCDC136Q96JN2 1154 aa20.98■□□□□ 0.95
KCTD15-201ENST00000284006 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa20.96■□□□□ 0.95
KCTD15-201ENST00000284006 MRS2Q9HD23 443 aa20.93■□□□□ 0.94
KCTD15-201ENST00000284006 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
KCTD15-201ENST00000284006 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.91■□□□□ 0.94
KCTD15-201ENST00000284006 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
KCTD15-201ENST00000284006 SOGA1O94964 1423 aa20.9■□□□□ 0.94
KCTD15-201ENST00000284006 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.89■□□□□ 0.93
KCTD15-201ENST00000284006 CECR2Q9BXF3 1484 aa20.87■□□□□ 0.93
KCTD15-201ENST00000284006 NACADO15069 1562 aa20.86■□□□□ 0.93
KCTD15-201ENST00000284006 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.81■□□□□ 0.92
KCTD15-201ENST00000284006 ARID3CA6NKF2 412 aa20.8■□□□□ 0.92
KCTD15-201ENST00000284006 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
KCTD15-201ENST00000284006 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP20.77■□□□□ 0.926e-7■■■■□ 22.7
KCTD15-201ENST00000284006 TMC1Q8TDI8 760 aa20.77■□□□□ 0.91
KCTD15-201ENST00000284006 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.91
KCTD15-201ENST00000284006 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.76■□□□□ 0.91
KCTD15-201ENST00000284006 PPP4R2Q9NY27 417 aa20.76■□□□□ 0.91
KCTD15-201ENST00000284006 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.73■□□□□ 0.91
KCTD15-201ENST00000284006 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.72■□□□□ 0.91
KCTD15-201ENST00000284006 CANXP27824 592 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
KCTD15-201ENST00000284006 CCER2I3L3R5 266 aa20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.4 ms