RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555835.2

RNASE4-203, Transcript of ribonuclease A family member 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RNASE4, Length 2,520 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNASE4-203ENST00000555835 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.1■■■□□ 2.73
RNASE4-203ENST00000555835 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.56■■■□□ 2
RNASE4-203ENST00000555835 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
RNASE4-203ENST00000555835 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.85■■□□□ 1.89
RNASE4-203ENST00000555835 HRCP23327 699 aa26.47■■□□□ 1.83
RNASE4-203ENST00000555835 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.46■■□□□ 1.83
RNASE4-203ENST00000555835 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.44■■□□□ 1.82
RNASE4-203ENST00000555835 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
RNASE4-203ENST00000555835 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.95■■□□□ 1.74
RNASE4-203ENST00000555835 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.89■■□□□ 1.74
RNASE4-203ENST00000555835 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
RNASE4-203ENST00000555835 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.8■■□□□ 1.72
RNASE4-203ENST00000555835 SCRIBQ14160 1630 aa25.58■■□□□ 1.69
RNASE4-203ENST00000555835 ABCC9O60706 1549 aa25.58■■□□□ 1.68
RNASE4-203ENST00000555835 NACADO15069 1562 aa25.53■■□□□ 1.68
RNASE4-203ENST00000555835 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
RNASE4-203ENST00000555835 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
RNASE4-203ENST00000555835 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
RNASE4-203ENST00000555835 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.15■■□□□ 1.62
RNASE4-203ENST00000555835 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.11■■□□□ 1.61
RNASE4-203ENST00000555835 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
RNASE4-203ENST00000555835 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.96■■□□□ 1.59
RNASE4-203ENST00000555835 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
RNASE4-203ENST00000555835 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.87■■□□□ 1.57
RNASE4-203ENST00000555835 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.76■■□□□ 1.55
RNASE4-203ENST00000555835 WIZO95785 1651 aa24.72■■□□□ 1.55
RNASE4-203ENST00000555835 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
RNASE4-203ENST00000555835 TRIM41Q8WV44 630 aa24.52■■□□□ 1.52
RNASE4-203ENST00000555835 SMARCA4P51532 1647 aa24.52■■□□□ 1.52
RNASE4-203ENST00000555835 MYT1Q01538 1121 aa24.46■■□□□ 1.51
RNASE4-203ENST00000555835 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.44■■□□□ 1.5
RNASE4-203ENST00000555835 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
RNASE4-203ENST00000555835 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
RNASE4-203ENST00000555835 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.33■■□□□ 1.49
RNASE4-203ENST00000555835 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
RNASE4-203ENST00000555835 NEUROD1Q13562 356 aa24.3■■□□□ 1.48
RNASE4-203ENST00000555835 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.23■■□□□ 1.47
RNASE4-203ENST00000555835 SMARCA2P51531 1590 aa24.23■■□□□ 1.47
RNASE4-203ENST00000555835 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
RNASE4-203ENST00000555835 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.16■■□□□ 1.46
RNASE4-203ENST00000555835 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.15■■□□□ 1.46
RNASE4-203ENST00000555835 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
RNASE4-203ENST00000555835 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.04■■□□□ 1.44
RNASE4-203ENST00000555835 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
RNASE4-203ENST00000555835 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
RNASE4-203ENST00000555835 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
RNASE4-203ENST00000555835 ABCC8Q09428 1581 aa23.99■■□□□ 1.43
RNASE4-203ENST00000555835 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.95■■□□□ 1.42
RNASE4-203ENST00000555835 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
RNASE4-203ENST00000555835 SOGA1O94964 1423 aa23.71■■□□□ 1.39
RNASE4-203ENST00000555835 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.7■■□□□ 1.38
RNASE4-203ENST00000555835 EEA1Q15075 1411 aa23.68■■□□□ 1.38
RNASE4-203ENST00000555835 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
RNASE4-203ENST00000555835 NCAPD3P42695 1498 aa23.59■■□□□ 1.37
RNASE4-203ENST00000555835 SYNJ1O43426 1573 aa23.59■■□□□ 1.37
RNASE4-203ENST00000555835 HMGXB3Q12766 1538 aa23.59■■□□□ 1.37
RNASE4-203ENST00000555835 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.59■■□□□ 1.37
RNASE4-203ENST00000555835 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.58■■□□□ 1.37
RNASE4-203ENST00000555835 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
RNASE4-203ENST00000555835 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.51■■□□□ 1.35
RNASE4-203ENST00000555835 CEP162Q5TB80 1403 aa23.47■■□□□ 1.35
RNASE4-203ENST00000555835 GOLGA3Q08378 1498 aa23.43■■□□□ 1.34
RNASE4-203ENST00000555835 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
RNASE4-203ENST00000555835 TOP2BQ02880 1626 aa23.4■■□□□ 1.34
RNASE4-203ENST00000555835 MIER1Q8N108 512 aa23.39■■□□□ 1.34
RNASE4-203ENST00000555835 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
RNASE4-203ENST00000555835 KIF21BO75037 1637 aa23.36■■□□□ 1.33
RNASE4-203ENST00000555835 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.35■■□□□ 1.33
RNASE4-203ENST00000555835 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.34■■□□□ 1.33
RNASE4-203ENST00000555835 CFTRP13569 1480 aa23.29■■□□□ 1.32
RNASE4-203ENST00000555835 CUX1P39880 1505 aa23.2■■□□□ 1.3
RNASE4-203ENST00000555835 PRDM2Q13029 1718 aa23.17■■□□□ 1.3
RNASE4-203ENST00000555835 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.16■■□□□ 1.3
RNASE4-203ENST00000555835 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.12■■□□□ 1.29
RNASE4-203ENST00000555835 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.12■■□□□ 1.29
RNASE4-203ENST00000555835 CLIP1P30622 1438 aa23.11■■□□□ 1.29
RNASE4-203ENST00000555835 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.07■■□□□ 1.28
RNASE4-203ENST00000555835 PRXQ9BXM0 1461 aa23.06■■□□□ 1.28
RNASE4-203ENST00000555835 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.06■■□□□ 1.28
RNASE4-203ENST00000555835 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
RNASE4-203ENST00000555835 KIF27Q86VH2 1401 aa23.02■■□□□ 1.28
RNASE4-203ENST00000555835 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
RNASE4-203ENST00000555835 VPS8Q8N3P4 1428 aa23■■□□□ 1.27
RNASE4-203ENST00000555835 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.95■■□□□ 1.26
RNASE4-203ENST00000555835 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.92■■□□□ 1.26
RNASE4-203ENST00000555835 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
RNASE4-203ENST00000555835 CUX2O14529 1486 aa22.83■■□□□ 1.24
RNASE4-203ENST00000555835 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.83■■□□□ 1.24
RNASE4-203ENST00000555835 APLP2Q06481 763 aa22.82■■□□□ 1.24
RNASE4-203ENST00000555835 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.82■■□□□ 1.24
RNASE4-203ENST00000555835 BCL11AQ9H165 835 aa22.81■■□□□ 1.24
RNASE4-203ENST00000555835 ARAP1Q96P48 1450 aa22.79■■□□□ 1.24
RNASE4-203ENST00000555835 IGF1RP08069 1367 aa22.78■■□□□ 1.24
RNASE4-203ENST00000555835 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.71■■□□□ 1.23
RNASE4-203ENST00000555835 NESP48681 1621 aa22.7■■□□□ 1.22
RNASE4-203ENST00000555835 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.68■■□□□ 1.22
RNASE4-203ENST00000555835 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.67■■□□□ 1.22
RNASE4-203ENST00000555835 TOPBP1Q92547 1522 aa22.66■■□□□ 1.22
RNASE4-203ENST00000555835 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
RNASE4-203ENST00000555835 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 91 ms