Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5A7

NUB1, NEDD8 ultimate buster 1, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUB1Q9Y5A7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUB1Q9Y5A7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUB1Q9Y5A7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUB1Q9Y5A7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUB1Q9Y5A7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUB1Q9Y5A7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUB1Q9Y5A7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUB1Q9Y5A7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUB1Q9Y5A7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUB1Q9Y5A7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUB1Q9Y5A7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUB1Q9Y5A7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUB1Q9Y5A7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUB1Q9Y5A7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUB1Q9Y5A7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUB1Q9Y5A7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUB1Q9Y5A7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUB1Q9Y5A7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUB1Q9Y5A7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUB1Q9Y5A7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NUB1Q9Y5A7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUB1Q9Y5A7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUB1Q9Y5A7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUB1Q9Y5A7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUB1Q9Y5A7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUB1Q9Y5A7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUB1Q9Y5A7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.58■■■□□ 2
NUB1Q9Y5A7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUB1Q9Y5A7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUB1Q9Y5A7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NUB1Q9Y5A7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NUB1Q9Y5A7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUB1Q9Y5A7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NUB1Q9Y5A7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUB1Q9Y5A7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NUB1Q9Y5A7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NUB1Q9Y5A7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NUB1Q9Y5A7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NUB1Q9Y5A7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NUB1Q9Y5A7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NUB1Q9Y5A7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUB1Q9Y5A7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUB1Q9Y5A7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NUB1Q9Y5A7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NUB1Q9Y5A7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NUB1Q9Y5A7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NUB1Q9Y5A7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NUB1Q9Y5A7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NUB1Q9Y5A7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NUB1Q9Y5A7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NUB1Q9Y5A7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUB1Q9Y5A7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUB1Q9Y5A7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NUB1Q9Y5A7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NUB1Q9Y5A7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NUB1Q9Y5A7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUB1Q9Y5A7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUB1Q9Y5A7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUB1Q9Y5A7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUB1Q9Y5A7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUB1Q9Y5A7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUB1Q9Y5A7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NUB1Q9Y5A7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUB1Q9Y5A7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUB1Q9Y5A7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUB1Q9Y5A7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUB1Q9Y5A7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUB1Q9Y5A7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUB1Q9Y5A7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUB1Q9Y5A7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUB1Q9Y5A7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUB1Q9Y5A7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUB1Q9Y5A7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUB1Q9Y5A7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NUB1Q9Y5A7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUB1Q9Y5A7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUB1Q9Y5A7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUB1Q9Y5A7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NUB1Q9Y5A7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUB1Q9Y5A7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUB1Q9Y5A7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUB1Q9Y5A7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUB1Q9Y5A7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NUB1Q9Y5A7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUB1Q9Y5A7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUB1Q9Y5A7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUB1Q9Y5A7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUB1Q9Y5A7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUB1Q9Y5A7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NUB1Q9Y5A7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NUB1Q9Y5A7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
NUB1Q9Y5A7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUB1Q9Y5A7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUB1Q9Y5A7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUB1Q9Y5A7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUB1Q9Y5A7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUB1Q9Y5A7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUB1Q9Y5A7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUB1Q9Y5A7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUB1Q9Y5A7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms