Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y333

LSM2, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM2Q9Y333 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LSM2Q9Y333 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LSM2Q9Y333 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LSM2Q9Y333 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LSM2Q9Y333 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LSM2Q9Y333 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSM2Q9Y333 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSM2Q9Y333 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSM2Q9Y333 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LSM2Q9Y333 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LSM2Q9Y333 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LSM2Q9Y333 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LSM2Q9Y333 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSM2Q9Y333 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSM2Q9Y333 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSM2Q9Y333 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSM2Q9Y333 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSM2Q9Y333 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM2Q9Y333 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM2Q9Y333 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM2Q9Y333 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM2Q9Y333 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM2Q9Y333 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSM2Q9Y333 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSM2Q9Y333 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSM2Q9Y333 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSM2Q9Y333 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSM2Q9Y333 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LSM2Q9Y333 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LSM2Q9Y333 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSM2Q9Y333 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSM2Q9Y333 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSM2Q9Y333 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSM2Q9Y333 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSM2Q9Y333 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSM2Q9Y333 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSM2Q9Y333 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSM2Q9Y333 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSM2Q9Y333 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSM2Q9Y333 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM2Q9Y333 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM2Q9Y333 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM2Q9Y333 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM2Q9Y333 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM2Q9Y333 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSM2Q9Y333 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSM2Q9Y333 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSM2Q9Y333 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSM2Q9Y333 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSM2Q9Y333 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSM2Q9Y333 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSM2Q9Y333 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSM2Q9Y333 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSM2Q9Y333 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSM2Q9Y333 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSM2Q9Y333 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSM2Q9Y333 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSM2Q9Y333 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSM2Q9Y333 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSM2Q9Y333 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSM2Q9Y333 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSM2Q9Y333 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSM2Q9Y333 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSM2Q9Y333 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSM2Q9Y333 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSM2Q9Y333 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSM2Q9Y333 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSM2Q9Y333 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM2Q9Y333 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM2Q9Y333 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM2Q9Y333 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM2Q9Y333 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM2Q9Y333 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM2Q9Y333 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM2Q9Y333 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSM2Q9Y333 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSM2Q9Y333 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSM2Q9Y333 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSM2Q9Y333 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSM2Q9Y333 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSM2Q9Y333 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSM2Q9Y333 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSM2Q9Y333 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LSM2Q9Y333 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LSM2Q9Y333 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSM2Q9Y333 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSM2Q9Y333 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSM2Q9Y333 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSM2Q9Y333 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSM2Q9Y333 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSM2Q9Y333 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSM2Q9Y333 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSM2Q9Y333 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LSM2Q9Y333 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSM2Q9Y333 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSM2Q9Y333 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM2Q9Y333 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM2Q9Y333 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM2Q9Y333 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM2Q9Y333 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 246.7 ms