Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NOP58Q9Y2X3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
NOP58Q9Y2X3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
NOP58Q9Y2X3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NOP58Q9Y2X3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NOP58Q9Y2X3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NOP58Q9Y2X3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NOP58Q9Y2X3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NOP58Q9Y2X3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NOP58Q9Y2X3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NOP58Q9Y2X3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NOP58Q9Y2X3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NOP58Q9Y2X3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NOP58Q9Y2X3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NOP58Q9Y2X3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NOP58Q9Y2X3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NOP58Q9Y2X3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NOP58Q9Y2X3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
NOP58Q9Y2X3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NOP58Q9Y2X3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NOP58Q9Y2X3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NOP58Q9Y2X3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
NOP58Q9Y2X3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
NOP58Q9Y2X3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NOP58Q9Y2X3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NOP58Q9Y2X3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NOP58Q9Y2X3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NOP58Q9Y2X3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NOP58Q9Y2X3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NOP58Q9Y2X3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NOP58Q9Y2X3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NOP58Q9Y2X3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NOP58Q9Y2X3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NOP58Q9Y2X3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NOP58Q9Y2X3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NOP58Q9Y2X3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NOP58Q9Y2X3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NOP58Q9Y2X3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NOP58Q9Y2X3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NOP58Q9Y2X3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NOP58Q9Y2X3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NOP58Q9Y2X3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NOP58Q9Y2X3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NOP58Q9Y2X3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NOP58Q9Y2X3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NOP58Q9Y2X3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NOP58Q9Y2X3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NOP58Q9Y2X3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NOP58Q9Y2X3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NOP58Q9Y2X3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NOP58Q9Y2X3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NOP58Q9Y2X3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NOP58Q9Y2X3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NOP58Q9Y2X3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NOP58Q9Y2X3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NOP58Q9Y2X3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NOP58Q9Y2X3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
NOP58Q9Y2X3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NOP58Q9Y2X3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NOP58Q9Y2X3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NOP58Q9Y2X3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
NOP58Q9Y2X3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NOP58Q9Y2X3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NOP58Q9Y2X3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NOP58Q9Y2X3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NOP58Q9Y2X3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NOP58Q9Y2X3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NOP58Q9Y2X3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NOP58Q9Y2X3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NOP58Q9Y2X3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NOP58Q9Y2X3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
NOP58Q9Y2X3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NOP58Q9Y2X3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NOP58Q9Y2X3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NOP58Q9Y2X3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NOP58Q9Y2X3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NOP58Q9Y2X3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NOP58Q9Y2X3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NOP58Q9Y2X3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NOP58Q9Y2X3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NOP58Q9Y2X3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NOP58Q9Y2X3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NOP58Q9Y2X3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NOP58Q9Y2X3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NOP58Q9Y2X3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NOP58Q9Y2X3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
NOP58Q9Y2X3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
NOP58Q9Y2X3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NOP58Q9Y2X3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NOP58Q9Y2X3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NOP58Q9Y2X3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NOP58Q9Y2X3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NOP58Q9Y2X3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NOP58Q9Y2X3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NOP58Q9Y2X3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
NOP58Q9Y2X3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
NOP58Q9Y2X3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NOP58Q9Y2X3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC32■■■□□ 2.71
NOP58Q9Y2X3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC32■■■□□ 2.71
NOP58Q9Y2X3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms