Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL0

DDX25, ATP-dependent RNA helicase DDX25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX25Q9UHL0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX25Q9UHL0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX25Q9UHL0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX25Q9UHL0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX25Q9UHL0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX25Q9UHL0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX25Q9UHL0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX25Q9UHL0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX25Q9UHL0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX25Q9UHL0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX25Q9UHL0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX25Q9UHL0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX25Q9UHL0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX25Q9UHL0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX25Q9UHL0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX25Q9UHL0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX25Q9UHL0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX25Q9UHL0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDX25Q9UHL0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDX25Q9UHL0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDX25Q9UHL0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
DDX25Q9UHL0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDX25Q9UHL0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX25Q9UHL0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX25Q9UHL0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX25Q9UHL0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX25Q9UHL0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX25Q9UHL0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX25Q9UHL0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX25Q9UHL0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDX25Q9UHL0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDX25Q9UHL0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDX25Q9UHL0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDX25Q9UHL0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
DDX25Q9UHL0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX25Q9UHL0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX25Q9UHL0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX25Q9UHL0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX25Q9UHL0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX25Q9UHL0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDX25Q9UHL0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDX25Q9UHL0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDX25Q9UHL0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDX25Q9UHL0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDX25Q9UHL0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX25Q9UHL0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX25Q9UHL0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX25Q9UHL0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX25Q9UHL0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX25Q9UHL0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
DDX25Q9UHL0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DDX25Q9UHL0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DDX25Q9UHL0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDX25Q9UHL0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDX25Q9UHL0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDX25Q9UHL0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDX25Q9UHL0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDX25Q9UHL0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDX25Q9UHL0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDX25Q9UHL0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDX25Q9UHL0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
DDX25Q9UHL0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DDX25Q9UHL0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DDX25Q9UHL0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DDX25Q9UHL0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DDX25Q9UHL0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DDX25Q9UHL0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DDX25Q9UHL0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
DDX25Q9UHL0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DDX25Q9UHL0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDX25Q9UHL0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDX25Q9UHL0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDX25Q9UHL0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDX25Q9UHL0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDX25Q9UHL0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DDX25Q9UHL0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
DDX25Q9UHL0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DDX25Q9UHL0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DDX25Q9UHL0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDX25Q9UHL0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDX25Q9UHL0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDX25Q9UHL0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDX25Q9UHL0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDX25Q9UHL0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
DDX25Q9UHL0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
DDX25Q9UHL0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DDX25Q9UHL0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DDX25Q9UHL0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DDX25Q9UHL0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDX25Q9UHL0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDX25Q9UHL0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDX25Q9UHL0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDX25Q9UHL0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDX25Q9UHL0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDX25Q9UHL0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDX25Q9UHL0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDX25Q9UHL0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
DDX25Q9UHL0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDX25Q9UHL0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDX25Q9UHL0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms