Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB6

NCDN, Neurochondrin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCDNQ9UBB6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCDNQ9UBB6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NCDNQ9UBB6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCDNQ9UBB6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCDNQ9UBB6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCDNQ9UBB6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCDNQ9UBB6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NCDNQ9UBB6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCDNQ9UBB6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NCDNQ9UBB6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCDNQ9UBB6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NCDNQ9UBB6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCDNQ9UBB6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCDNQ9UBB6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCDNQ9UBB6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCDNQ9UBB6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCDNQ9UBB6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCDNQ9UBB6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCDNQ9UBB6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCDNQ9UBB6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCDNQ9UBB6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCDNQ9UBB6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCDNQ9UBB6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCDNQ9UBB6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCDNQ9UBB6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCDNQ9UBB6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCDNQ9UBB6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCDNQ9UBB6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NCDNQ9UBB6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCDNQ9UBB6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCDNQ9UBB6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCDNQ9UBB6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCDNQ9UBB6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCDNQ9UBB6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCDNQ9UBB6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCDNQ9UBB6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NCDNQ9UBB6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NCDNQ9UBB6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCDNQ9UBB6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCDNQ9UBB6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NCDNQ9UBB6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCDNQ9UBB6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NCDNQ9UBB6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NCDNQ9UBB6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCDNQ9UBB6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCDNQ9UBB6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCDNQ9UBB6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCDNQ9UBB6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCDNQ9UBB6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCDNQ9UBB6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NCDNQ9UBB6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCDNQ9UBB6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCDNQ9UBB6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCDNQ9UBB6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NCDNQ9UBB6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NCDNQ9UBB6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCDNQ9UBB6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCDNQ9UBB6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCDNQ9UBB6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NCDNQ9UBB6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCDNQ9UBB6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCDNQ9UBB6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCDNQ9UBB6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCDNQ9UBB6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCDNQ9UBB6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCDNQ9UBB6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NCDNQ9UBB6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCDNQ9UBB6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NCDNQ9UBB6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCDNQ9UBB6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCDNQ9UBB6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCDNQ9UBB6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCDNQ9UBB6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NCDNQ9UBB6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCDNQ9UBB6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCDNQ9UBB6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCDNQ9UBB6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCDNQ9UBB6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCDNQ9UBB6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCDNQ9UBB6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCDNQ9UBB6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCDNQ9UBB6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCDNQ9UBB6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCDNQ9UBB6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCDNQ9UBB6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCDNQ9UBB6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCDNQ9UBB6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCDNQ9UBB6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCDNQ9UBB6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCDNQ9UBB6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCDNQ9UBB6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCDNQ9UBB6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCDNQ9UBB6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCDNQ9UBB6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCDNQ9UBB6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCDNQ9UBB6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCDNQ9UBB6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCDNQ9UBB6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NCDNQ9UBB6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCDNQ9UBB6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.4 ms