Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
COL20A1Q9P218 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
COL20A1Q9P218 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
COL20A1Q9P218 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
COL20A1Q9P218 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
COL20A1Q9P218 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
COL20A1Q9P218 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
COL20A1Q9P218 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
COL20A1Q9P218 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
COL20A1Q9P218 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
COL20A1Q9P218 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
COL20A1Q9P218 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL20A1Q9P218 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL20A1Q9P218 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
COL20A1Q9P218 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
COL20A1Q9P218 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL20A1Q9P218 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL20A1Q9P218 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL20A1Q9P218 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL20A1Q9P218 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL20A1Q9P218 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL20A1Q9P218 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL20A1Q9P218 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
COL20A1Q9P218 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
COL20A1Q9P218 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
COL20A1Q9P218 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
COL20A1Q9P218 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL20A1Q9P218 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL20A1Q9P218 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL20A1Q9P218 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL20A1Q9P218 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL20A1Q9P218 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL20A1Q9P218 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL20A1Q9P218 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL20A1Q9P218 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL20A1Q9P218 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL20A1Q9P218 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL20A1Q9P218 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
COL20A1Q9P218 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL20A1Q9P218 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL20A1Q9P218 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL20A1Q9P218 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL20A1Q9P218 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL20A1Q9P218 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL20A1Q9P218 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
COL20A1Q9P218 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL20A1Q9P218 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL20A1Q9P218 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL20A1Q9P218 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL20A1Q9P218 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL20A1Q9P218 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL20A1Q9P218 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL20A1Q9P218 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL20A1Q9P218 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL20A1Q9P218 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
COL20A1Q9P218 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
COL20A1Q9P218 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
COL20A1Q9P218 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
COL20A1Q9P218 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
COL20A1Q9P218 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
COL20A1Q9P218 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
COL20A1Q9P218 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL20A1Q9P218 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL20A1Q9P218 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL20A1Q9P218 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL20A1Q9P218 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL20A1Q9P218 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL20A1Q9P218 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL20A1Q9P218 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL20A1Q9P218 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL20A1Q9P218 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL20A1Q9P218 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL20A1Q9P218 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
COL20A1Q9P218 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL20A1Q9P218 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
COL20A1Q9P218 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
COL20A1Q9P218 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
COL20A1Q9P218 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
COL20A1Q9P218 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
COL20A1Q9P218 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL20A1Q9P218 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL20A1Q9P218 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL20A1Q9P218 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL20A1Q9P218 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL20A1Q9P218 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL20A1Q9P218 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
COL20A1Q9P218 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
COL20A1Q9P218 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
COL20A1Q9P218 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL20A1Q9P218 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL20A1Q9P218 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL20A1Q9P218 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
COL20A1Q9P218 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
COL20A1Q9P218 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
COL20A1Q9P218 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
COL20A1Q9P218 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
COL20A1Q9P218 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
COL20A1Q9P218 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
COL20A1Q9P218 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL20A1Q9P218 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms