Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN8

CNOT2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT2Q9NZN8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNOT2Q9NZN8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT2Q9NZN8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT2Q9NZN8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT2Q9NZN8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT2Q9NZN8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT2Q9NZN8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT2Q9NZN8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT2Q9NZN8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT2Q9NZN8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT2Q9NZN8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT2Q9NZN8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT2Q9NZN8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT2Q9NZN8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT2Q9NZN8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT2Q9NZN8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT2Q9NZN8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT2Q9NZN8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT2Q9NZN8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT2Q9NZN8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNOT2Q9NZN8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNOT2Q9NZN8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNOT2Q9NZN8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNOT2Q9NZN8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNOT2Q9NZN8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT2Q9NZN8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT2Q9NZN8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT2Q9NZN8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT2Q9NZN8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNOT2Q9NZN8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNOT2Q9NZN8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNOT2Q9NZN8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNOT2Q9NZN8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNOT2Q9NZN8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNOT2Q9NZN8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT2Q9NZN8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT2Q9NZN8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT2Q9NZN8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT2Q9NZN8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT2Q9NZN8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT2Q9NZN8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT2Q9NZN8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT2Q9NZN8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT2Q9NZN8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT2Q9NZN8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT2Q9NZN8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT2Q9NZN8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT2Q9NZN8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT2Q9NZN8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT2Q9NZN8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT2Q9NZN8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT2Q9NZN8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT2Q9NZN8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT2Q9NZN8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT2Q9NZN8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT2Q9NZN8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT2Q9NZN8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT2Q9NZN8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT2Q9NZN8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNOT2Q9NZN8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT2Q9NZN8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT2Q9NZN8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT2Q9NZN8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT2Q9NZN8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT2Q9NZN8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT2Q9NZN8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT2Q9NZN8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT2Q9NZN8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT2Q9NZN8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT2Q9NZN8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT2Q9NZN8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT2Q9NZN8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT2Q9NZN8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT2Q9NZN8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT2Q9NZN8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT2Q9NZN8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT2Q9NZN8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT2Q9NZN8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT2Q9NZN8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT2Q9NZN8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT2Q9NZN8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT2Q9NZN8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT2Q9NZN8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT2Q9NZN8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT2Q9NZN8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT2Q9NZN8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT2Q9NZN8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT2Q9NZN8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT2Q9NZN8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT2Q9NZN8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT2Q9NZN8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT2Q9NZN8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT2Q9NZN8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT2Q9NZN8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNOT2Q9NZN8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNOT2Q9NZN8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNOT2Q9NZN8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT2Q9NZN8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT2Q9NZN8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT2Q9NZN8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms