Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZG7

NINJ2, Ninjurin-2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINJ2Q9NZG7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NINJ2Q9NZG7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NINJ2Q9NZG7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NINJ2Q9NZG7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NINJ2Q9NZG7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NINJ2Q9NZG7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NINJ2Q9NZG7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NINJ2Q9NZG7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NINJ2Q9NZG7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NINJ2Q9NZG7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NINJ2Q9NZG7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NINJ2Q9NZG7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NINJ2Q9NZG7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NINJ2Q9NZG7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NINJ2Q9NZG7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NINJ2Q9NZG7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NINJ2Q9NZG7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NINJ2Q9NZG7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NINJ2Q9NZG7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NINJ2Q9NZG7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NINJ2Q9NZG7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NINJ2Q9NZG7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NINJ2Q9NZG7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NINJ2Q9NZG7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NINJ2Q9NZG7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NINJ2Q9NZG7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NINJ2Q9NZG7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NINJ2Q9NZG7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NINJ2Q9NZG7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NINJ2Q9NZG7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NINJ2Q9NZG7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NINJ2Q9NZG7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NINJ2Q9NZG7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NINJ2Q9NZG7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NINJ2Q9NZG7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NINJ2Q9NZG7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NINJ2Q9NZG7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NINJ2Q9NZG7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NINJ2Q9NZG7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NINJ2Q9NZG7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NINJ2Q9NZG7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NINJ2Q9NZG7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NINJ2Q9NZG7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NINJ2Q9NZG7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NINJ2Q9NZG7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NINJ2Q9NZG7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NINJ2Q9NZG7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NINJ2Q9NZG7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NINJ2Q9NZG7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NINJ2Q9NZG7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NINJ2Q9NZG7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NINJ2Q9NZG7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NINJ2Q9NZG7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NINJ2Q9NZG7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NINJ2Q9NZG7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NINJ2Q9NZG7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NINJ2Q9NZG7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NINJ2Q9NZG7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NINJ2Q9NZG7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NINJ2Q9NZG7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NINJ2Q9NZG7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NINJ2Q9NZG7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NINJ2Q9NZG7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NINJ2Q9NZG7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NINJ2Q9NZG7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NINJ2Q9NZG7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NINJ2Q9NZG7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NINJ2Q9NZG7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NINJ2Q9NZG7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NINJ2Q9NZG7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NINJ2Q9NZG7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NINJ2Q9NZG7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NINJ2Q9NZG7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NINJ2Q9NZG7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NINJ2Q9NZG7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NINJ2Q9NZG7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NINJ2Q9NZG7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NINJ2Q9NZG7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NINJ2Q9NZG7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NINJ2Q9NZG7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NINJ2Q9NZG7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NINJ2Q9NZG7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NINJ2Q9NZG7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NINJ2Q9NZG7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NINJ2Q9NZG7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NINJ2Q9NZG7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NINJ2Q9NZG7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NINJ2Q9NZG7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NINJ2Q9NZG7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NINJ2Q9NZG7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NINJ2Q9NZG7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NINJ2Q9NZG7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NINJ2Q9NZG7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NINJ2Q9NZG7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NINJ2Q9NZG7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NINJ2Q9NZG7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NINJ2Q9NZG7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NINJ2Q9NZG7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NINJ2Q9NZG7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NINJ2Q9NZG7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms