Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMEM248Q9NWD8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM248Q9NWD8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM248Q9NWD8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM248Q9NWD8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM248Q9NWD8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM248Q9NWD8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM248Q9NWD8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM248Q9NWD8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM248Q9NWD8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM248Q9NWD8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM248Q9NWD8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM248Q9NWD8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM248Q9NWD8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM248Q9NWD8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM248Q9NWD8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM248Q9NWD8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM248Q9NWD8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM248Q9NWD8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM248Q9NWD8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM248Q9NWD8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM248Q9NWD8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM248Q9NWD8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM248Q9NWD8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM248Q9NWD8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM248Q9NWD8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM248Q9NWD8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM248Q9NWD8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM248Q9NWD8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM248Q9NWD8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM248Q9NWD8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM248Q9NWD8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM248Q9NWD8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM248Q9NWD8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM248Q9NWD8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM248Q9NWD8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM248Q9NWD8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM248Q9NWD8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM248Q9NWD8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM248Q9NWD8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM248Q9NWD8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM248Q9NWD8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM248Q9NWD8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM248Q9NWD8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM248Q9NWD8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM248Q9NWD8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM248Q9NWD8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TMEM248Q9NWD8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM248Q9NWD8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM248Q9NWD8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM248Q9NWD8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM248Q9NWD8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM248Q9NWD8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM248Q9NWD8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM248Q9NWD8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM248Q9NWD8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM248Q9NWD8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM248Q9NWD8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM248Q9NWD8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM248Q9NWD8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM248Q9NWD8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM248Q9NWD8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM248Q9NWD8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM248Q9NWD8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM248Q9NWD8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM248Q9NWD8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM248Q9NWD8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM248Q9NWD8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM248Q9NWD8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM248Q9NWD8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM248Q9NWD8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM248Q9NWD8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM248Q9NWD8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM248Q9NWD8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM248Q9NWD8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM248Q9NWD8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM248Q9NWD8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM248Q9NWD8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM248Q9NWD8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM248Q9NWD8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM248Q9NWD8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM248Q9NWD8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TMEM248Q9NWD8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM248Q9NWD8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM248Q9NWD8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM248Q9NWD8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM248Q9NWD8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM248Q9NWD8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM248Q9NWD8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM248Q9NWD8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM248Q9NWD8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM248Q9NWD8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM248Q9NWD8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM248Q9NWD8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM248Q9NWD8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM248Q9NWD8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM248Q9NWD8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM248Q9NWD8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM248Q9NWD8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMEM248Q9NWD8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.5 ms