Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY4

ARHGAP35, Rho GTPase-activating protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP35Q9NRY4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
ARHGAP35Q9NRY4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
ARHGAP35Q9NRY4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC40.85■■■■■ 4.13
ARHGAP35Q9NRY4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
ARHGAP35Q9NRY4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
ARHGAP35Q9NRY4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
ARHGAP35Q9NRY4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
ARHGAP35Q9NRY4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
ARHGAP35Q9NRY4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC40.83■■■■■ 4.13
ARHGAP35Q9NRY4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
ARHGAP35Q9NRY4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
ARHGAP35Q9NRY4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
ARHGAP35Q9NRY4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
ARHGAP35Q9NRY4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
ARHGAP35Q9NRY4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC40.81■■■■■ 4.12
ARHGAP35Q9NRY4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
ARHGAP35Q9NRY4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
ARHGAP35Q9NRY4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC40.79■■■■■ 4.12
ARHGAP35Q9NRY4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC40.79■■■■■ 4.12
ARHGAP35Q9NRY4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.79■■■■■ 4.12
ARHGAP35Q9NRY4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
ARHGAP35Q9NRY4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC40.78■■■■■ 4.12
ARHGAP35Q9NRY4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
ARHGAP35Q9NRY4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
ARHGAP35Q9NRY4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
ARHGAP35Q9NRY4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC40.77■■■■■ 4.12
ARHGAP35Q9NRY4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC40.77■■■■■ 4.12
ARHGAP35Q9NRY4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC40.77■■■■■ 4.12
ARHGAP35Q9NRY4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
ARHGAP35Q9NRY4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
ARHGAP35Q9NRY4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
ARHGAP35Q9NRY4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.11
ARHGAP35Q9NRY4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
ARHGAP35Q9NRY4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
ARHGAP35Q9NRY4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
ARHGAP35Q9NRY4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
ARHGAP35Q9NRY4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
ARHGAP35Q9NRY4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
ARHGAP35Q9NRY4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
ARHGAP35Q9NRY4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
ARHGAP35Q9NRY4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
ARHGAP35Q9NRY4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
ARHGAP35Q9NRY4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
ARHGAP35Q9NRY4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
ARHGAP35Q9NRY4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
ARHGAP35Q9NRY4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC40.71■■■■■ 4.11
ARHGAP35Q9NRY4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
ARHGAP35Q9NRY4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
ARHGAP35Q9NRY4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
ARHGAP35Q9NRY4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC40.68■■■■■ 4.1
ARHGAP35Q9NRY4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
ARHGAP35Q9NRY4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
ARHGAP35Q9NRY4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
ARHGAP35Q9NRY4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
ARHGAP35Q9NRY4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
ARHGAP35Q9NRY4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
ARHGAP35Q9NRY4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
ARHGAP35Q9NRY4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
ARHGAP35Q9NRY4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
ARHGAP35Q9NRY4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
ARHGAP35Q9NRY4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.09
ARHGAP35Q9NRY4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC40.63■■■■■ 4.09
ARHGAP35Q9NRY4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC40.63■■■■■ 4.09
ARHGAP35Q9NRY4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
ARHGAP35Q9NRY4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC40.62■■■■■ 4.09
ARHGAP35Q9NRY4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
ARHGAP35Q9NRY4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
ARHGAP35Q9NRY4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
ARHGAP35Q9NRY4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
ARHGAP35Q9NRY4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
ARHGAP35Q9NRY4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
ARHGAP35Q9NRY4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
ARHGAP35Q9NRY4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
ARHGAP35Q9NRY4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
ARHGAP35Q9NRY4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
ARHGAP35Q9NRY4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
ARHGAP35Q9NRY4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC40.55■■■■■ 4.08
ARHGAP35Q9NRY4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC40.55■■■■■ 4.08
ARHGAP35Q9NRY4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
ARHGAP35Q9NRY4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
ARHGAP35Q9NRY4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
ARHGAP35Q9NRY4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
ARHGAP35Q9NRY4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
ARHGAP35Q9NRY4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
ARHGAP35Q9NRY4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC40.5■■■■■ 4.07
ARHGAP35Q9NRY4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
ARHGAP35Q9NRY4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC40.49■■■■■ 4.07
ARHGAP35Q9NRY4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
ARHGAP35Q9NRY4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC40.48■■■■■ 4.07
ARHGAP35Q9NRY4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
ARHGAP35Q9NRY4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
ARHGAP35Q9NRY4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC40.47■■■■■ 4.07
ARHGAP35Q9NRY4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
ARHGAP35Q9NRY4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
ARHGAP35Q9NRY4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
ARHGAP35Q9NRY4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
ARHGAP35Q9NRY4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
ARHGAP35Q9NRY4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
ARHGAP35Q9NRY4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
ARHGAP35Q9NRY4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms