Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPHK2Q9NRA0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPHK2Q9NRA0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPHK2Q9NRA0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPHK2Q9NRA0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPHK2Q9NRA0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPHK2Q9NRA0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPHK2Q9NRA0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SPHK2Q9NRA0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPHK2Q9NRA0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPHK2Q9NRA0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPHK2Q9NRA0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPHK2Q9NRA0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPHK2Q9NRA0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SPHK2Q9NRA0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPHK2Q9NRA0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPHK2Q9NRA0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SPHK2Q9NRA0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPHK2Q9NRA0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPHK2Q9NRA0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPHK2Q9NRA0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPHK2Q9NRA0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SPHK2Q9NRA0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPHK2Q9NRA0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPHK2Q9NRA0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPHK2Q9NRA0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPHK2Q9NRA0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SPHK2Q9NRA0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPHK2Q9NRA0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPHK2Q9NRA0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPHK2Q9NRA0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPHK2Q9NRA0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPHK2Q9NRA0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SPHK2Q9NRA0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPHK2Q9NRA0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPHK2Q9NRA0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SPHK2Q9NRA0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPHK2Q9NRA0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPHK2Q9NRA0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPHK2Q9NRA0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPHK2Q9NRA0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SPHK2Q9NRA0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPHK2Q9NRA0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPHK2Q9NRA0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPHK2Q9NRA0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPHK2Q9NRA0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SPHK2Q9NRA0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SPHK2Q9NRA0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPHK2Q9NRA0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPHK2Q9NRA0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPHK2Q9NRA0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPHK2Q9NRA0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPHK2Q9NRA0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPHK2Q9NRA0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SPHK2Q9NRA0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPHK2Q9NRA0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPHK2Q9NRA0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPHK2Q9NRA0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPHK2Q9NRA0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SPHK2Q9NRA0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPHK2Q9NRA0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPHK2Q9NRA0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPHK2Q9NRA0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPHK2Q9NRA0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SPHK2Q9NRA0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPHK2Q9NRA0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPHK2Q9NRA0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPHK2Q9NRA0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPHK2Q9NRA0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPHK2Q9NRA0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPHK2Q9NRA0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPHK2Q9NRA0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPHK2Q9NRA0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPHK2Q9NRA0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPHK2Q9NRA0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPHK2Q9NRA0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPHK2Q9NRA0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPHK2Q9NRA0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPHK2Q9NRA0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPHK2Q9NRA0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPHK2Q9NRA0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPHK2Q9NRA0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPHK2Q9NRA0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPHK2Q9NRA0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPHK2Q9NRA0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPHK2Q9NRA0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPHK2Q9NRA0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPHK2Q9NRA0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPHK2Q9NRA0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPHK2Q9NRA0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SPHK2Q9NRA0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPHK2Q9NRA0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPHK2Q9NRA0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPHK2Q9NRA0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SPHK2Q9NRA0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPHK2Q9NRA0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPHK2Q9NRA0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPHK2Q9NRA0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SPHK2Q9NRA0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPHK2Q9NRA0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms