Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT6

FSCN3, Fascin-3, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN3Q9NQT6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FSCN3Q9NQT6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FSCN3Q9NQT6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FSCN3Q9NQT6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FSCN3Q9NQT6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FSCN3Q9NQT6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FSCN3Q9NQT6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FSCN3Q9NQT6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FSCN3Q9NQT6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FSCN3Q9NQT6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FSCN3Q9NQT6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FSCN3Q9NQT6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FSCN3Q9NQT6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FSCN3Q9NQT6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FSCN3Q9NQT6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FSCN3Q9NQT6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FSCN3Q9NQT6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FSCN3Q9NQT6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FSCN3Q9NQT6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FSCN3Q9NQT6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FSCN3Q9NQT6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FSCN3Q9NQT6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FSCN3Q9NQT6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FSCN3Q9NQT6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FSCN3Q9NQT6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FSCN3Q9NQT6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FSCN3Q9NQT6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FSCN3Q9NQT6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FSCN3Q9NQT6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FSCN3Q9NQT6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FSCN3Q9NQT6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FSCN3Q9NQT6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FSCN3Q9NQT6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FSCN3Q9NQT6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FSCN3Q9NQT6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FSCN3Q9NQT6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FSCN3Q9NQT6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FSCN3Q9NQT6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FSCN3Q9NQT6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FSCN3Q9NQT6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FSCN3Q9NQT6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FSCN3Q9NQT6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FSCN3Q9NQT6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FSCN3Q9NQT6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FSCN3Q9NQT6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FSCN3Q9NQT6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FSCN3Q9NQT6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FSCN3Q9NQT6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FSCN3Q9NQT6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FSCN3Q9NQT6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FSCN3Q9NQT6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FSCN3Q9NQT6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FSCN3Q9NQT6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FSCN3Q9NQT6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FSCN3Q9NQT6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FSCN3Q9NQT6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FSCN3Q9NQT6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FSCN3Q9NQT6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FSCN3Q9NQT6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FSCN3Q9NQT6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FSCN3Q9NQT6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FSCN3Q9NQT6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FSCN3Q9NQT6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FSCN3Q9NQT6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FSCN3Q9NQT6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FSCN3Q9NQT6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FSCN3Q9NQT6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FSCN3Q9NQT6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FSCN3Q9NQT6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FSCN3Q9NQT6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FSCN3Q9NQT6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FSCN3Q9NQT6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FSCN3Q9NQT6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FSCN3Q9NQT6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FSCN3Q9NQT6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FSCN3Q9NQT6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FSCN3Q9NQT6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FSCN3Q9NQT6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FSCN3Q9NQT6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FSCN3Q9NQT6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FSCN3Q9NQT6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FSCN3Q9NQT6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FSCN3Q9NQT6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FSCN3Q9NQT6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FSCN3Q9NQT6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FSCN3Q9NQT6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FSCN3Q9NQT6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FSCN3Q9NQT6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FSCN3Q9NQT6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
FSCN3Q9NQT6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FSCN3Q9NQT6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FSCN3Q9NQT6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
FSCN3Q9NQT6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FSCN3Q9NQT6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FSCN3Q9NQT6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FSCN3Q9NQT6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FSCN3Q9NQT6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FSCN3Q9NQT6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FSCN3Q9NQT6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FSCN3Q9NQT6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms