Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9K5

ERVMER34-1, Endogenous retrovirus group MER34 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVMER34-1Q9H9K5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVMER34-1Q9H9K5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVMER34-1Q9H9K5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVMER34-1Q9H9K5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVMER34-1Q9H9K5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVMER34-1Q9H9K5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVMER34-1Q9H9K5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVMER34-1Q9H9K5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVMER34-1Q9H9K5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVMER34-1Q9H9K5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVMER34-1Q9H9K5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVMER34-1Q9H9K5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVMER34-1Q9H9K5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVMER34-1Q9H9K5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVMER34-1Q9H9K5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVMER34-1Q9H9K5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVMER34-1Q9H9K5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERVMER34-1Q9H9K5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERVMER34-1Q9H9K5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERVMER34-1Q9H9K5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERVMER34-1Q9H9K5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ERVMER34-1Q9H9K5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVMER34-1Q9H9K5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVMER34-1Q9H9K5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVMER34-1Q9H9K5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVMER34-1Q9H9K5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVMER34-1Q9H9K5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVMER34-1Q9H9K5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVMER34-1Q9H9K5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVMER34-1Q9H9K5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVMER34-1Q9H9K5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVMER34-1Q9H9K5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVMER34-1Q9H9K5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVMER34-1Q9H9K5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVMER34-1Q9H9K5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVMER34-1Q9H9K5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVMER34-1Q9H9K5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVMER34-1Q9H9K5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVMER34-1Q9H9K5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVMER34-1Q9H9K5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVMER34-1Q9H9K5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVMER34-1Q9H9K5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVMER34-1Q9H9K5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVMER34-1Q9H9K5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVMER34-1Q9H9K5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVMER34-1Q9H9K5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVMER34-1Q9H9K5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ERVMER34-1Q9H9K5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERVMER34-1Q9H9K5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ERVMER34-1Q9H9K5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ERVMER34-1Q9H9K5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERVMER34-1Q9H9K5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVMER34-1Q9H9K5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVMER34-1Q9H9K5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVMER34-1Q9H9K5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVMER34-1Q9H9K5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVMER34-1Q9H9K5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVMER34-1Q9H9K5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVMER34-1Q9H9K5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVMER34-1Q9H9K5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVMER34-1Q9H9K5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVMER34-1Q9H9K5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVMER34-1Q9H9K5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVMER34-1Q9H9K5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVMER34-1Q9H9K5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVMER34-1Q9H9K5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVMER34-1Q9H9K5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVMER34-1Q9H9K5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ERVMER34-1Q9H9K5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ERVMER34-1Q9H9K5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVMER34-1Q9H9K5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVMER34-1Q9H9K5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVMER34-1Q9H9K5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVMER34-1Q9H9K5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVMER34-1Q9H9K5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVMER34-1Q9H9K5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVMER34-1Q9H9K5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVMER34-1Q9H9K5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVMER34-1Q9H9K5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVMER34-1Q9H9K5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVMER34-1Q9H9K5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVMER34-1Q9H9K5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVMER34-1Q9H9K5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVMER34-1Q9H9K5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVMER34-1Q9H9K5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVMER34-1Q9H9K5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVMER34-1Q9H9K5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVMER34-1Q9H9K5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVMER34-1Q9H9K5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVMER34-1Q9H9K5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVMER34-1Q9H9K5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVMER34-1Q9H9K5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVMER34-1Q9H9K5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVMER34-1Q9H9K5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms