Protein–RNA interactions for Protein: Q9H987

SYNPO2L, Synaptopodin 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2LQ9H987 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNPO2LQ9H987 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNPO2LQ9H987 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNPO2LQ9H987 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNPO2LQ9H987 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNPO2LQ9H987 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNPO2LQ9H987 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNPO2LQ9H987 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNPO2LQ9H987 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNPO2LQ9H987 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNPO2LQ9H987 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNPO2LQ9H987 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNPO2LQ9H987 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNPO2LQ9H987 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNPO2LQ9H987 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNPO2LQ9H987 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYNPO2LQ9H987 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYNPO2LQ9H987 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYNPO2LQ9H987 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SYNPO2LQ9H987 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYNPO2LQ9H987 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNPO2LQ9H987 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNPO2LQ9H987 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNPO2LQ9H987 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNPO2LQ9H987 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNPO2LQ9H987 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNPO2LQ9H987 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNPO2LQ9H987 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNPO2LQ9H987 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNPO2LQ9H987 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNPO2LQ9H987 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNPO2LQ9H987 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNPO2LQ9H987 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNPO2LQ9H987 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNPO2LQ9H987 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNPO2LQ9H987 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNPO2LQ9H987 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNPO2LQ9H987 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNPO2LQ9H987 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNPO2LQ9H987 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNPO2LQ9H987 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNPO2LQ9H987 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNPO2LQ9H987 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SYNPO2LQ9H987 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNPO2LQ9H987 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNPO2LQ9H987 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNPO2LQ9H987 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNPO2LQ9H987 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNPO2LQ9H987 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNPO2LQ9H987 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNPO2LQ9H987 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNPO2LQ9H987 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNPO2LQ9H987 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNPO2LQ9H987 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNPO2LQ9H987 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNPO2LQ9H987 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNPO2LQ9H987 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNPO2LQ9H987 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNPO2LQ9H987 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNPO2LQ9H987 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNPO2LQ9H987 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNPO2LQ9H987 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNPO2LQ9H987 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNPO2LQ9H987 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNPO2LQ9H987 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNPO2LQ9H987 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNPO2LQ9H987 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNPO2LQ9H987 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNPO2LQ9H987 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNPO2LQ9H987 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNPO2LQ9H987 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNPO2LQ9H987 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNPO2LQ9H987 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNPO2LQ9H987 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNPO2LQ9H987 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNPO2LQ9H987 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNPO2LQ9H987 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNPO2LQ9H987 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNPO2LQ9H987 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNPO2LQ9H987 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNPO2LQ9H987 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNPO2LQ9H987 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNPO2LQ9H987 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNPO2LQ9H987 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNPO2LQ9H987 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYNPO2LQ9H987 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNPO2LQ9H987 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNPO2LQ9H987 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNPO2LQ9H987 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNPO2LQ9H987 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNPO2LQ9H987 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNPO2LQ9H987 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNPO2LQ9H987 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNPO2LQ9H987 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNPO2LQ9H987 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNPO2LQ9H987 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNPO2LQ9H987 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNPO2LQ9H987 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNPO2LQ9H987 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNPO2LQ9H987 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms