Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0C1

ZMYND12, Zinc finger MYND domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND12Q9H0C1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZMYND12Q9H0C1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZMYND12Q9H0C1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZMYND12Q9H0C1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZMYND12Q9H0C1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZMYND12Q9H0C1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZMYND12Q9H0C1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ZMYND12Q9H0C1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ZMYND12Q9H0C1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZMYND12Q9H0C1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZMYND12Q9H0C1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZMYND12Q9H0C1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZMYND12Q9H0C1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
ZMYND12Q9H0C1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZMYND12Q9H0C1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZMYND12Q9H0C1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZMYND12Q9H0C1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ZMYND12Q9H0C1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZMYND12Q9H0C1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZMYND12Q9H0C1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZMYND12Q9H0C1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZMYND12Q9H0C1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZMYND12Q9H0C1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZMYND12Q9H0C1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZMYND12Q9H0C1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZMYND12Q9H0C1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZMYND12Q9H0C1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZMYND12Q9H0C1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZMYND12Q9H0C1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ZMYND12Q9H0C1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ZMYND12Q9H0C1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZMYND12Q9H0C1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZMYND12Q9H0C1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZMYND12Q9H0C1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZMYND12Q9H0C1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZMYND12Q9H0C1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZMYND12Q9H0C1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZMYND12Q9H0C1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ZMYND12Q9H0C1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZMYND12Q9H0C1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZMYND12Q9H0C1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZMYND12Q9H0C1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZMYND12Q9H0C1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZMYND12Q9H0C1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZMYND12Q9H0C1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZMYND12Q9H0C1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZMYND12Q9H0C1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZMYND12Q9H0C1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZMYND12Q9H0C1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZMYND12Q9H0C1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZMYND12Q9H0C1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZMYND12Q9H0C1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ZMYND12Q9H0C1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZMYND12Q9H0C1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZMYND12Q9H0C1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZMYND12Q9H0C1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZMYND12Q9H0C1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZMYND12Q9H0C1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZMYND12Q9H0C1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZMYND12Q9H0C1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZMYND12Q9H0C1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZMYND12Q9H0C1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZMYND12Q9H0C1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZMYND12Q9H0C1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZMYND12Q9H0C1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZMYND12Q9H0C1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZMYND12Q9H0C1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZMYND12Q9H0C1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZMYND12Q9H0C1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZMYND12Q9H0C1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZMYND12Q9H0C1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZMYND12Q9H0C1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZMYND12Q9H0C1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZMYND12Q9H0C1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ZMYND12Q9H0C1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZMYND12Q9H0C1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZMYND12Q9H0C1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZMYND12Q9H0C1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZMYND12Q9H0C1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZMYND12Q9H0C1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZMYND12Q9H0C1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZMYND12Q9H0C1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZMYND12Q9H0C1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZMYND12Q9H0C1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZMYND12Q9H0C1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZMYND12Q9H0C1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZMYND12Q9H0C1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZMYND12Q9H0C1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZMYND12Q9H0C1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZMYND12Q9H0C1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ZMYND12Q9H0C1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZMYND12Q9H0C1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZMYND12Q9H0C1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZMYND12Q9H0C1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZMYND12Q9H0C1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZMYND12Q9H0C1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZMYND12Q9H0C1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZMYND12Q9H0C1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ZMYND12Q9H0C1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZMYND12Q9H0C1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms