Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN2

TGIF2, Homeobox protein TGIF2, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGIF2Q9GZN2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TGIF2Q9GZN2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TGIF2Q9GZN2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TGIF2Q9GZN2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TGIF2Q9GZN2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TGIF2Q9GZN2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TGIF2Q9GZN2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TGIF2Q9GZN2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TGIF2Q9GZN2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TGIF2Q9GZN2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TGIF2Q9GZN2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TGIF2Q9GZN2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TGIF2Q9GZN2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TGIF2Q9GZN2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TGIF2Q9GZN2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TGIF2Q9GZN2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TGIF2Q9GZN2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TGIF2Q9GZN2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TGIF2Q9GZN2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TGIF2Q9GZN2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TGIF2Q9GZN2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TGIF2Q9GZN2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TGIF2Q9GZN2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TGIF2Q9GZN2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TGIF2Q9GZN2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TGIF2Q9GZN2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TGIF2Q9GZN2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TGIF2Q9GZN2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TGIF2Q9GZN2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TGIF2Q9GZN2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TGIF2Q9GZN2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TGIF2Q9GZN2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TGIF2Q9GZN2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TGIF2Q9GZN2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TGIF2Q9GZN2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TGIF2Q9GZN2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TGIF2Q9GZN2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TGIF2Q9GZN2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TGIF2Q9GZN2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TGIF2Q9GZN2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TGIF2Q9GZN2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TGIF2Q9GZN2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TGIF2Q9GZN2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TGIF2Q9GZN2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TGIF2Q9GZN2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TGIF2Q9GZN2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TGIF2Q9GZN2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TGIF2Q9GZN2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TGIF2Q9GZN2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TGIF2Q9GZN2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TGIF2Q9GZN2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TGIF2Q9GZN2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TGIF2Q9GZN2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TGIF2Q9GZN2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TGIF2Q9GZN2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TGIF2Q9GZN2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TGIF2Q9GZN2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TGIF2Q9GZN2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TGIF2Q9GZN2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TGIF2Q9GZN2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TGIF2Q9GZN2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TGIF2Q9GZN2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TGIF2Q9GZN2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TGIF2Q9GZN2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TGIF2Q9GZN2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TGIF2Q9GZN2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TGIF2Q9GZN2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TGIF2Q9GZN2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TGIF2Q9GZN2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TGIF2Q9GZN2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TGIF2Q9GZN2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TGIF2Q9GZN2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TGIF2Q9GZN2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TGIF2Q9GZN2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TGIF2Q9GZN2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TGIF2Q9GZN2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TGIF2Q9GZN2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TGIF2Q9GZN2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TGIF2Q9GZN2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TGIF2Q9GZN2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TGIF2Q9GZN2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TGIF2Q9GZN2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TGIF2Q9GZN2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TGIF2Q9GZN2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TGIF2Q9GZN2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TGIF2Q9GZN2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TGIF2Q9GZN2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TGIF2Q9GZN2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TGIF2Q9GZN2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TGIF2Q9GZN2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TGIF2Q9GZN2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TGIF2Q9GZN2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TGIF2Q9GZN2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TGIF2Q9GZN2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TGIF2Q9GZN2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TGIF2Q9GZN2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TGIF2Q9GZN2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TGIF2Q9GZN2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TGIF2Q9GZN2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TGIF2Q9GZN2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms