Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CELF4Q9BZC1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CELF4Q9BZC1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CELF4Q9BZC1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CELF4Q9BZC1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CELF4Q9BZC1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CELF4Q9BZC1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CELF4Q9BZC1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CELF4Q9BZC1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CELF4Q9BZC1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CELF4Q9BZC1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CELF4Q9BZC1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CELF4Q9BZC1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CELF4Q9BZC1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CELF4Q9BZC1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CELF4Q9BZC1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CELF4Q9BZC1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CELF4Q9BZC1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CELF4Q9BZC1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CELF4Q9BZC1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CELF4Q9BZC1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CELF4Q9BZC1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CELF4Q9BZC1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CELF4Q9BZC1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CELF4Q9BZC1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CELF4Q9BZC1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CELF4Q9BZC1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CELF4Q9BZC1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CELF4Q9BZC1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CELF4Q9BZC1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CELF4Q9BZC1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CELF4Q9BZC1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CELF4Q9BZC1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CELF4Q9BZC1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CELF4Q9BZC1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CELF4Q9BZC1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CELF4Q9BZC1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CELF4Q9BZC1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CELF4Q9BZC1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CELF4Q9BZC1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CELF4Q9BZC1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CELF4Q9BZC1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CELF4Q9BZC1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CELF4Q9BZC1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CELF4Q9BZC1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CELF4Q9BZC1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CELF4Q9BZC1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CELF4Q9BZC1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CELF4Q9BZC1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CELF4Q9BZC1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CELF4Q9BZC1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CELF4Q9BZC1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CELF4Q9BZC1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CELF4Q9BZC1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CELF4Q9BZC1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CELF4Q9BZC1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CELF4Q9BZC1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CELF4Q9BZC1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CELF4Q9BZC1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CELF4Q9BZC1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CELF4Q9BZC1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CELF4Q9BZC1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CELF4Q9BZC1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CELF4Q9BZC1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CELF4Q9BZC1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CELF4Q9BZC1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CELF4Q9BZC1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CELF4Q9BZC1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CELF4Q9BZC1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CELF4Q9BZC1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CELF4Q9BZC1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CELF4Q9BZC1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CELF4Q9BZC1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CELF4Q9BZC1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CELF4Q9BZC1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CELF4Q9BZC1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CELF4Q9BZC1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CELF4Q9BZC1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CELF4Q9BZC1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CELF4Q9BZC1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CELF4Q9BZC1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CELF4Q9BZC1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CELF4Q9BZC1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CELF4Q9BZC1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CELF4Q9BZC1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CELF4Q9BZC1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CELF4Q9BZC1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CELF4Q9BZC1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CELF4Q9BZC1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CELF4Q9BZC1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CELF4Q9BZC1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CELF4Q9BZC1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CELF4Q9BZC1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CELF4Q9BZC1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CELF4Q9BZC1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CELF4Q9BZC1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CELF4Q9BZC1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CELF4Q9BZC1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CELF4Q9BZC1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CELF4Q9BZC1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms