Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VN1R3Q9BXE9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
VN1R3Q9BXE9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VN1R3Q9BXE9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
VN1R3Q9BXE9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VN1R3Q9BXE9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VN1R3Q9BXE9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VN1R3Q9BXE9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VN1R3Q9BXE9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VN1R3Q9BXE9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VN1R3Q9BXE9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VN1R3Q9BXE9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VN1R3Q9BXE9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
VN1R3Q9BXE9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
VN1R3Q9BXE9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
VN1R3Q9BXE9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VN1R3Q9BXE9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VN1R3Q9BXE9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VN1R3Q9BXE9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VN1R3Q9BXE9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VN1R3Q9BXE9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VN1R3Q9BXE9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VN1R3Q9BXE9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
VN1R3Q9BXE9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VN1R3Q9BXE9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VN1R3Q9BXE9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VN1R3Q9BXE9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VN1R3Q9BXE9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VN1R3Q9BXE9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VN1R3Q9BXE9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VN1R3Q9BXE9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VN1R3Q9BXE9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VN1R3Q9BXE9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VN1R3Q9BXE9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VN1R3Q9BXE9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VN1R3Q9BXE9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VN1R3Q9BXE9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VN1R3Q9BXE9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VN1R3Q9BXE9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VN1R3Q9BXE9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
VN1R3Q9BXE9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VN1R3Q9BXE9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VN1R3Q9BXE9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
VN1R3Q9BXE9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VN1R3Q9BXE9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VN1R3Q9BXE9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VN1R3Q9BXE9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VN1R3Q9BXE9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VN1R3Q9BXE9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VN1R3Q9BXE9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VN1R3Q9BXE9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VN1R3Q9BXE9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VN1R3Q9BXE9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VN1R3Q9BXE9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VN1R3Q9BXE9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VN1R3Q9BXE9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
VN1R3Q9BXE9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VN1R3Q9BXE9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VN1R3Q9BXE9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VN1R3Q9BXE9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VN1R3Q9BXE9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VN1R3Q9BXE9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
VN1R3Q9BXE9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VN1R3Q9BXE9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VN1R3Q9BXE9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VN1R3Q9BXE9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
VN1R3Q9BXE9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VN1R3Q9BXE9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VN1R3Q9BXE9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VN1R3Q9BXE9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VN1R3Q9BXE9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VN1R3Q9BXE9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VN1R3Q9BXE9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VN1R3Q9BXE9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VN1R3Q9BXE9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VN1R3Q9BXE9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VN1R3Q9BXE9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VN1R3Q9BXE9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VN1R3Q9BXE9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VN1R3Q9BXE9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VN1R3Q9BXE9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VN1R3Q9BXE9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
VN1R3Q9BXE9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
VN1R3Q9BXE9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VN1R3Q9BXE9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VN1R3Q9BXE9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VN1R3Q9BXE9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VN1R3Q9BXE9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VN1R3Q9BXE9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
VN1R3Q9BXE9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VN1R3Q9BXE9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VN1R3Q9BXE9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VN1R3Q9BXE9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
VN1R3Q9BXE9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VN1R3Q9BXE9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
VN1R3Q9BXE9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VN1R3Q9BXE9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VN1R3Q9BXE9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VN1R3Q9BXE9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VN1R3Q9BXE9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms