Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
BCANQ96GW7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC36.97■■■■□ 3.51
BCANQ96GW7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
BCANQ96GW7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
BCANQ96GW7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
BCANQ96GW7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
BCANQ96GW7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
BCANQ96GW7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
BCANQ96GW7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
BCANQ96GW7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
BCANQ96GW7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
BCANQ96GW7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
BCANQ96GW7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
BCANQ96GW7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.5
BCANQ96GW7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
BCANQ96GW7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
BCANQ96GW7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
BCANQ96GW7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
BCANQ96GW7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
BCANQ96GW7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
BCANQ96GW7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
BCANQ96GW7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
BCANQ96GW7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
BCANQ96GW7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
BCANQ96GW7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
BCANQ96GW7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
BCANQ96GW7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
BCANQ96GW7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
BCANQ96GW7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
BCANQ96GW7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
BCANQ96GW7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
BCANQ96GW7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
BCANQ96GW7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
BCANQ96GW7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
BCANQ96GW7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.5
BCANQ96GW7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
BCANQ96GW7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
BCANQ96GW7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
BCANQ96GW7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
BCANQ96GW7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
BCANQ96GW7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
BCANQ96GW7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
BCANQ96GW7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
BCANQ96GW7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
BCANQ96GW7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
BCANQ96GW7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
BCANQ96GW7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
BCANQ96GW7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
BCANQ96GW7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
BCANQ96GW7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
BCANQ96GW7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
BCANQ96GW7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
BCANQ96GW7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
BCANQ96GW7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
BCANQ96GW7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
BCANQ96GW7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
BCANQ96GW7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
BCANQ96GW7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
BCANQ96GW7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
BCANQ96GW7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
BCANQ96GW7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
BCANQ96GW7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
BCANQ96GW7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
BCANQ96GW7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
BCANQ96GW7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
BCANQ96GW7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
BCANQ96GW7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
BCANQ96GW7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
BCANQ96GW7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
BCANQ96GW7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
BCANQ96GW7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
BCANQ96GW7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
BCANQ96GW7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
BCANQ96GW7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
BCANQ96GW7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
BCANQ96GW7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
BCANQ96GW7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
BCANQ96GW7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
BCANQ96GW7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
BCANQ96GW7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
BCANQ96GW7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
BCANQ96GW7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
BCANQ96GW7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
BCANQ96GW7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
BCANQ96GW7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
BCANQ96GW7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
BCANQ96GW7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
BCANQ96GW7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
BCANQ96GW7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
BCANQ96GW7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
BCANQ96GW7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
BCANQ96GW7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC36.65■■■■□ 3.46
BCANQ96GW7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
BCANQ96GW7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
BCANQ96GW7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
BCANQ96GW7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
BCANQ96GW7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
BCANQ96GW7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
BCANQ96GW7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
BCANQ96GW7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms