Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCARF2Q96GP6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCARF2Q96GP6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCARF2Q96GP6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCARF2Q96GP6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCARF2Q96GP6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SCARF2Q96GP6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCARF2Q96GP6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCARF2Q96GP6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCARF2Q96GP6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCARF2Q96GP6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCARF2Q96GP6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCARF2Q96GP6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCARF2Q96GP6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCARF2Q96GP6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCARF2Q96GP6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCARF2Q96GP6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCARF2Q96GP6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SCARF2Q96GP6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCARF2Q96GP6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCARF2Q96GP6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCARF2Q96GP6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SCARF2Q96GP6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SCARF2Q96GP6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCARF2Q96GP6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCARF2Q96GP6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCARF2Q96GP6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCARF2Q96GP6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCARF2Q96GP6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCARF2Q96GP6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SCARF2Q96GP6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCARF2Q96GP6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SCARF2Q96GP6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCARF2Q96GP6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCARF2Q96GP6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SCARF2Q96GP6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCARF2Q96GP6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCARF2Q96GP6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCARF2Q96GP6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCARF2Q96GP6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCARF2Q96GP6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCARF2Q96GP6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCARF2Q96GP6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCARF2Q96GP6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCARF2Q96GP6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCARF2Q96GP6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCARF2Q96GP6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCARF2Q96GP6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCARF2Q96GP6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCARF2Q96GP6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCARF2Q96GP6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCARF2Q96GP6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCARF2Q96GP6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCARF2Q96GP6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCARF2Q96GP6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCARF2Q96GP6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCARF2Q96GP6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCARF2Q96GP6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCARF2Q96GP6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCARF2Q96GP6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCARF2Q96GP6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCARF2Q96GP6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SCARF2Q96GP6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCARF2Q96GP6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCARF2Q96GP6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCARF2Q96GP6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCARF2Q96GP6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCARF2Q96GP6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCARF2Q96GP6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCARF2Q96GP6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCARF2Q96GP6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCARF2Q96GP6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCARF2Q96GP6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCARF2Q96GP6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCARF2Q96GP6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SCARF2Q96GP6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCARF2Q96GP6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCARF2Q96GP6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCARF2Q96GP6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCARF2Q96GP6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCARF2Q96GP6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCARF2Q96GP6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCARF2Q96GP6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SCARF2Q96GP6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCARF2Q96GP6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCARF2Q96GP6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCARF2Q96GP6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCARF2Q96GP6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCARF2Q96GP6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCARF2Q96GP6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCARF2Q96GP6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCARF2Q96GP6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCARF2Q96GP6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCARF2Q96GP6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SCARF2Q96GP6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCARF2Q96GP6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCARF2Q96GP6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCARF2Q96GP6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCARF2Q96GP6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCARF2Q96GP6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms