Protein–RNA interactions for Protein: Q96A59

MARVELD3, MARVEL domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARVELD3Q96A59 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARVELD3Q96A59 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARVELD3Q96A59 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARVELD3Q96A59 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARVELD3Q96A59 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARVELD3Q96A59 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARVELD3Q96A59 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARVELD3Q96A59 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARVELD3Q96A59 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARVELD3Q96A59 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARVELD3Q96A59 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARVELD3Q96A59 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARVELD3Q96A59 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MARVELD3Q96A59 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARVELD3Q96A59 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MARVELD3Q96A59 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARVELD3Q96A59 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARVELD3Q96A59 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARVELD3Q96A59 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARVELD3Q96A59 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARVELD3Q96A59 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARVELD3Q96A59 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MARVELD3Q96A59 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARVELD3Q96A59 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARVELD3Q96A59 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARVELD3Q96A59 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MARVELD3Q96A59 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARVELD3Q96A59 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARVELD3Q96A59 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARVELD3Q96A59 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARVELD3Q96A59 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARVELD3Q96A59 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARVELD3Q96A59 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARVELD3Q96A59 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARVELD3Q96A59 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARVELD3Q96A59 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARVELD3Q96A59 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MARVELD3Q96A59 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARVELD3Q96A59 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARVELD3Q96A59 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARVELD3Q96A59 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARVELD3Q96A59 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARVELD3Q96A59 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARVELD3Q96A59 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARVELD3Q96A59 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARVELD3Q96A59 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARVELD3Q96A59 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARVELD3Q96A59 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARVELD3Q96A59 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARVELD3Q96A59 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARVELD3Q96A59 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARVELD3Q96A59 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARVELD3Q96A59 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARVELD3Q96A59 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARVELD3Q96A59 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARVELD3Q96A59 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARVELD3Q96A59 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARVELD3Q96A59 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARVELD3Q96A59 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARVELD3Q96A59 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARVELD3Q96A59 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARVELD3Q96A59 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MARVELD3Q96A59 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARVELD3Q96A59 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARVELD3Q96A59 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MARVELD3Q96A59 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARVELD3Q96A59 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARVELD3Q96A59 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARVELD3Q96A59 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARVELD3Q96A59 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARVELD3Q96A59 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARVELD3Q96A59 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARVELD3Q96A59 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARVELD3Q96A59 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARVELD3Q96A59 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARVELD3Q96A59 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARVELD3Q96A59 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MARVELD3Q96A59 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MARVELD3Q96A59 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARVELD3Q96A59 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARVELD3Q96A59 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARVELD3Q96A59 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARVELD3Q96A59 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MARVELD3Q96A59 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARVELD3Q96A59 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARVELD3Q96A59 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARVELD3Q96A59 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARVELD3Q96A59 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARVELD3Q96A59 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARVELD3Q96A59 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARVELD3Q96A59 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARVELD3Q96A59 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARVELD3Q96A59 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARVELD3Q96A59 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARVELD3Q96A59 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARVELD3Q96A59 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARVELD3Q96A59 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARVELD3Q96A59 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARVELD3Q96A59 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARVELD3Q96A59 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms