Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CELF1Q92879 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CELF1Q92879 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CELF1Q92879 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
CELF1Q92879 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CELF1Q92879 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CELF1Q92879 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CELF1Q92879 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CELF1Q92879 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CELF1Q92879 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CELF1Q92879 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CELF1Q92879 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CELF1Q92879 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CELF1Q92879 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CELF1Q92879 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CELF1Q92879 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CELF1Q92879 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CELF1Q92879 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CELF1Q92879 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CELF1Q92879 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CELF1Q92879 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CELF1Q92879 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CELF1Q92879 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CELF1Q92879 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CELF1Q92879 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CELF1Q92879 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CELF1Q92879 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CELF1Q92879 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CELF1Q92879 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
CELF1Q92879 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CELF1Q92879 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CELF1Q92879 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CELF1Q92879 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CELF1Q92879 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CELF1Q92879 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CELF1Q92879 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CELF1Q92879 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CELF1Q92879 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CELF1Q92879 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CELF1Q92879 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CELF1Q92879 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CELF1Q92879 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CELF1Q92879 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
CELF1Q92879 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CELF1Q92879 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CELF1Q92879 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
CELF1Q92879 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CELF1Q92879 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CELF1Q92879 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CELF1Q92879 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CELF1Q92879 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CELF1Q92879 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CELF1Q92879 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
CELF1Q92879 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CELF1Q92879 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CELF1Q92879 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CELF1Q92879 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CELF1Q92879 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CELF1Q92879 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CELF1Q92879 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
CELF1Q92879 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CELF1Q92879 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CELF1Q92879 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CELF1Q92879 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CELF1Q92879 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CELF1Q92879 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CELF1Q92879 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CELF1Q92879 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CELF1Q92879 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CELF1Q92879 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CELF1Q92879 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CELF1Q92879 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CELF1Q92879 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CELF1Q92879 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CELF1Q92879 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CELF1Q92879 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
CELF1Q92879 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CELF1Q92879 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CELF1Q92879 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.62
CELF1Q92879 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CELF1Q92879 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CELF1Q92879 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
CELF1Q92879 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
CELF1Q92879 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CELF1Q92879 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CELF1Q92879 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CELF1Q92879 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CELF1Q92879 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CELF1Q92879 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
CELF1Q92879 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CELF1Q92879 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CELF1Q92879 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CELF1Q92879 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
CELF1Q92879 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CELF1Q92879 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CELF1Q92879 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CELF1Q92879 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CELF1Q92879 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CELF1Q92879 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CELF1Q92879 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms