Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

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Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C15orf40Q8WUR7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C15orf40Q8WUR7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C15orf40Q8WUR7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C15orf40Q8WUR7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C15orf40Q8WUR7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C15orf40Q8WUR7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C15orf40Q8WUR7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C15orf40Q8WUR7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C15orf40Q8WUR7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C15orf40Q8WUR7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C15orf40Q8WUR7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C15orf40Q8WUR7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C15orf40Q8WUR7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C15orf40Q8WUR7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C15orf40Q8WUR7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C15orf40Q8WUR7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C15orf40Q8WUR7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C15orf40Q8WUR7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C15orf40Q8WUR7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C15orf40Q8WUR7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C15orf40Q8WUR7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C15orf40Q8WUR7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C15orf40Q8WUR7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C15orf40Q8WUR7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C15orf40Q8WUR7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
C15orf40Q8WUR7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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