Protein–RNA interactions for Protein: Q8NGA8

OR4F17, Olfactory receptor 4F17, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OR4F17Q8NGA8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OR4F17Q8NGA8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OR4F17Q8NGA8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OR4F17Q8NGA8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OR4F17Q8NGA8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OR4F17Q8NGA8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OR4F17Q8NGA8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OR4F17Q8NGA8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OR4F17Q8NGA8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OR4F17Q8NGA8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OR4F17Q8NGA8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OR4F17Q8NGA8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OR4F17Q8NGA8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OR4F17Q8NGA8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OR4F17Q8NGA8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OR4F17Q8NGA8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OR4F17Q8NGA8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OR4F17Q8NGA8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
OR4F17Q8NGA8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OR4F17Q8NGA8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OR4F17Q8NGA8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OR4F17Q8NGA8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OR4F17Q8NGA8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OR4F17Q8NGA8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OR4F17Q8NGA8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OR4F17Q8NGA8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OR4F17Q8NGA8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OR4F17Q8NGA8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OR4F17Q8NGA8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OR4F17Q8NGA8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OR4F17Q8NGA8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OR4F17Q8NGA8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OR4F17Q8NGA8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OR4F17Q8NGA8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OR4F17Q8NGA8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OR4F17Q8NGA8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OR4F17Q8NGA8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OR4F17Q8NGA8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OR4F17Q8NGA8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OR4F17Q8NGA8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OR4F17Q8NGA8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OR4F17Q8NGA8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OR4F17Q8NGA8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OR4F17Q8NGA8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OR4F17Q8NGA8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OR4F17Q8NGA8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OR4F17Q8NGA8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OR4F17Q8NGA8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OR4F17Q8NGA8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OR4F17Q8NGA8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OR4F17Q8NGA8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OR4F17Q8NGA8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OR4F17Q8NGA8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OR4F17Q8NGA8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OR4F17Q8NGA8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OR4F17Q8NGA8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OR4F17Q8NGA8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OR4F17Q8NGA8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OR4F17Q8NGA8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OR4F17Q8NGA8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OR4F17Q8NGA8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OR4F17Q8NGA8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OR4F17Q8NGA8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OR4F17Q8NGA8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OR4F17Q8NGA8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OR4F17Q8NGA8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OR4F17Q8NGA8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OR4F17Q8NGA8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OR4F17Q8NGA8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OR4F17Q8NGA8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OR4F17Q8NGA8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OR4F17Q8NGA8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OR4F17Q8NGA8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OR4F17Q8NGA8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OR4F17Q8NGA8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OR4F17Q8NGA8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
OR4F17Q8NGA8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OR4F17Q8NGA8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OR4F17Q8NGA8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OR4F17Q8NGA8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OR4F17Q8NGA8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OR4F17Q8NGA8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
OR4F17Q8NGA8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
OR4F17Q8NGA8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OR4F17Q8NGA8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OR4F17Q8NGA8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OR4F17Q8NGA8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OR4F17Q8NGA8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OR4F17Q8NGA8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OR4F17Q8NGA8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OR4F17Q8NGA8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OR4F17Q8NGA8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OR4F17Q8NGA8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OR4F17Q8NGA8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
OR4F17Q8NGA8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OR4F17Q8NGA8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OR4F17Q8NGA8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
OR4F17Q8NGA8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
OR4F17Q8NGA8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
OR4F17Q8NGA8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms