Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF397Q8NF99 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF397Q8NF99 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF397Q8NF99 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF397Q8NF99 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF397Q8NF99 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF397Q8NF99 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF397Q8NF99 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF397Q8NF99 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF397Q8NF99 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF397Q8NF99 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF397Q8NF99 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF397Q8NF99 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF397Q8NF99 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF397Q8NF99 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF397Q8NF99 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF397Q8NF99 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF397Q8NF99 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF397Q8NF99 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF397Q8NF99 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF397Q8NF99 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF397Q8NF99 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF397Q8NF99 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF397Q8NF99 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF397Q8NF99 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF397Q8NF99 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF397Q8NF99 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ZNF397Q8NF99 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ZNF397Q8NF99 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF397Q8NF99 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF397Q8NF99 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF397Q8NF99 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF397Q8NF99 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF397Q8NF99 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF397Q8NF99 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF397Q8NF99 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF397Q8NF99 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF397Q8NF99 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF397Q8NF99 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF397Q8NF99 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF397Q8NF99 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF397Q8NF99 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF397Q8NF99 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF397Q8NF99 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF397Q8NF99 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF397Q8NF99 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF397Q8NF99 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF397Q8NF99 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF397Q8NF99 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF397Q8NF99 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF397Q8NF99 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZNF397Q8NF99 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF397Q8NF99 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF397Q8NF99 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF397Q8NF99 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF397Q8NF99 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF397Q8NF99 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF397Q8NF99 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF397Q8NF99 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF397Q8NF99 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF397Q8NF99 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF397Q8NF99 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF397Q8NF99 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF397Q8NF99 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF397Q8NF99 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF397Q8NF99 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF397Q8NF99 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF397Q8NF99 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF397Q8NF99 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF397Q8NF99 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF397Q8NF99 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF397Q8NF99 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF397Q8NF99 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF397Q8NF99 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF397Q8NF99 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF397Q8NF99 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF397Q8NF99 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF397Q8NF99 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF397Q8NF99 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF397Q8NF99 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF397Q8NF99 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF397Q8NF99 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZNF397Q8NF99 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZNF397Q8NF99 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF397Q8NF99 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF397Q8NF99 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF397Q8NF99 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF397Q8NF99 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF397Q8NF99 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF397Q8NF99 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF397Q8NF99 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF397Q8NF99 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF397Q8NF99 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF397Q8NF99 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF397Q8NF99 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF397Q8NF99 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF397Q8NF99 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF397Q8NF99 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF397Q8NF99 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF397Q8NF99 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms