Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C17orf47Q8NEP4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C17orf47Q8NEP4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C17orf47Q8NEP4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C17orf47Q8NEP4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C17orf47Q8NEP4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C17orf47Q8NEP4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C17orf47Q8NEP4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C17orf47Q8NEP4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C17orf47Q8NEP4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C17orf47Q8NEP4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C17orf47Q8NEP4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C17orf47Q8NEP4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
C17orf47Q8NEP4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
C17orf47Q8NEP4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C17orf47Q8NEP4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
C17orf47Q8NEP4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C17orf47Q8NEP4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C17orf47Q8NEP4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C17orf47Q8NEP4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
C17orf47Q8NEP4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C17orf47Q8NEP4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C17orf47Q8NEP4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C17orf47Q8NEP4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C17orf47Q8NEP4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C17orf47Q8NEP4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C17orf47Q8NEP4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C17orf47Q8NEP4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C17orf47Q8NEP4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C17orf47Q8NEP4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C17orf47Q8NEP4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C17orf47Q8NEP4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C17orf47Q8NEP4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C17orf47Q8NEP4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C17orf47Q8NEP4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C17orf47Q8NEP4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C17orf47Q8NEP4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C17orf47Q8NEP4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C17orf47Q8NEP4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C17orf47Q8NEP4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C17orf47Q8NEP4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C17orf47Q8NEP4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C17orf47Q8NEP4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C17orf47Q8NEP4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C17orf47Q8NEP4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C17orf47Q8NEP4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C17orf47Q8NEP4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C17orf47Q8NEP4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C17orf47Q8NEP4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C17orf47Q8NEP4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C17orf47Q8NEP4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C17orf47Q8NEP4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C17orf47Q8NEP4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C17orf47Q8NEP4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C17orf47Q8NEP4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C17orf47Q8NEP4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C17orf47Q8NEP4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C17orf47Q8NEP4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
C17orf47Q8NEP4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C17orf47Q8NEP4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C17orf47Q8NEP4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C17orf47Q8NEP4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C17orf47Q8NEP4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
C17orf47Q8NEP4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C17orf47Q8NEP4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C17orf47Q8NEP4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C17orf47Q8NEP4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C17orf47Q8NEP4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C17orf47Q8NEP4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C17orf47Q8NEP4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C17orf47Q8NEP4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C17orf47Q8NEP4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C17orf47Q8NEP4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C17orf47Q8NEP4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C17orf47Q8NEP4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C17orf47Q8NEP4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C17orf47Q8NEP4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C17orf47Q8NEP4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C17orf47Q8NEP4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C17orf47Q8NEP4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C17orf47Q8NEP4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C17orf47Q8NEP4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C17orf47Q8NEP4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C17orf47Q8NEP4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C17orf47Q8NEP4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
C17orf47Q8NEP4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C17orf47Q8NEP4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C17orf47Q8NEP4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C17orf47Q8NEP4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C17orf47Q8NEP4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C17orf47Q8NEP4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C17orf47Q8NEP4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C17orf47Q8NEP4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C17orf47Q8NEP4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C17orf47Q8NEP4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C17orf47Q8NEP4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C17orf47Q8NEP4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C17orf47Q8NEP4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C17orf47Q8NEP4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C17orf47Q8NEP4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms