Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV35

WDR49, WD repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR49Q8IV35 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
WDR49Q8IV35 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.57■■■□□ 2
WDR49Q8IV35 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
WDR49Q8IV35 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
WDR49Q8IV35 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
WDR49Q8IV35 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
WDR49Q8IV35 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
WDR49Q8IV35 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
WDR49Q8IV35 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
WDR49Q8IV35 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.56■■■□□ 2
WDR49Q8IV35 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.56■■■□□ 2
WDR49Q8IV35 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
WDR49Q8IV35 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
WDR49Q8IV35 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
WDR49Q8IV35 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
WDR49Q8IV35 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
WDR49Q8IV35 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.53■■■□□ 2
WDR49Q8IV35 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
WDR49Q8IV35 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
WDR49Q8IV35 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
WDR49Q8IV35 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
WDR49Q8IV35 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
WDR49Q8IV35 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
WDR49Q8IV35 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
WDR49Q8IV35 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
WDR49Q8IV35 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
WDR49Q8IV35 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
WDR49Q8IV35 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
WDR49Q8IV35 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
WDR49Q8IV35 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
WDR49Q8IV35 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
WDR49Q8IV35 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
WDR49Q8IV35 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
WDR49Q8IV35 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
WDR49Q8IV35 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
WDR49Q8IV35 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
WDR49Q8IV35 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
WDR49Q8IV35 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
WDR49Q8IV35 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
WDR49Q8IV35 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
WDR49Q8IV35 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
WDR49Q8IV35 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
WDR49Q8IV35 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
WDR49Q8IV35 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
WDR49Q8IV35 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
WDR49Q8IV35 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
WDR49Q8IV35 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
WDR49Q8IV35 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
WDR49Q8IV35 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
WDR49Q8IV35 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
WDR49Q8IV35 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
WDR49Q8IV35 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
WDR49Q8IV35 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
WDR49Q8IV35 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
WDR49Q8IV35 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
WDR49Q8IV35 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
WDR49Q8IV35 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
WDR49Q8IV35 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
WDR49Q8IV35 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
WDR49Q8IV35 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
WDR49Q8IV35 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
WDR49Q8IV35 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
WDR49Q8IV35 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
WDR49Q8IV35 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
WDR49Q8IV35 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
WDR49Q8IV35 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
WDR49Q8IV35 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
WDR49Q8IV35 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
WDR49Q8IV35 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
WDR49Q8IV35 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
WDR49Q8IV35 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
WDR49Q8IV35 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
WDR49Q8IV35 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
WDR49Q8IV35 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
WDR49Q8IV35 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
WDR49Q8IV35 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
WDR49Q8IV35 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
WDR49Q8IV35 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
WDR49Q8IV35 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
WDR49Q8IV35 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
WDR49Q8IV35 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
WDR49Q8IV35 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
WDR49Q8IV35 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
WDR49Q8IV35 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
WDR49Q8IV35 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
WDR49Q8IV35 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
WDR49Q8IV35 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
WDR49Q8IV35 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
WDR49Q8IV35 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
WDR49Q8IV35 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
WDR49Q8IV35 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
WDR49Q8IV35 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
WDR49Q8IV35 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
WDR49Q8IV35 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
WDR49Q8IV35 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
WDR49Q8IV35 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
WDR49Q8IV35 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
WDR49Q8IV35 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
WDR49Q8IV35 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
WDR49Q8IV35 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms