Protein–RNA interactions for Protein: Q86WT6

TRIM69, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM69, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM69Q86WT6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM69Q86WT6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM69Q86WT6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM69Q86WT6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM69Q86WT6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM69Q86WT6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM69Q86WT6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM69Q86WT6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM69Q86WT6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM69Q86WT6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM69Q86WT6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM69Q86WT6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM69Q86WT6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM69Q86WT6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM69Q86WT6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM69Q86WT6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM69Q86WT6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM69Q86WT6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM69Q86WT6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM69Q86WT6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM69Q86WT6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM69Q86WT6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM69Q86WT6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM69Q86WT6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM69Q86WT6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM69Q86WT6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM69Q86WT6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM69Q86WT6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM69Q86WT6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM69Q86WT6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRIM69Q86WT6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM69Q86WT6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM69Q86WT6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM69Q86WT6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM69Q86WT6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM69Q86WT6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM69Q86WT6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM69Q86WT6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM69Q86WT6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM69Q86WT6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM69Q86WT6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM69Q86WT6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM69Q86WT6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM69Q86WT6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM69Q86WT6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM69Q86WT6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM69Q86WT6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM69Q86WT6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM69Q86WT6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM69Q86WT6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM69Q86WT6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM69Q86WT6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM69Q86WT6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM69Q86WT6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM69Q86WT6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM69Q86WT6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM69Q86WT6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM69Q86WT6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM69Q86WT6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM69Q86WT6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM69Q86WT6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM69Q86WT6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM69Q86WT6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM69Q86WT6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM69Q86WT6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM69Q86WT6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM69Q86WT6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM69Q86WT6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM69Q86WT6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM69Q86WT6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM69Q86WT6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM69Q86WT6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM69Q86WT6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM69Q86WT6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM69Q86WT6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM69Q86WT6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM69Q86WT6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM69Q86WT6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM69Q86WT6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM69Q86WT6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM69Q86WT6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM69Q86WT6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM69Q86WT6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM69Q86WT6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM69Q86WT6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM69Q86WT6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM69Q86WT6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM69Q86WT6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM69Q86WT6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM69Q86WT6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM69Q86WT6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM69Q86WT6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM69Q86WT6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM69Q86WT6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM69Q86WT6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM69Q86WT6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM69Q86WT6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM69Q86WT6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM69Q86WT6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM69Q86WT6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms