Protein–RNA interactions for Protein: Q86UG4

SLCO6A1, Solute carrier organic anion transporter family member 6A1, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO6A1Q86UG4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLCO6A1Q86UG4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLCO6A1Q86UG4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLCO6A1Q86UG4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLCO6A1Q86UG4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLCO6A1Q86UG4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLCO6A1Q86UG4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLCO6A1Q86UG4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLCO6A1Q86UG4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLCO6A1Q86UG4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLCO6A1Q86UG4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLCO6A1Q86UG4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLCO6A1Q86UG4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLCO6A1Q86UG4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLCO6A1Q86UG4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLCO6A1Q86UG4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLCO6A1Q86UG4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLCO6A1Q86UG4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLCO6A1Q86UG4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLCO6A1Q86UG4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLCO6A1Q86UG4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLCO6A1Q86UG4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLCO6A1Q86UG4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLCO6A1Q86UG4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SLCO6A1Q86UG4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLCO6A1Q86UG4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLCO6A1Q86UG4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLCO6A1Q86UG4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLCO6A1Q86UG4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLCO6A1Q86UG4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLCO6A1Q86UG4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLCO6A1Q86UG4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLCO6A1Q86UG4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLCO6A1Q86UG4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLCO6A1Q86UG4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLCO6A1Q86UG4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLCO6A1Q86UG4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SLCO6A1Q86UG4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLCO6A1Q86UG4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLCO6A1Q86UG4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLCO6A1Q86UG4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLCO6A1Q86UG4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLCO6A1Q86UG4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLCO6A1Q86UG4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLCO6A1Q86UG4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLCO6A1Q86UG4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLCO6A1Q86UG4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLCO6A1Q86UG4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLCO6A1Q86UG4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLCO6A1Q86UG4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLCO6A1Q86UG4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLCO6A1Q86UG4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SLCO6A1Q86UG4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLCO6A1Q86UG4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLCO6A1Q86UG4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLCO6A1Q86UG4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLCO6A1Q86UG4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLCO6A1Q86UG4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SLCO6A1Q86UG4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLCO6A1Q86UG4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLCO6A1Q86UG4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLCO6A1Q86UG4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLCO6A1Q86UG4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLCO6A1Q86UG4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLCO6A1Q86UG4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLCO6A1Q86UG4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SLCO6A1Q86UG4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SLCO6A1Q86UG4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SLCO6A1Q86UG4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLCO6A1Q86UG4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLCO6A1Q86UG4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLCO6A1Q86UG4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLCO6A1Q86UG4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SLCO6A1Q86UG4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLCO6A1Q86UG4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLCO6A1Q86UG4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLCO6A1Q86UG4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLCO6A1Q86UG4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLCO6A1Q86UG4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLCO6A1Q86UG4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLCO6A1Q86UG4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLCO6A1Q86UG4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLCO6A1Q86UG4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLCO6A1Q86UG4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLCO6A1Q86UG4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLCO6A1Q86UG4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SLCO6A1Q86UG4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLCO6A1Q86UG4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLCO6A1Q86UG4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLCO6A1Q86UG4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLCO6A1Q86UG4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLCO6A1Q86UG4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLCO6A1Q86UG4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLCO6A1Q86UG4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLCO6A1Q86UG4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLCO6A1Q86UG4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLCO6A1Q86UG4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLCO6A1Q86UG4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLCO6A1Q86UG4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLCO6A1Q86UG4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms