Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CXCL17Q6UXB2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CXCL17Q6UXB2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CXCL17Q6UXB2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CXCL17Q6UXB2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CXCL17Q6UXB2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CXCL17Q6UXB2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CXCL17Q6UXB2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CXCL17Q6UXB2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CXCL17Q6UXB2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CXCL17Q6UXB2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CXCL17Q6UXB2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CXCL17Q6UXB2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CXCL17Q6UXB2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CXCL17Q6UXB2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CXCL17Q6UXB2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CXCL17Q6UXB2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CXCL17Q6UXB2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CXCL17Q6UXB2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CXCL17Q6UXB2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CXCL17Q6UXB2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CXCL17Q6UXB2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CXCL17Q6UXB2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CXCL17Q6UXB2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CXCL17Q6UXB2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CXCL17Q6UXB2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CXCL17Q6UXB2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CXCL17Q6UXB2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CXCL17Q6UXB2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CXCL17Q6UXB2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CXCL17Q6UXB2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CXCL17Q6UXB2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CXCL17Q6UXB2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CXCL17Q6UXB2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CXCL17Q6UXB2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CXCL17Q6UXB2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CXCL17Q6UXB2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CXCL17Q6UXB2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CXCL17Q6UXB2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CXCL17Q6UXB2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CXCL17Q6UXB2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CXCL17Q6UXB2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CXCL17Q6UXB2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CXCL17Q6UXB2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CXCL17Q6UXB2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CXCL17Q6UXB2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CXCL17Q6UXB2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CXCL17Q6UXB2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CXCL17Q6UXB2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CXCL17Q6UXB2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CXCL17Q6UXB2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CXCL17Q6UXB2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CXCL17Q6UXB2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CXCL17Q6UXB2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CXCL17Q6UXB2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CXCL17Q6UXB2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CXCL17Q6UXB2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CXCL17Q6UXB2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CXCL17Q6UXB2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CXCL17Q6UXB2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CXCL17Q6UXB2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CXCL17Q6UXB2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CXCL17Q6UXB2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CXCL17Q6UXB2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CXCL17Q6UXB2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CXCL17Q6UXB2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CXCL17Q6UXB2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CXCL17Q6UXB2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CXCL17Q6UXB2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CXCL17Q6UXB2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CXCL17Q6UXB2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CXCL17Q6UXB2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CXCL17Q6UXB2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CXCL17Q6UXB2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CXCL17Q6UXB2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CXCL17Q6UXB2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CXCL17Q6UXB2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CXCL17Q6UXB2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CXCL17Q6UXB2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CXCL17Q6UXB2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CXCL17Q6UXB2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CXCL17Q6UXB2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CXCL17Q6UXB2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CXCL17Q6UXB2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CXCL17Q6UXB2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CXCL17Q6UXB2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CXCL17Q6UXB2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CXCL17Q6UXB2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CXCL17Q6UXB2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CXCL17Q6UXB2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CXCL17Q6UXB2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CXCL17Q6UXB2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CXCL17Q6UXB2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CXCL17Q6UXB2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CXCL17Q6UXB2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CXCL17Q6UXB2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CXCL17Q6UXB2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CXCL17Q6UXB2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CXCL17Q6UXB2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CXCL17Q6UXB2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms